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Comparative study of phenolic compounds in different Brazilian rice (Oryza sativa L.) genotypes

MIRA, Nadia Valeria Mussi de; MASSARETTO, Isabel Louro; PASCUAL, Cristina de Simone Carlos Iglesias; MARQUEZ, Ursula Maria Lanfer
Fonte: ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE Publicador: ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE
Tipo: Artigo de Revista Científica
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This study was conducted to evaluate the natural variability of total, extractable and non-extractable phenolics in pigmented and non-pigmented rice genotypes (Oryza sativa L.) and to estimate whether the contents and distribution of these compounds are typical for genotypes from indica and japonica subspecies. Twenty-one samples of commercial as well as new genotypes of brown rice, including seven pigmented genotypes were obtained from two Agronomic Institutes in South Brazil. Free and conjugated phenolics were extracted with ethanol, while bound phenolics were released by alkaline hydrolysis. Total phenolics were estimated in both fractions by the Folin-Ciocalteau method. Genotypes from Japonica and indica non-pigmented subspecies were not statistically distinguishable from each other, but differences in phenolic contents were associated with pericarp color. Despite individual differences, total phenolics were four times higher in pigmented than in non-pigmented genotypes (4246 and 1073 mg ferulic acid equiv. kg(-1), respectively). These high amounts were mostly due to the presence of extractable (free and conjugated) phenolics, which comprised up to 81% of total phenolics for pigmented genotypes. Non-extractable (bound) phenolics comprised 40% of total phenolics of non-pigmented rice genotypes while pigmented genotypes presented greater absolute amounts...

Hepatitis D and B virus genotypes in chronically infected patients from the Eastern Amazon Basin

GOMES-GOUVEA, Michele Soares; SOARES, Manoel do Carmo Pereira; MELLO, Isabel Maria Vicente Guedes de Carvalho; BRITO, Elisabete Maria Figueiredo; MOIA, Lizomar de Jesus Maues Pereira; BENSABATH, Gilberta; NUNES, Heloisa Marceliano; CARRILHO, Flair Jose; P
Fonte: ELSEVIER SCIENCE BV Publicador: ELSEVIER SCIENCE BV
Tipo: Artigo de Revista Científica
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36.59%
Hepatitis D virus (HDV) is a defective hepatotropic virus whose infectivity is dependent on hepatitis B virus (HBV). HDV super- or co-infiection leads to an increased risk of fulminant hepatitis or progression to severe chronic liver disease in HBV infected patients. The Brazilian Amazon Basin has been reported to be endemic for HBV and HDV, especially in the Western Amazon Basin. In this region, HDV infection is frequently associated with acute fulminant hepatitis with characteristic histologic features. HDV is classified into seven major clades (HDV-1 to HDV-7) and HBV is subdivided into eight genotypes (A-H). HDV and HBV genotypes have been shown to have a distinct geographic distribution. The aim of this study was to determine the HBV and HDV genotypes harbored by chronically infected patients from the Eastern Amazon Basin, Brazil. We studied 17 serum samples from HBV and HDV chronically infected patients admitted to a large public hospital (Santa Casa de Misericordia) at Belem, state of Para, Brazil, between 1994 and 2002. HDV-3 and HBV genotype A (subtype adw2) have been identified in all cases, in contrast to previous studies from other regions of the Amazon, where HBV genotype F has been found co-infecting patients that harbored HDV-3. The HDV-3/HBV-A co-infection suggests that there is not a specific interaction between HBV and HDV genotypes...

Genetic diversity among Toxoplasma gondii isolates of small ruminants from Brazil: Novel genotypes revealed

