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Theoretical chemistry: current applications to photochemistry and thermochemistry

Ornellas, Fernando R.
Fonte: SPRINGER; NEW YORK Publicador: SPRINGER; NEW YORK
Tipo: Artigo de Revista Científica
ENG
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56.18%
A historical perspective is given contrasting challenges and advances in theoretical chemistry at the time the first issue of Theoretical Chemistry Accounts appeared in 1962 and the progress achieved since then as expressed in current state-of-the-art applications in photochemistry and thermochemistry.

Estudo teórico e experimental de estruturas supramoleculares obtidas com clusters trinucleares de rutênio e porfirinas; Theoretical and experimental study on supramolecular structures obtained with trinuclear ruthenium clusters and porphyrins

Formiga, André Luiz Barboza
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 05/09/2005 PT
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46.12%
A química supramolecular de porfirinas e clusters trinucleares de rutênio foi investigada sob o ponto de vista teórico-experimental. Através do desenvolvimento de uma nova metodologia baseada em ferramentas teóricas, as propriedades desses sistemas puderam ser explicadas à luz da mecânica quântica, revelando os mecanismos eletrônicos envolvidos na modificação das propriedades dos anéis porfirínicos pelos compostos de coordenação. As geometrias, a dinâmica e as estruturas eletrônicas desses sistemas foram obtidas através do desenvolvimento de novos parâmetros para campos de força empíricos, e da utilização de métodos semi-empíricos e ab initio. Essas foram utilizadas para interpretar as propriedades físico-químicas dos mesmos, como por exemplo a associação intermolecular em solução e na forma de filmes finos obtidos sobre superfícies não rugosas. O estudo teórico detalhado das estruturas eletrônicas dessas espécies comprovou que a influência supramolecular dos compostos de coordenação se dá através de orbitais de simetria π, representando o principal mecanismo de ativação de anéis porfirínicos por compostos de coordenação. Essa ativação diferenciada pôde ser evidenciada experimentalmente pela aplicação dessas espécies em células fotoeletroquímicas e em sistemas de catálise com atividade citocromo P-450.; The supramolecular chemistry of porphyrins and trinuclear ruthenium clusters has been investigated by a theoretical-experimental approach. Through the development of a new methodology based on theoretical tools...

Estudo teórico da reação O(3P) + HBr: superfícies de energia potencial, cinética e dinâmica; Theoretical study of the O(3P) + HBr reaction: potential energy surfaces, knetics and dynamics

Oliveira Filho, Antonio Gustavo Sampaio de
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 01/02/2013 PT
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46.08%
Neste trabalho, a reação O(3P) + HBr → OH + Br, que se insere no contexto da química atmosférica, mais especificamente nos ciclos de destruição catalítica do ozônio, foi estudada empregando superfícies de energia potencial ab initio de alta qualidade. Construímos superfícies para os estados eletrônicos 3A" e 3A', baseadas na expansão de muitos corpos, com potenciais de dois corpos ajustados por funções "switched-MLJ" e potenciais de três corpos interpolados utilizando o método RKHS. Os pontos ab initio utilizados foram obtidos no nível de teoria MRCISD+Q/CBS+SO. A superfície final para o estado eletrônico 3A" foi corrigida por um fator multiplicativo de modo que reproduzisse cálculos benchmark para a altura de barreira, em que foram considerados efeitos relativísticos (escalares e spin-órbita), correlação caroço-valência e correlação de ordem alta (excitações triplas e quádruplas). As principais características da SEP 3A" são dois mínimos de van der Walls no canal de entrada e saída e um estado de transição com uma barreira energética de 5,01 kcal mol-1. A SEP 3A' tem um estado de transição linear em 6,45 kcal mol-1. O valor obtido para a entalpia de reação, a 0 K, foi de -15,7 kcal mol-1...

