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Caracterizacion y analisis de la variabilidad genética de la granadilla (Passiflora ligularis juss.) en Colombia empleando marcadores microsatélites

Bernal-Parra,Nathalia; Ocampo-Pérez,John; Hernández-Fernández,Javier
Fonte: Sociedade Brasileira de Fruticultura Publicador: Sociedade Brasileira de Fruticultura
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/09/2014 ES
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56.08%
La granadilla es la segunda especie en importancia económica del género Passiflora y Colombia es el principal productor del mundo con 53.000 t/año. Son pocos los estudios sobre la diversidad intraespecifica en la especie que permitan establecer las relaciones genéticas entre individuos. El objetivo de esta investigación fue explorar la variabilidad genética de la granadilla cultivada en Colombia por medio de marcadores microsatélites. Diez marcadores microsatélites fueron evaluados en 41 accesiones (82 individuos) provenientes de los principales departamentos productores. Un total de cinco microsatélites fueron amplificados con 66 alelos identificados y un promedio de 12,2, entre ellos 7 únicos y 13 raros. Los índices de diversidad mostraron un contenido de información polimórfica de 0,74 (PIC), y una heterocigocidad promedio observada (Ho) y esperada (He) de 0,98 y 0,96 bajo condiciones de equilibrio de Hardy-Weinberg. La distancia genética promedio dentro y entre poblaciones fue de 0,65 y 0,80, siendo Boyacá, Valle del Cauca y Putumayo los más distantes (>0,87). Los análisis de clasificación arbórea (nj) y factorial de correspondencia múltiple (AFCM) revelaron poca estructuración geográfica de las accesiones y dispersión de los individuos de un mismo origen. La carencia de estructuración y la alta variabilidad intraespecífica podría explicarse por el fenómeno de alogamia presente en la especie y el intercambio de semillas entre productores. En conclusión...

Análisis y validación de microsatélites EST-SSRs como candidatos a marcadores moleculares de la tolerancia a estrés hídrico en una colección de clones de melina (Gmelina arborea Roxb.)

Quisobony Paredes, Diana Alejandra
Fonte: Pontifícia Universidade Javeriana Publicador: Pontifícia Universidade Javeriana
Tipo: bachelorThesis; Trabajo de Grado Formato: application/pdf
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La melina (Gmelina arborea Roxb) es una especie forestal originaria de países asiáticos cuya distribución se ha extendido a diferentes países tropicales, incluyendo Colombia, debido a sus características de rápido crecimiento, fácil adaptación a las condiciones adversas, además de la versatilidad de usos de su madera, atributos que le han permitido posicionarse entre las especies maderables tropicales de mayor potencial económico. Sin embargo, a pesar de su exitosa adaptación a las condiciones edafoclimáticas de la región Caribe colombiana y su conocida capacidad de tolerancia al estrés hídrico, las temporadas de sequía que se han presentado en las últimas décadas en esta región del país, limitan las posibilidades de expansión y los rendimientos de las siembras comerciales de esta especie. Los rasgos de tolerancia a estrés hídrico y la respuesta a sequía son de carácter multigénico y asimismo su expresión obedece a mecanismos regulatorios complejos. Por ello, el poder identificar genotípicamente individuos que presenten estas características es un reto para el mejoramiento genético de esta especie frente a esta problemática. Los marcadores moleculares se presentan como una herramienta básica para la selección asistida de individuos tolerantes a este tipo de estrés abiótico. En el presente estudio se analizaron 33 clones pertenecientes al programa de mejoramiento genético de la empresa Pizano S.A. utilizando 28 parejas de primers para microsatélites génicos tipo EST-SSRs (Expressed Sequence Tag - Single Sequence Repeats) obtenidas a partir de un estudio de perfiles transcriptómicos bajo estrés hídrico en Gmelina arborea [1]. Se estandarizaron las condiciones de amplificación por PCR para 14 parejas de primers seleccionados y se realizaron perfiles de electroforesis PAGE. El índice de polimorfismo para los respectivos marcadores microsatelitales se estimó por medio del programa GenAlEx. Los resultados obtenidos en forma preliminar demostraron un alto nivel de polimorfismo en tres de los microsatélites analizados: CL473C2...