RAGOZO, Alessandra M. A.; PENA, Hilda F. J.; YAI, Lucia E. O.; SU, C.; GENNARI, Solange M.
Fonte: ELSEVIER SCIENCE BV Publicador: ELSEVIER SCIENCE BV
Tipo: Artigo de Revista Científica
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36.62%
Recent studies indicated that Toxoplasma gondii isolates of many domestic animal hosts from Brazil are genetically and biologically different from those in USA and Europe. Despite of high pathogenicity of this parasite to small ruminants, the epidemiology and genetic diversity of T. gondii in these animals are not well understood in Brazil. In this study, a total of 28 T. gondii samples (16 isolates from sheep in Sao Paulo state, and 12 isolates from goats in the states of Sao Paulo and Rio Grande do Norte) were genotyped using genetic markers SAG1, SAG2, SAG3, BTUB, CRAG, c22-8, c29-2, L358, PK1, Apico and CS3. Eleven genotypes were identified from these T. gondii isolates. Eight isolates (4 from sheep and 4 from goats) were grouped into the common clonal type Brl lineage. One sheep isolate was grouped to the type BrIII lineage. Five isolates grouped to three previously identified genotypes in Brazil, and 13 isolates grouped to six novel genotypes. Mixed genotype was found in one isolate from goat in Sao Paulo. No classical clonal Type I. II or III isolates were found, confirming previous reports that these clonal lineages are rare in Brazil. The allele types at the CS3 locus are strongly linked to mouse virulence of the parasite. The results of this study indicate that even though a large number of T. gondii genotypes have been identified from a variety of animal hosts in Brazil...

Quantification of Porphyromonas gingivalis and fimA genotypes in smoker chronic periodontitis

TEIXEIRA, Silvia R. L.; MATTARAZO, Flavia; FERES, Magda; FIGUEIREDO, Luciene C.; FAVERI, Marcelo de; SIMIONATO, Maria R. L.; MAYER, Marcia P. A.
Fonte: WILEY-BLACKWELL PUBLISHING, INC Publicador: WILEY-BLACKWELL PUBLISHING, INC
Tipo: Artigo de Revista Científica
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36.64%
Teixeira SRL, Mattarazo F, Feres M, Figueiredo LC, de Faveri M, Simionato MRL, Mayer MPA. Quantification of Porphyromonas gingivalis and fimA genotypes in smoker chronic periodontitis. J Clin Periodontol 2009; 36: 482-487. doi: 10.1111/j.1600-051X.2009.01411.x. Porphyromonas gingivalis fimA genotypes were associated with virulence factors in vitro, but little evidence of an association with disease severity were shown in humans. We aimed to correlate levels of P. gingivalis fimA genotypes II and IV and probing depth in smoker-chronic periodontitis subjects. One hundred and sixty eight subgingival samples of 20 smokers non-treated chronic periodontitis subjects obtained from sites with different probing depths [shallow (<= 3 mm), intermediate (4-6 mm), deep (>= 7 mm)] were analysed by real-time PCR for P. gingivalis and genotypes fimA II and IV. P. gingivalis and fimA IV were detected in all subjects, whereas fimA II was detected in 18 subjects (90%). One hundred and fifty two sites (90.5%) harboured P. gingivalis. Genotypes II and IV were detected in 28% and 69.6% of sites, respectively. The proportions of genotypes II and IV in relation to P. gingivalis levels were similar in shallow, intermediate and deep probing sites (2.4%, 4.6%...

Emprego do conceito de medidas repetidas na avaliação do desempenho de genótipos de frangos de corte. ; Employment of the concept of repeated measures in the evaluation on performance of broiler chicken genotypes.

Rosário, Millor Fernandes do
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 11/12/2003 PT
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36.72%
O experimento teve por objetivo avaliar genótipos de frangos de corte através do desempenho zootécnico utilizando-se o conceito de medidas repetidas e avaliar os mesmos genótipos a partir de suas características de carcaça. Os tratamentos consistiram de quatro genótipos, dois sexos e seis idades para avaliar o desempenho zootécnico e as características de carcaça foram avaliadas aos 42 dias. As variáveis de desempenho zootécnico foram: consumo médio de alimento (CONS), peso médio vivo (PMV), conversão alimentar (CA), ganho médio diário de peso (GMDP), viabilidade (VIAB) e fator europeu de eficiência produtiva (FEEP) e de características de carcaça foram: rendimento de carcaça (CARPV), rendimento de peito (PTPV) e de pernas (PRPV) em relação ao peso vivo e rendimento de peito (PTCAR) e de pernas (PRCAR) em relação ao peso de carcaça. O delineamento experimental para o desempenho zootécnico foi em blocos incompletos desbalanceados, em um esquema fatorial 4x2x6, considerando-se o box com 40 aves a unidade experimental e a análise foi realizada nos procedimentos GLM e MIXED, sendo neste último testadas cinco estruturas de variância e covariância, escolhendo-se a que apresentou menor valor para o Critério de Informação de Akaike; para as características de carcaça foi em blocos incompletos desbalanceados...