Estratégias de comunicação em química como índices epistemológicos: análise semiótica das ilustrações presentes em livros didáticos ao longo do século XX; Communication strategies in chemistry as epistemological indexes: semiotic analysis of textbook images throughout the 20th century

Souza, Karina Aparecida de Freitas Dias de
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 22/11/2012 PT
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36.17%
O presente trabalho insere-se no contexto de algumas convicções, aqui destacadas com vistas à compreensão dos objetivos e estratégias metodológicas: (i) no processo de construção do conhecimento científico, o acesso à realidade da Natureza só é possível se mediado pelos resultados das interações que com ela estabelecemos; (ii) a interpretação de tais resultados levam a construtos teóricos e linguísticos; (iii) tais construtos não correspondem à realidade em sua totalidade, uma vez que se tratam de interpretações possíveis e limitadas pelas interações estabelecidas; (iv) a explicitação das relações entre realidade - interação - interpretação - representação é essencial ao processo de educação em ciências que se pretenda emancipatório e formador de indivíduos críticos, uma vez que permite extrapolar os limites do ensino conteudista. Tais relações ganham especial destaque no ensino de química, dado o papel essencial desempenhado pelos modelos e representações tanto no processo de construção do conhecimento químico quanto de sua comunicação. Apesar disso, extensa busca na literatura levou a diferentes tentativas de descrição da atividade química e do ensino dessa ciência que não contemplam satisfatoriamente as relações entre realidade...

Estudo teórico de compostos de selênio: aspectos estruturais, energéticos, espectroscópicos e cinéticos; Theoretical study of selenium compounds: structural, energetics, spectroscopic, and kinetics aspects

Hermoso, Willian
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 18/04/2013 PT
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36.15%
A química do selênio é um assunto de crescente interesse devido a sua presença em diversos ambientes químicos, em particular, na atmosfera terrestre. A ausência de estudos sobre espécies relativamente simples contendo 2-4 átomos motivou este projeto, que se concentrou na investigação teórica rigorosa de uma serie de espécies moleculares: SeF, SeCl, SeBr, HSeF, HFSe, HSeCl, HClSe, HSeBr, HBrSe e de vários isômeros na superfície de energia potencial 1[H, S, Se, Cl]. Propriedades espectroscópicas de um conjunto de estados eletrônicos e o calor de formação das moléculas SeF, SeCl e SeBr foram determinados. Juntamente com os novos resultados desta investigação, sugerimos uma revisão e correção de alguns dados teóricos e experimentais da literatura. Aspectos energéticos, estruturais e espectroscópicos associados aos pontos estacionários nas superfícies de energia potencial singleto [H, Se, X], X = F, Cl e Br, e [H, S, Se, Cl] também foram caracterizados, assim como determinados os calores de formação dos isômeros mais estáveis. Barreiras energéticas para os vários processos de isomerização foram estimadas bem como o gasto energético envolvido nas diferentes possibilidades de dissociação dos isômeros mais estáveis. No caso dos sistemas triatômicos ainda estimamos as constantes de velocidade para as reações de isomerizações direta e reversa. Nesse contexto...

Estudo teórico do radical CAs e da adsorção de As e AsH3 na superfície C(100) do diamante; Theoretical study of the CAs radical and of the adsorption of As and AsH3 on diamond C(100) surface

Batista, Ana Paula de Lima
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 21/03/2014 PT
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46.08%
A química computacional, uma importante e crescente área da química teórica, vem sendo empregada com grande sucesso no entendimento dos mais variados tipos de sistemas químicos. Focando na interação entre arsênio e carbono, o presente trabalho apresenta duas situações distintas: uma que engloba o menor sistema formado entre eles, o radical CAs, e outra que traz a interação da superfície C(100) do diamante com o átomo de arsênio e a sua forma hidreto, ou seja, os sistemas C(100)+As e C(100)+AsH3. No primeiro caso, um tratamento de alto nível de correlação eletrônica (MRCI/aV5Z) é feito, permitindo se obter as propriedades espectroscópicas associados aos estados eletrônicos de mais baixa energia do radical. No estudo envolvendo a superfície C(100), dois modelos distintos de aglomerados foram adotados na representação do sólido: o modelo QM (C15H16) e o QM/MM (C292H120). A aproximação híbrida é baseada no método SIMOMM que é indicado para o tratamento de superfícies sólidas. Os dados estruturais e energéticos dos pontos de mínimos identificados nas duas diferentes aproximações foram contrastados, sugerindo que o modelo de aglomerado QM/MM é capaz de representar melhor o problema real.; Computational chemistry...