Fortalecimiento del mejoramiento genético del duraznero mediante la vinculación internacional y la selección asistida

Biotecnologia Fruticola S. A; Exportadora Geofrut Ltda.; Exportadora Magna Trading S. A.; Fruticola Viconto S a; Soc Comercial el Amanecer de Mostazal Limitada; Sociedad Viveros Asociados Chile Ltda.; Universidad de Chile; Universidad Nacional Andres Bell
Fonte: Corporação de Fomento da Produção Publicador: Corporação de Fomento da Produção
Tipo: Proyecto
Publicado em 30/11/2009
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86.47%
El programa Innova busca fortalecer el programa de mejoramiento genético de duraznero/nectarino Australis Breeding® (PMG Australis Breeding®) mediante la asociación con un PMG extranjero la generación de nueva variabilidad genética la selección asistida por marcadores moleculares y la participación de empresas productoras/exportadoras claves del sector que permitirán la rápida adopción de la tecnología por parte de la industria chilena. El PMG Australis Breeding® es desarrollado por Andes Nursery Association (ANA) y la Universidad de Chile desde 1998 y ha sido el primero en generar variedades chilenas (Andes Du-1 en 2008 y dos nectarinos en fase de protección durante 2010). La tasa de generación de variedades con la actual estructura se proyecta en una variedad cada dos años sin embargo mediante la presentación del actual programa Innova se cuadruplicará esta tasa llegando a 2 variedades licenciadas por año a partir del octavo año. Además gracias a la incorporación de empresas exportadoras/productoras comprometidas en el desarrollo de los productos y en el financiamiento de las actividades se logrará que la transferencia tecnológica hacia la industria sea mucho más rápida y efectiva. Se buscará además fortalecer la acción del PMG mediante la vinculación con un PMG líder en el mundo incorporando germoplasma de elite y evaluando sus genotipos en origen según los requerimientos de vida de pos cosecha de la propia industria chilena. Además se constituirá una plataforma de mejoramiento asistido por marcadores moleculares (MAB) que en una primera fase será financiada con el presupuesto del programa Innova. Esta plataforma buscará seleccionar nectarinos de pulpa no susceptible a harinosidad y se orientará a desarrollar los modelos de uso de estas herramientas en el ámbito del PMG que garanticen su aplicación efectiva en términos de relación costo/beneficio. En una segunda fase con fondos distintos (FONDEF) se desarrollarán nuevos marcadores asociados a caracteres más complejos como coloración de la piel aroma o contenido de azúcares que serán también utilizados como herramientas de selección precoz dentro del PMG. Se estructurará en tres etapas en la primera se desarrollará evaluará y seleccionará la variabilidad genética nueva. Se constituirá y enriquecerá la base genética del PMG generando 50 poblaciones segregantes al año y evaluando el desempeño técnico de las Líneas Genéticas Avanzadas (LGA). Además se iniciará la negociación para constituir un acuerdo de colaboración entre el PMG Australis Breeding® y un PMG privado europeo. Este acuerdo ayudará a alcanzar variedades de alta calidad en tiempos menores a través del uso de germoplasma de elite y mediante la evaluación por parte del PMG extranjero de los genotipos en origen utilizando criterios que satisfagan a los requisitos de la industria chilena particularmente en cuanto a la evaluación de pos cosecha prolongada (30 y 45 días). Se constituirá y mantendrá un banco de germoplasma enriquecido con aproximadamente 200 genotipos. Se realizarán manejos agronómicos mirados a reducir el periodo juvenil de los seedlings. Se realizará una evaluación de pre y pos cosecha de los seedlings y ya a la cuarta temporada de crecimiento en el Campo de Seedlings se realizará la selección de los individuos superiores y se injertarán en patrón Nemaguard . En una segunda etapa se validarán los nuevos genotipos y el uso de MAB para lo cual se generará una plataforma de MAB que en primer lugar evaluará el estatus alélico del germoplasma particularmente para caracteres que afectan el desempeño de pos cosecha de la fruta como es el fenotipo de piel glabra (g/g) y pulpa no fundente (m/m). Además se buscará generar un modelo de uso de la MAB que sea sustentable técnica y económicamente en el ámbito de un PMG activo. En cuanto a la validación de los genotipos las líneas genéticas avanzadas (LGA) serán establecidos a razón de 10 plantas/LGA en dos Unidades Experimentales representativas de condiciones edafoclimáticas de zonas frutícolas chilenas: El Tambo y Paine. En estas condiciones se evaluará el desempeño técnico de ellas desde el punto de vista vegetativo y reproductivo. Se realizará análisis sensorial y pruebas de laboratorio para establecer la calidad de la fruta y desempeño en pos cosecha. De entre aquellas LGA que resultaron destacadas por méritos productivos y/o de calidad de su fruta pasarán a denominarse Variedades Pre Comerciales (VPC) y serán traspasadas a los mandantes. En la tercera etapa se transferirá a las empresas mandantes y se generará un modelo de Mejoramiento Genético Participativo. Se evaluará el desempeño de las VPC en condiciones productivas normales por parte de las empresas mandantes. Aproximadamente 4 genotipos por año serán propagadas y evaluadas durante cuatro años en su desempeño de pre y pos cosecha. Se realizará una evaluación de su aceptabilidad entre consumidores de fruta y también entre agentes claves de la industria. Serán protegidas dos variedades por año a partir del octavo año del programa Innova y se generarán modelos de negocios específicos para cada producto los cuales buscarán hacer rentable el negocio para todos los agentes de la cadena productiva. Además al impulsar el Mejoramiento Genético Participativo se facilitará la adopción de la nueva tecnología y la generación de negocios. Se considera un plan de divulgación oral basado en Días de Campo a partir del tercer año en que se darán a conocer los nuevos genotipos tempranos de media estación y tardíos en tres reuniones por año. Asimismo al final de la temporada se realizará una charla que abarcará toda la información generada durante esa temporada. Se llevará a cabo un seminario internacional durante el cuarto año del programa Innova en el cual se invitarán a importantes científicos relacionados con la investigación en duraznero. Se contempla además realizar una publicación de extensión y una publicación científica al año a partir del tercer año. Finalmente se mantendrá un sistema de encuestas que permita generar un canal de comunicación abierto entre el PMG y la demanda no sólo en Chile sino que con los potenciales consumidores en Europa y Estados Unidos. La generación de variedades que mantengan un alto estándar cualitativo luego de una fase de conservación prolongada redundará en un 10-20% de mayor precio que el promedio actual como se observa hoy en día en aquellas variedades superiores. Además se ha constatado que los viveros no están vendiendo plantas de durazneros para el mercado fresco desde los años 2003-2004 porque la fruta está mostrando malas liquidaciones en la exportación. Por otro lado la venta de plantas de nectarinos también ha bajado aunque manteniendo volúmenes aceptables con variedades protegidas y diferenciables (Jadue y Poblete 2009). Se asume una superficie estabilizada todos los años en Chile deberían ser re plantadas alrededor de 1.1877 ha.; Potenciar el programa de mejoramiento genético de duraznero/nectarino a través de la asociación tecnológica para la selección asistida y una estrategia de vinculación nacional e internacional para la gestión de nuevas variedades.; Corporación de Fomento de la Producción