Teste estatístico para contribuição de genótipos e ambientes na matriz de interação GE; Statistical test for contribution in the interaction matrix of genotypes and environments

Araújo, Mirian Fernandes Carvalho
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 21/07/2008 PT
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O presente trabalho teve por objetivos propor um método para testar a contribuição de cada genótipo e ambiente para a interação genótipos X ambientes em ensaios multi-ambientais através de um teste F e implementar uma rotina computacional para a realização da análise de dados segundo o teste proposto. O estudo avalia quatro conjuntos de dados, cada um com diferentes números de genótipos dentro de ambientes com quatro blocos. Para um dos conjuntos, simulou-se as somas de quadrados das linhas (genótipos) e colunas (ambientes) da matriz de interação genótipos X ambientes (GE) gerando 500, 5000 e 10000 experimentos para verificar a distribuição empírica. Os resultados indicaram um ajuste à distribuição qui-quadrado não-central para as linhas e colunas da matriz de interação GE, verificados também pelo teste de Kolmogorov-Smirnov e o gráfico QQplot. Na aplicação do teste F proposto aos quatro conjuntos de dados, identificou-se os genótipos e ambientes que contribuiram mais para a interação genótipos X ambientes. Dessa forma, os melhoristas podem selecionar bons genótipos e ambientes nos seus estudos.; The objective of the present work was to propose a method for testing the con- tribution of each element in a genotypes X environments interaction using multi-environment analyses by means of an F test and implementation of a computational routine to analyze the data according to the test proposed. The study evaluated four data sets...

Interação genótipos x locais em cana-de-açúcar e perspectivas de estratificação ambiental; Genotypes by locations interaction in sugarcane and perspectives of environmental stratification

Santos, Éder Gustavo Dias dos
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 28/08/2008 PT
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Este estudo foi realizado com base nos resultados experimentais relativos a genótipos RB da Série 92 do Programa de Melhoramento Genético da Cana-de-Açúcar da Universidade Federal de São Carlos (PMGCA UFSCar), tendo como finalidade avaliar a representatividade dos locais que compõe sua rede experimental. Para isso foram avaliados os caracteres Toneladas de colmo por hectare (TCH), Pol % da cana (PC) e Toneladas de Pol por hectare (TPH) de 15 genótipos em 13 locais, sendo estes locais referentes às Usinas : Santa Fé, Santa Luiza, Santa Terezinha, São Martinho, Cocal, Bonfim, Santa Elisa - 1, Cruz Alta, Iturama, Aralco, Lucélia, Sonora e Santa Elisa - 2. A partir das análises de variância individuais e conjuntas, foram realizados testes de agrupamento baseado na metodologia de Lin, que se baseia no quadrado da distancia euclidiana para agrupar locais que apresentem similaridade nas respostas dos genótipos; entretanto, com dois critérios de significâncias para a interação genótipos x locais, tais como: p 0,05 (original) e p 0,30 (modificada), para os três caracteres avaliados. A metodologia de Lin original (p 0,05) mostrou ser pouco confiável, podendo possibilitar o agrupamento de locais com valores de quadrados médios da interação genótipos x locais muito próximos da significância. Já a metodologia de Lin modificada mostrou ser mais confiável...

Avaliação de genótipos de mamona (Ricinus communis L.) em cruzamentos dialélicos parciais; Evaluation of castor (Ricinus communis L.) genotypes in partial diallel crosses

Nóbrega, Márcia Barreto de Medeiros
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 26/08/2008 PT
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A mamona é uma cultura importante no nordeste brasileiro há muito tempo e é característica de pequenos produtores que utilizam mão de obra familiar. Devido a isso, a maioria deles não utiliza ainda cultivares melhorados e até o momento poucos cultivares de mamona foram liberados pelos programas de melhoramento. Nos últimos anos a cultura da mamona tornou-se importante também em outras regiões do Brasil, devido à importância que adquiriu o óleo extraído das suas sementes para a produção de biodiesel. O objetivo deste trabalho compreende a estimação de parâmetros genéticos e fenotípicos relacionados à produção e caracteres agronômicos de mamona, visando ao entendimento do controle genético de tais caracteres para fins de melhoramento. Para isso utilizou-se 10 genótipos de mamona, divididos em dois grupos: Grupo 1, composto de cinco genótipos de porte baixo, e, Grupo 2, composto de cinco genótipos de porte alto, que foram cruzados segundo um arranjo dialélico parcial, originando 25 cruzamentos. Os 25 tratamentos foram avaliados experimentalmente no ano agrícola de 2005/6 na área experimental do Departamento de Genética da ESALQ/USP, em um delineamento em látice 5 x 5 com quatro repetições e parcelas lineares de 9 metros...