A atividade orientadora de ensino como alternativa metodológica para a abordagem de metais pesados na disciplina de Química Analítica Qualitativa; The Teaching Guiding Activity as a methodological alternative to the approach of heavy metals in the discipline of Qualitative Analytical Chemistry

Sanchez, João Ricardo
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 01/08/2014 PT
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36.12%
A disciplina Química Analítica Qualitativa (QAQ), no contexto do Departamento de Química (DQ) da Faculdade de Filosofia, Ciências e Letras de Ribeirão Preto (FFCLRP), passou ao longo dos anos por uma redução de sua carga horária, que era de 11 horas semanais (1990) para 6 horas semanais (2001). Com a limitação na carga horária de QAQ, alguns grupos analíticos (grupos IV e V Metais Pesados), foram aos poucos, deixando de ser abordados no curso de Licenciatura e Bacharelado em Química, ofertados pelo DQ. Devido à importância destes metais na atualidade, acreditamos que não poderiam ser suprimidos do currículo do nosso curso. Desta forma, elaborou-se uma AOE sobre os grupos analíticos IV e V, que haviam sido retirados da marcha analítica e nesta dissertação o objetivo foi investigar a potencialidade da Atividade Orientadora de Ensino (AOE) como estratégia de ensino-aprendizagem em QAQ. A fundamentação teórica deste trabalho pautou-se nos estudos de Vygotsky sobre atividade e consciência e também na Teoria da Atividade proposta por Leontiev. Participaram da AOE 23 alunos da Licenciatura em Química, regularmente matriculados na disciplina de QAQ, que é oferecida no terceiro semestre do curso. A AOE foi desenvolvida no 1o Semestre de 2013 e incluiu três encontros previamente acordados e inseridos no cronograma da disciplina. Os dois primeiros encontros foram desenvolvidos em duas aulas simples de 1h40...

Towards Quantum Chemistry on a Quantum Computer

Lanyon, B. P.; Whitfield, James Daniel; Gillett, G. G.; Goggin, M. E.; Almeida, M. P.; Kassal, Ivan; Biamonte, J. D.; Mohseni, Masoud; Powell, B. J.; Barbieri, M.; Aspuru-Guzik, Alan; White, Andrew G.
Fonte: Nature Publishing Group Publicador: Nature Publishing Group
Tipo: Artigo de Revista Científica
EN_US
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45.94%
Exact first-principles calculations of molecular properties are currently intractable because their computational cost grows exponentially with both the number of atoms and basis set size. A solution is to move to a radically different model of computing by building a quantum computer, which is a device that uses quantum systems themselves to store and process data. Here we report the application of the latest photonic quantum computer technology to calculate properties of the smallest molecular system: the hydrogen molecule in a minimal basis. We calculate the complete energy spectrum to 20 bits of precision and discuss how the technique can be expanded to solve large-scale chemical problems that lie beyond the reach of modern supercomputers. These results represent an early practical step toward a powerful tool with a broad range of quantum-chemical applications.; Chemistry and Chemical Biology

Quantum Chemistry in Nanoscale Environments: Insights on Surface-Enhanced Raman Scattering and Organic Photovoltaics