Progressos em caracteres agronômicos de linhagens de aveia branca no Sudoeste Paulista; Progress in white oat genotypes agronomic characters in the Southwest region of São Paulo State

Ito, Marcio Akira
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 27/03/2009 PT
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Com o objetivo de avaliar as características produtivas e a severidade de doenças de linhagens avançadas de aveia branca, provenientes de cruzamentos controlados do programa de melhoramento de aveia da APTA, visando à seleção de materiais com qualidades agronômicas superiores para o Estado de São Paulo, foram realizados experimentos no Pólo Regional de Desenvolvimento Tecnológico dos Agronegócios do Sudoeste Paulista, em Capão Bonito, nas safras de inverno de 2004 a 2007. Foram avaliados vinte genótipos (IAC-7, CB990107, CB990318, CB990321, CB990324, CB990434, CB990436, CB9952115, CB9958126, CB9958128, CB9960132, CB9962152, CB9968160, CB9968162, CB9968165, CB9968167, CB9924172, CB9930177, CB9967184 e CB9967185) de aveia branca (Avena sativa L.) em relação ao estande, altura de plantas, produtividade e severidade de doenças. O delineamento experimental foi o de blocos ao acaso, com vinte tratamentos e três repetições. Cada parcela experimental foi constituída por quatro linhas de três metros de comprimento, espaçadas de 0,20m, sendo consideradas como área útil, para realização das avaliações, as duas linhas centrais. Houve diferenças significativas entre os genótipos em relação a todos os caracteres avaliados...

Ocorrência e caracterização de genotipos de rotavírus a partir de material fecal de leitões com diarréia, provenientes de diversas propriedades de criação de suínos, localizadas no Estado de São Paulo; Occurrence and characterization of rotavirus genotypes from fecal material of diarrheic piglets, from many swine-producing units in São Paulo State, Brazil

Gregori, Fábio
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 12/08/2003 PT
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36.71%
Um total de 144 amostras fecais colhidas de leitões com diarréia provenientes de diversas granjas distribuídas por 10 municípios do Estado de São Paulo, Brasil, foram examinadas para a presença de rotavírus através de eletroforese em gel de poliacrilamida e ELISA, num esquema de triagem em paralelo. Destas, 24 e 39 amostras foram, respectivamente, positivas por estes testes e a caracterização dos genotipos P e G foi realizada em 43 amostras por nested RT-PCR, usando diferentes conjuntos de primers. Utilizando-se primers animais, o genotipo P[6] foi o mais freqüente, detectado em 25,58% das amostras, seguido pelo P[1] (11,62%) e P[7] (9,3%). Infecção concomitante de genotipos P[6]+P[7] (9,3%), P[1]+P[6] (4,65%), P[1]+P[6]+P[7] (2,32%) foi também observada. O genotipo G[5] foi o mais freqüente, detectado em 30,23% das amostras, seguido pelo G[10] (20,93%) e G[6] (4,65%). Infecção concomitante de genotipos G[5]+G[10] (18,6%) foi também observada. Utilizando-se primers humanos, somente o genotipo P[6] (65,11%) foi encontrado. Foram detectados os genotipos G[4] (27,9%), G[3] (13,95%) nas amostras, e as infecções concomitantes G[3]+G[4] (9,3%), G[2]+G[3]+G[4] (4,65%) e G[2]+G[3] (2,32%). A combinação mais freqüente foi G[5]P[6] e G[4]P[6]...

Resistência de genótipos de citros a lagarta-minadora-dos-citros Phyllocnistis citrella Stainton, 1856 (Lepidoptera: Gracillariidae); Resistance of citrus genotypes to the Citrus leafminer Phyllocnistis citrella Stainton, 1856 (Lepidoptera: Gracillariidae)

Santos, Mônica Silva
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 14/05/2009 PT
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36.68%
Avaliou-se o efeito de diferentes cultivares, híbridos e gêneros afins de Citrus sobre o comportamento e biologia da lagarta minadora-dos-citros (LMC) Phyllocnistis citrella e o efeito do inseto sobre alguns destes materiais com a finalidade de encontrar, dentre os materiais testados, genótipos resistentes que afetem o comportamento de alimentação e de oviposição, e/ou a biologia da LMC, assim como genótipos que sejam menos danificados por P. citrella. Para a criação de manutenção de P. citrella, em laboratório, utilizaram-se gaiolas e como planta hospedeira, mudas de limão Cravo (Citrus limonia L. Osbeck). Inicialmente, foi feito o screening com 23 genótipos de citros por meio da exposição de mudas destas plantas a adultos da praga. Como padrão suscetível utilizou-se o limão Rugoso (C. jambhiri). Com base no número de ovos e de pupas encontrados em cada planta, cinco genótipos mostraram-se mais promissores: tangerina Sunki (Citrus sunki Hort. ex. Tanaka), os híbridos C x R4 (C. sunki x Poncirus trifoliata), C x R315 (C. sunki x P. trifoliata ), M x P222 (C. sinensis x Tangor Murcott) e o gênero afim Trifoliata Limeira (P. trifoliata ). A seguir, avaliou-se a preferência para oviposição, o desenvolvimento e a reprodução dos insetos criados nestes seis genótipos. No teste de preferência para oviposição com chance de escolha o híbrido C x R315 e o gênero afim Trifoliata Limeira foram os genótipos menos preferidos pela LMC...

Suscetibilidade dos genótipos diplóides e tetraplóides de azevém (Lolium multiflorum Lam.) ao herbicida glyphosate; Susceptibility of diploid and tetraploid genotypes of Italian ryegrass (Lolium multiflorum Lam.) to the herbicide glyphosate

Dors, Celso Antonio
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 30/07/2009 PT
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36.64%
Genótipos de azevém (Lolium multiflorum Lam.) diplóides e tetraplóides são cultivados como forrageira na produção animal, no entanto, quando sistemas de produção que envolve o plantio direto são estabelecidos após o cultivo da forrageira é comum a dessecação com o herbicida glyphosate. Portanto, é importante conhecer se existe suscetibilidade diferencial a este herbicida entre os genótipos. Desta forma, foi desenvolvida a presente pesquisa como o objetivo de avaliar o grau de tolerância dos genótipos diplóides e tetraplóides de azevém ao herbicida glyphosate em quatro estádios fenológicos de desenvolvimento. Para isso, foram instalados quatro experimentos, sendo um para cada estádio fenológico do azevém (duas folhas, quatro perfilhos, pré-florescimento e formação de grãos). Os tratamentos consistiram da combinação dos dois genótipos e seis doses do herbicida glyphosate (240; 480; 960; 1.920; 3.840 e 7.680 g e.a. ha-1), e uma testemunha sem aplicação de glyphosate, em delineamento experimental de blocos ao acaso, quatro repetições. Os parâmetros analisados foram porcentagem de controle e fitomassa seca das plantas. Os resultados foram submetidos à análise de variância e em seguida ajustados para modelo de curva de dose-resposta do tipo logística...

Carotenoid analysis of Cassava genotypes roots (Manihot Esculenta Crantz) cultivated in Southern Brazil using chemometric tools

Moresco, Rodolfo; Uarrota, Virgílio Gavicho; Pereira, Aline; Tomazzoli, M. M.; Nunes, Eduardo da Costa; Peruch, Luiz Augusto Martins; Costa, Christopher; Rocha, Miguel; Maraschin, Marcelo
Fonte: Springer Publicador: Springer
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em //2015 ENG
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36.62%
Manihot esculenta roots rich in -carotene are an important staple food for populations with risk of vitamin A deficiency. Cassava genotypes with high pro-vitamin A activity have been identified as a strategy to reduce the prevalence of deficiency of this vitamin, In this study, the metabolomics characterization focusing on the carotenoid composition of ten cassava genotypes cultivated in southern Brazil by UV-visible scanning spectrophotometry and reverse phase-high performance liquid chromatography was performed. The data set was used for the construction of a descriptive model by chemometric analysis. The genotypes of yellow roots were clustered by the higher concentrations of cis--carotene and lutein. Inversely, cream roots genotypes were grouped precisely due to their lower concentrations of these pigments, as samples rich in lycopene differed among the studied genotypes. The analytical approach (UV-Vis, HPLC, and chemometrics) used showed to be efficient for understanding the chemodiversity of cassava genotypes, allowing to classify them according to important features for human health and nutrition.