Olivares-Amaya, Roberto
Fonte: Harvard University Publicador: Harvard University
Tipo: Thesis or Dissertation
EN_US
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46.14%
The understanding of molecular effects in nanoscale environments is becoming increasingly relevant for various emerging fields. These include spectroscopy for molecular identification as well as in finding molecules for energy harvesting. Theoretical quantum chemistry has been increasingly useful to address these phenomena to yield an understanding of these effects. In the first part of this dissertation, we study the chemical effect of surface-enhanced Raman scattering (SERS). We use quantum chemistry simulations to study the metal-molecule interactions present in these systems. We find that the excitations that provide a chemical enhancement contain a mixed contribution from the metal and the molecule. Moreover, using atomistic studies we propose an additional source of enhancement, where a transition metal dopant surface could provide an additional enhancement. We also develop methods to study the electrostatic effects of molecules in metallic environments. We study the importance of image-charge effects, as well as field-bias to molecules interacting with perfect conductors. The atomistic modeling and the electrostatic approximation enable us to study the effects of the metal interacting with the molecule in a complementary fashion...

Theoretical and experimental studies of heterogeneous chemical processes leading to stratospheric ozone depletion; Heterogeneous chemical processes leading to stratospheric ozone depletion

Mantz, Yves André, 1974-
Fonte: Massachusetts Institute of Technology Publicador: Massachusetts Institute of Technology
Tipo: Tese de Doutorado Formato: 198 p.; 1839761 bytes; 1839516 bytes; application/pdf; application/pdf
ENG
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46.01%
The microscopic chemical mechanisms of heterogeneous reactions involving HC on crystalline ice and nitric acid trihydrate (NAT) are of fundamental interest to physical chemists, because such reactions yield "active" chlorine compounds that are readily photolyzed to yield radicals responsible for the annual destruction of polar stratospheric ozone. Using molecular-orbital and density-functional-based computational methods that are extensively validated, partial dissociation of HCl is shown to be kinetically rapid and thermodynamically favorable on an extended ice Ih surface model with two dangling OH groups in close proximity to adsorbed HCl at a binding site on the surface. Additionally, surface disordering of this ice model is observed at polar stratospheric temperatures when HCl is adsorbed at this site. The partial dissociation of HCl on/atop ice will compete with other proposed mechanisms only if the local density of surface dangling OH groups is high. This alternative mechanism of chlorine activation is not important on NAT, based on the theoretical study of HCl interacting with various low index NAT faces. This is due to the fact that the NAT (001) face (which may be the most prevalent in the polar stratosphere) possesses a low surface density of dangling OH groups. In addition...

Theoretical study of single-molecule spectroscopy and vibrational spectroscopy in condensed phases

Yang, Shilong, 1975-
Fonte: Massachusetts Institute of Technology Publicador: Massachusetts Institute of Technology
Tipo: Tese de Doutorado Formato: 279 p.; 13709617 bytes; 13746666 bytes; application/pdf; application/pdf
ENG
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46.01%
In this thesis, theoretical models and computer simulations are employed to study several problems of single-molecule spectroscopy and vibrational spectroscopy in condensed phases. The first part of the thesis concentrates on studying dynamic disorders probed by single molecule fluorescence spectroscopy. Event statistics and correlations of single-molecule fluorescence sequences of modulated reactions are evaluated for multi-channel model, diffusion-controlled reaction model, and stochastic rate model. Several event-related measurements, such as the on-time correlation and the two-event number density, are proposed to map out the memory function, which characterizes the correlation in the conformational fluctuations. A semiflexible Gaussian chain model is used to determine the statistics and correlations of single-molecule fluorescence resonant energy transfer (FRET) experiments on biological polymers. The distribution functions of the fluorescence lifetime and the FRET efficiency provide direct measures of the chain stiffness and their correlation functions probe the intra-chain dynamics at the single-molecule level. The fluorescence lifetime distribution is decomposed into high order memory functions that can be measured in single- molecule experiments. The scaling of the average fluorescence lifetime on the contour length is predicted with the semi-flexible Gaussian chain model and agrees favorably with recent experiments and computer simulations.; (cont.) To interpret the fluorescence measurements of the mechanical properties of double-stranded DNA...