Circulation of human papillomavirus (HPV) genotypes in women from Córdoba, Argentina, with squamous intraepithelial lesions

Venezuela,Raul Fernando; Kiguen,Ana Ximena; Frutos,Maria Celia; Cuffini,Cecilia Gabriela
Fonte: Instituto de Medicina Tropical Publicador: Instituto de Medicina Tropical
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/02/2012 EN
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36.62%
Human papillomavirus (HPV) can induce a wide spectrum of squamous intraepithelial lesions (SIL) of varying severity. The aim of the present study was to establish the frequency of HPV infection and identify the genotypes circulating in women from Córdoba, Argentina, in relation to age and cytology. A total of 186 women, between 18 and 65 years old, with antecedents of SIL, underwent a pelvic examination and had cervical cells collected for cytology and HPV DNA detection. Ninety-six samples (51.6%) were positive for HPV detection, and sixty-three (65.6%) of them showed the presence of at least one HR-HPV. Low- and high-grade SIL showed significant association in patients younger than 35 years of age. We found 18 different genotypes, with a greater presence of HR-HPV. Genotypes 16 and 6 were the most frequent. Seven (7.3%) multiple infections, 85.7% of which had at least one HR-HPV, were detected. The detection of a large number of different HPV genotypes is a warning sign. It is thus necessary to strengthen the monitoring of the circulation of high-risk genotypes, currently less prevalent in intraepithelial lesions, as a control measure for the possible impact of the implementation of vaccines against genotypes 16 and 18.

G and P rotavirus genotypes in stool samples from children in Teresina, State of Piauí

Macedo,Carla Isabel; Christofoletti,Alice; Munford,Veridiana; Rácz,Maria Lúcia
Fonte: Sociedade Brasileira de Medicina Tropical - SBMT Publicador: Sociedade Brasileira de Medicina Tropical - SBMT
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/08/2007 EN
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36.59%
A total of 123 stool specimens collected in Teresina, Piauí between 1994 and 1996, from 0 to 2-year-old children with diarrhea, were used for this study. Molecular characterization of the G and P rotavirus genotypes was performed using the reverse transcriptase polymerase chain reaction. The following results were obtained for the P genotypes: P[8] (17. 1%), P[1] (4. 9%), P[4] (3. 3%), P[6, M37] (2. 4%) and mixtures (27. 6%). The P[1]+P[8] mixture was found in 19. 5% of the samples. For the G genotypes, the results were: G1 (25. 2%), G5 (13. 8%), G2 (2. 5%), G4 (2. 5%), G9 (0. 8%) and mixtures (41. 5%). G1+G5 was the mixture most frequently found (12. 1%). Our results showed unusual combinations such as P[1]G5 and P[1]+P[8]G5. The high percentage of mixtures and unusual combinations containing mixtures of human and animal rotavirus genotypes strongly suggests the possibility of gene reassortment and interspecies transmission.

HCMV gB genotypes in cervical secretion and placenta tissues in the state of Espírito Santo, Southeastearn Brazil