Generalized quantum defect methods in quantum chemistry

Altunata, Serhan
Fonte: Massachusetts Institute of Technology Publicador: Massachusetts Institute of Technology
Tipo: Tese de Doutorado Formato: 254, [1] p.
ENG
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45.97%
The reaction matrix of multichannel quantum defect theory, K, gives a complete picture of the electronic structure and the electron - nuclear dynamics for a molecule. The reaction matrix can be used to examine both bound states and free electron scattering properties of molecular systems, which are characterized by a Rydberg/scattering electron incident on an ionic-core. An ab initio computation of the reaction matrix for fixed molecular geometries is a substantive but important theoretical effort. In this thesis, a generalized quantum defect method is presented for determining the reaction matrix in a form which minimizes its energy dependence. This reaction matrix method is applied to the Rydberg electronic structure of Calcium monofluoride. The spectroscopic quantum defects for the ... states of CaF are computed using an effective one-electron calculation. Good agreement with the experimental values is obtained. The E-symmetry eigenquantum defects obtained from the CaF reaction matrix are found to have an energy dependence characteristic of a resonance. The analysis shows that the main features of the energy-dependent structure in the eigenphases are a consequence of a broad shape resonance in the 2E+ Rydberg series.; (cont.) This short-lived resonance is spread over the entire 2E+ Rydberg series and extends well into the ionization continuum. The effect of the shape resonance is manifested as a global "scarring" of the Rydberg spectrum...

Understanding the Origin of Selectivity in the Asymmetric Lithiation Reaction of N-Heterocycles: A Theoretical Study

Taban, Keivan
Fonte: Brock University Publicador: Brock University
Tipo: Electronic Thesis or Dissertation
ENG
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45.84%
The natural abundance of the N-heterocycle containing compounds has pushed the synthetic community toward the invention of new synthetic methods that result in the structural diversity of N-heterocycles. Among this, is the efficient and highly selective diamine mediated asymmetric lithiation process. Amongst the diamine chiral ligands, (-)-sparterine, which is a naturally occurring alkaloid proved to be an efficient one. Many successful, good yielding and highly selective lithiation reactions have been accomplished with the mediation by this chiral diamine base. Although, there are some examples of experimental and theoretical mechanistic studies in the literature, there is a lack of detailed understanding as to how it exactly induces the chirality. In this thesis is described a systematic investigation of how (-)-sparteine influences the stereoselectivity in the course of asymmetric lithiation reaction. This led us to the establishment of the function of A-ring’s β-CH2 effect and D-ring effect. Consequently, the importance of the A-ring and D-ring portions of (-)-sparteine in the stereoselectivity is unraveled. Another part of this thesis deals with the asymmetric lithiation of BF3-activated N,N- dimethylaminoferrocene in the presence of (1R...

Variational Monte Carlo study of core-valence separation schemes for first-row atoms and positive ions /

Staroverov, Viktor N.
Fonte: Brock University Publicador: Brock University
Tipo: Electronic Thesis or Dissertation
ENG
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45.93%
All-electron partitioning of wave functions into products ^core^vai of core and valence parts in orbital space results in the loss of core-valence antisymmetry, uncorrelation of motion of core and valence electrons, and core-valence overlap. These effects are studied with the variational Monte Carlo method using appropriately designed wave functions for the first-row atoms and positive ions. It is shown that the loss of antisymmetry with respect to interchange of core and valence electrons is a dominant effect which increases rapidly through the row, while the effect of core-valence uncorrelation is generally smaller. Orthogonality of the core and valence parts partially substitutes the exclusion principle and is absolutely necessary for meaningful calculations with partitioned wave functions. Core-valence overlap may lead to nonsensical values of the total energy. It has been found that even relatively crude core-valence partitioned wave functions generally can estimate ionization potentials with better accuracy than that of the traditional, non-partitioned ones, provided that they achieve maximum separation (independence) of core and valence shells accompanied by high internal flexibility of ^core and Wvai- Our best core-valence partitioned wave function of that kind estimates the IP's with an accuracy comparable to the most accurate theoretical determinations in the literature.