Spano,Liliana Cruz; Ferreira,Mônica Simões Rocha; Almeida,Marilda Santos; Nascimento,Jussara Pereira do; Leite,José Paulo Gagliardi
Fonte: Sociedade Brasileira de Microbiologia Publicador: Sociedade Brasileira de Microbiologia
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/09/2007 EN
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36.62%
Human cytomegalovirus (HCMV) displays genetic variability in several regions, supposed to be related with strain-specific tissue tropism and immunopathogenesis. Based on sequence variation in the UL55 gene that encodes gB glycoprotein, HCMV strains can be assigned to one of four genotypes. Previous studies have addressed gB genotyping mostly by investigating strains derived from immunosuppressed patients, sometimes without previous knowledge about genotype distribution in a geographic area. The present study verified the distribution of HCMV gB genotypes of strains obtained from immunocompetent women at Vitória City, Espírito Santo State, Southeastern, Brazil. The HCMV genome was extracted from their cervical secretion, fetal and maternal placenta tissues (chorionic villous and decidua) from abortion cases and from white blood cells (WBCs). HCMV genotyping was performed by restriction fragment length polymorphism analyses of amplified product from the high variability site of the UL55 gene. All four genotypes were observed in both cervical secretion and placenta, whereas in WBCs a single gB1 genotype was detected. HCMV gB1 and gB2 genotypes were detected, respectively, in nine and in six of the 23 studied samples, while gB3 and gB4 were each found in four separate samples of the total. The differences in genotype frequency were not considered statistically significant. No mixed genotype infection was observed. The results indicated that the four gB HCMV genotypes had no particular tropism for placenta tissues and that all genotypes circulated within immunocompetent women at the time and in the region of study.

Prevalence of genotypes in Helicobacter pylori isolates from patients in eastern Turkey and the association of these genotypes with clinical outcome

Ozbey,Gokben; Aygun,Cem
Fonte: Sociedade Brasileira de Microbiologia Publicador: Sociedade Brasileira de Microbiologia
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/12/2012 EN
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36.66%
There is not much information available regarding the prevalence of the genotypes of Helicobacter pylori isolates in Turkey, particularly in eastern Turkey. The aims of this study were to detect the prevalence of different genotypes of H. pylori in Turkish patients with gastrointestinal complaints and to determine the relationship of these genotypes with clinical outcome and sex. One hundred forty H. pylori isolates were examined for the presence of its genotypes by the PCR. We found that the prevalence of vacA s1, vacA s2, cagA, cagE, iceA1, iceA2 and babA2 genes were 88.6%, 11.4%, 71.4%, 35.7%, 41.4%, 58.6%, and 62.1%, respectively. The most predominant vacA subtype was s1a (81.4%). The most vacA allelic combination detected were vacA s1m1 (65.2%)and s1m2 (53.9%) in patients with peptic ulcer and gastritis, respectively. The only vacA s1 isolate was significantly associated with gastritis and peptic ulcer (p<0.05). The vacA s1a, ml, slml and babA2 genes were significantly associated with peptic ulcer (p<0.05), whereas m2 gene was significantly associated with only gastritis (p<0.05). The difference between sex and genotypes was statistically significant among the cagA, vacA s1, iceA2 and babA2 genes. This study reported for the first time the prevalence of H. pylori genotypes in patients with gastrointestinal complaints in eastern Turkey. Further studies are needed to understand epidemiological importance of the genotypes of H. pylori isolates in this region and the association between the virulence genes and clinical outcome in different regions.

Indução da maturação por produtos químicos e sua conseqüência na qualidade tecnológica de diferentes genótipos de cana-de-açúcar; Ripening induction by chemical products and its consequence in the technological quality of different sugarcane genotypes

Caputo, Marina Maitto
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 22/02/2006 PT
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O emprego de reguladores vegetais como maturadores da cana-de-açúcar tem sido uma prática bem utilizada, em virtude da necessidade de antecipação da colheita e da otimização do planejamento agrícola. Contudo, com a freqüente disponibilidade de genótipos de cana-de-açúcar pelos programas de melhoramento, pouca informação se tem das interações entre novos genótipos e produtos sobre a qualidade tecnológica. Este estudo objetivou determinar a resposta de sete genótipos de cana-de-açúcar à aplicação de dois reguladores vegetais quanto à influência na qualidade da matéria prima. O ensaio foi instalado em março de 2004 e conduzido na APTA Regional Centro-Oeste, Jaú (SP). O delineamento experimental foi o de blocos casualizados, em parcelas sub-divididas, com quatro repetições, constituído pela combinação dos genótipos IAC87-3396, IAC87-3410, IAC89-3124, IAC91-2195, IAC91-5155, PO88-62 e SP80-1842, e de três manejos de condução da maturação sulfometuron metil, 20 g p. c. ha-1; etefon, 2,0 l p. c. ha-1 e testemunha. A qualidade tecnológica foi determinada através dos atributos Brix no caldo, pol no caldo, pureza do caldo, fibra da cana, pol na cana, açúcares redutores no caldo, açúcares redutores na cana e açúcar total recuperável (ATR) aos 0...