Quantum Monte Carlo : some theoretical and numerical studies

Gordon, Heather Louise.
Fonte: Brock University Publicador: Brock University
Tipo: Electronic Thesis or Dissertation
ENG
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45.99%
In Part I, theoretical derivations for Variational Monte Carlo calculations are compared with results from a numerical calculation of He; both indicate that minimization of the ratio estimate of Evar , denoted EMC ' provides different optimal variational parameters than does minimization of the variance of E MC • Similar derivations for Diffusion Monte Carlo calculations provide a theoretical justification for empirical observations made by other workers. In Part II, Importance sampling in prolate spheroidal coordinates allows Monte Carlo calculations to be made of E for the vdW molecule var He2' using a simplifying partitioning of the Hamiltonian and both an HF-SCF and an explicitly correlated wavefunction. Improvements are suggested which would permit the extension of the computational precision to the point where an estimate of the interaction energy could be made~

O uso de visualizações no ensino de química: a formação inicial do professor de química; The use of visualizations in Chemistry teaching: the Chemistry teacher pre-service education

Ferreira, Celeste Rodrigues
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 26/11/2010 PT
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36.16%
Este estudo é uma pesquisa qualitativa, em que procuramos conhecer e analisar as concepções dos alunos de uma turma de licenciatura em Química da USP (Universidade de São Paulo), sobre o uso de visualizações no ensino de Química. O papel dos modelos e da visualização na Ciência e no ensino da Ciência, e em especial na Química, tem ganhado importância teórica e prática ao longo da última década. A Química envolve a interpretação das mudanças observáveis na matéria (ex.: mudanças de cor, libertação de gases) na dimensão macroscópica (concreto) em termos de mudanças imperceptíveis na dimensão submicroscópica (imaginária). Estas mudanças são representadas de forma simbólica e abstrata usando símbolos e fórmulas químicas, equações, gráficos, imagens etc. Com o objetivo de tornar acessíveis estas representações para os alunos, professores de vários graus de ensino recorrem com cada vez mais freqüência à visualização. Para alcançar os nossos objetivos foram acompanhadas pela pesquisadora, as aulas de Metodologia de Química II desta turma, durante um semestre. Foi aplicado, no início do semestre um questionário a toda a turma, cujo objetivo era registrar quais as concepções que estes possuíam acerca desta temática. No final do semestre...

First-principles density functional theory study of sulfur oxide chemistry on transition metal surfaces; 1st-principles density functional theory study of sulfur oxide chemistry on transition metal surfaces

Lin, Xi, 1973-
Fonte: Massachusetts Institute of Technology Publicador: Massachusetts Institute of Technology
Tipo: Tese de Doutorado Formato: 310 p.; 9412825 bytes; 9412627 bytes; application/pdf; application/pdf
ENG
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46.04%
In this thesis, the chemistry of sulfur oxides on transition metals is studied extensively via first-principles density functional theory (DFT) computations, focusing on the chemical reactivity and selectivity in sulfur poisoning chemical processes that address environmental concerns. The systematic approach we establish can be extended to general computational studies of small gas-phase molecules interacting with extended surfaces or finite-size clusters. The thesis starts with a theoretical presentation of modem quantum many-body theory that brings together mean-field theory, DFT, and Green's function quantum Monte Carlo theory. The essence of chemical reactivity theory in the framework of DFT is emphasized. The thesis continues with an extensive survey of the current status of sulfur oxide chemistry and an overall presentation of our computational approaches towards a detailed understanding of chemical reactivity and selectivity. The basic guidelines in chemical reactivity are systematically constructed by computed comprehensive thermodynamic data of surface S, O, SO, SO2, SO3, and S04 species as a function of coverage at low and intermediate temperatures. Under these basic guidelines, experimentally measured surface spectra are interpreted...

The use of CML and CML in Computational Chemistry and Physics Programs

Wakelin, Jon; Garcia, A; Murray-Rust, Peter
Fonte: Universidade de Cambridge Publicador: Universidade de Cambridge
Tipo: Artigo de Revista Científica
EN
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45.94%
Proceedings of the 2004 e-Science All Hands Meeting, 31st August - 3rd September, Nottingham UK; This work addresses problems associated with data exchange and data representation in the computational chemistry and physics communities. Recent computational developments, such as Condor and the Grid, have paved the way for new kinds of simulations that demand more rigorous data handling. To this end, the paper discusses the use of XML and the Chemical Markup Language (CML) in theoretical chemistry and physics. Extensions to the core CML language, known as CMLComp, are also discussed. However, the majority of atomic scale simulation software is written in Fortran. Fortran's lack of XML support represents a potential barrier to the adoption of CML in these fields. This has prompted the authors to develop XML and CML processing tools for Fortran, including native SAX and DOM implementations, as well as libraries for generating well formed XML and CML. These libraries have been used to extend existing simulation packages to work with the CML and CMLComp languages. Finally, we give a practical example that highlights how these XML aware applications can be effectively used as workflow components in complex chemical and physical simulations.

A Estranha e Contraditória Relação entre os Químicos e a Química Teórica; The Odd and Contradictory Relationship between Chemists and Theoretical Chemistry

André Gustavo H. Barbosa; Universidade Federal Fluminense
Fonte: Revista Virtual de Química Publicador: Revista Virtual de Química
Tipo: ; Formato: binary/octet-stream
Publicado em 02/10/2009 PT
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66.23%
Através de uma breve análise histórica procuramos mostrar como a linguagem da química evoluiu independentemente de outras ciência até o final do século XIX. Até esta época os modelos químicos eram inteiramente incompatíveis com a ciência. A partir da década de 1910, com o começo da elucidação pelos físicos de alguns elementos da estrutura do átomo, os químicos passaram a utilizar elementos de física física atômica em seus modelos de ligação química. Mas só com o advento da mecânica quântica na década de 1920 passou a ser possível, em princípio, basear modelos químicos inteiramente em resultados de considerações teóricas de estrutura eletrônica. Entretanto, os problemas de interesse dos químicos eram mais complicados do que os físicos conseguiam tratar. Devido a estas dificuldades, foram formulados modelos simplificados. A escolha destes modelos simplificados pelos químicos foi motivada apenas pelos critérios de disponibilidade, facilidade de uso, e pouca necessidade de estudo adicional. Este procedimento provoca inevitavelmente o surgimento de ideias e conceitos sem fundamento que hoje estão presentes em livros-texto de química em todos os níveis. Alguns exemplos são discutidos onde se demonstra que o uso de funções de onda que tratam corretamente o problema da indistinguibilidade dos elétrons...

Resenha do livro “Neither Physics nor Chemistry: a History of Quantum Chemistry”; Book Review: Neither Physics nor Chemistry: a History of Quantum Chemistry

Itamar Borges Jr.; Dep. de Química, IME
Fonte: Revista Virtual de Química Publicador: Revista Virtual de Química
Tipo: ; Formato: binary/octet-stream
Publicado em 19/05/2012 PT
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46.07%
O livro “Neither Physics nor Chemistry: a History of Quantum Chemistry”, de autoria de Kostas Gavroglu e Ana Simões, publicado pela MIT Press em 2012, é resenhado. Os autores do livro discutem através de seis bem construídos núcleos de assuntos os conceitos, práticas, instituições e personagens formadores da cultura da química quântica. O livro começa sua história logo após o desenvolvimento da mecânica quântica ao final dos anos 1920’s e termina nos anos 1970’s quando a química quântica está completamente estabelecida como uma nova área do conhecimento. Os autores usaram uma riqueza de fontes primárias incluindo livros de anotações e cartas entre os principais responsáveis pelo estabelecimento de uma nova área científica. A história dos primeiros cinquenta anos da química quântica tem uma apresentação muito recomendada aos interessados na história da ciência e na história da química indistintamente. DOI: 10.5935/1984-6835.20120014; The book “Neither Physics nor Chemistry: a History of Quantum Chemistry”, authored by Kostas Gavroglu and Ana Simões and published by MIT Press in 2012, is reviewed. The book authors discuss through six nicely constructed clusters of subjects the concepts...