Circulación de genotipos de virus papiloma humano (VPH) en mujeres con lesiones intrepiteliales escamosas de Córdoba, Argentina; Circulation of human papillomavirus (HPV) genotypes in women from Córdoba, Argentina, with squamous intraepithelial lesions

Venezuela, Raul Fernando; Kiguen, Ana Ximena; Frutos, Maria Celia; Cuffini, Cecilia Gabriela
Fonte: Universidade de São Paulo. Instituto de Medicina Tropical de São Paulo Publicador: Universidade de São Paulo. Instituto de Medicina Tropical de São Paulo
Tipo: info:eu-repo/semantics/article; info:eu-repo/semantics/publishedVersion; ; ; ; ; Formato: application/pdf
Publicado em 01/02/2012 ENG
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El papilomavirus humano (human papilloma, HPV) induce un amplio espectro de lesiones intraepiteliales escamosas (SIL) de variada severidad. Objetivo: conocer la frecuencia de infección por HPV y determinar los genotipos circulantes en mujeres de la ciudad de Córdoba, Argentina, en relación con la edad y la citología. Se realizó citología y detección de ADN-HPV en células cervicales de 186 mujeres de 18 a 65 años con antecedentes de SIL. Noventa y seis (51.6%) fueron positivas para la detección del HPV, de las cuales, en 63 (65.6%) se detectó la presencia de al menos, un HPV de Alto Riesgo (HR-HPV). Las SIL de alto grado (HSIL) y de bajo grado (LSIL) se asociaron a pacientes menores de 35 años. Se hallaron 18 genotipos diferentes, con mayor presencia de HR-HPV. HPV 16 y 6 fueron más frecuentes y se detectaron 7 (7.3%) infecciones múltiples, 85.7% de éstas presentaron al menos un HR-HPV. La detección de un alto número de diferentes genotipos es una señal de alerta. Por tanto, es necesario fortalecer la vigilancia de los HR-HPV, actualmente menos frecuentes en las SIL, como medida de control del impacto que tendrá la implementación de las vacunas contra HPV 16 y 18.; Human papillomavirus (HPV) can induce a wide spectrum of squamous intraepithelial lesions (SIL) of varying severity. The aim of the present study was to establish the frequency of HPV infection and identify the genotypes circulating in women from Córdoba...

Ruminal digestion and chemical composition of new genotypes of buffelgrass (cenchrus ciliaris l.)

García Dessommes,Guillermo Juan; Ramírez Lozano,Roque Gonzalo; Foroughbackhch P.,Rahim; Morales Rodríguez,Rocío; García Díaz,Graciela
Fonte: ASOCIACIÓN INTERCIENCIA Publicador: ASOCIACIÓN INTERCIENCIA
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/04/2003 EN
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This study evaluates and compares the dry matter production (TDM), chemical composition and effective degradability of dry matter (EDDM), crude protein (EDCP) and neutral detergent fiber (EDNDF) of the Nueces hybrid and five new genotypes of buffelgrass growing in Northeastern Mexico. Potential intake of minerals by cattle consuming the new genotypes was also estimated. All grasses were established in a completely randomized design with three replicates in a rain fed experiment. Plants were hand harvested on Nov. 14, 2000 at Nuevo Leon, Mexico. TDM was not significantly different among genotypes. Crude protein content and cell wall and its components (cellulose, hemicellulose, and lignin) were significantly different among grasses. Also, EDDM, EDCP, and EDNDF were significantly different among the buffelgrass genotypes. The Nueces hybrid had the highest degradability values; in contrast, PI 2 had the lowest values. It seems that high lignin content in new genotypes may negatively influence nutrient digestion in the rumen of sheep. Only the K, Fe and Co contained in all grasses would be sufficient to meet the requirements of grazing cattle. Data of dry matter production and nutritional dynamics, suggest that the new genotypes PI 1 and PI 4 could be considered as good substitutes of the Nueces hybrid for grazing ruminants in northeastern Mexico.