Desarrollo de un panel de SNPs para mejorar la resistencia genética al virus IPN en salmón del Atlántico

Aquainnovo Sa; PAULA MACARENA HEINSOHN F. X- REGION
Fonte: Corporação de Fomento da Produção Publicador: Corporação de Fomento da Produção
Tipo: proyecto
Publicado em 19/10/2012
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56.26%
La necrosis pancreática infecciosa (IPN) es una enfermedad viral que genera importantes pérdidas económicas para el sector dedicado al cultivo del salmón tanto a nivel nacional como internacional. Una de las especies más afectadas por el virus IPN (IPNv) es el salmón del Atlántico (Salmo salar) principal especie cultivada en el país.Se ha determinado que existe resistencia frente a IPN en salmón del Atlántico y que además este carácter está fuertemente influenciado por un componente genético con heredabilidades estimadas superiores a 0.4. Por lo tanto el mejoramiento genético de la resistencia frente a IPN constituye una alternativa factible y sustentable para el control de esta enfermedad. Esta estrategia puede complementar las medidas actuales de prevención y control (vacunaciones y medidas zoosanitarias) cuyos resultados en condiciones de campo no han demostrado la efectividad esperada. Recientemente se ha identificado una región del genoma (locus de efecto cuantitativo o QTL) asociada a la resistencia frente a IPN en dos poblaciones comerciales independientes de salmón del Atlántico la cual explica una gran proporción (cerca de un 80%) de la variación genética para el rasgo. El gran efecto del QTL asociado a la resistencia frente a IPN permite la utilización de selección asistida por marcadores moleculares (MAS) para mejorar el carácter con una mayor precisión y eficiencia en la selección. Los resultados documentados indican que existe una alta protección frente a la infección viral en los peces seleccionados mediante esta estrategia debido a un incremento en la sobrevivencia de familias desafiadas experimentalmente y a una disminución en los brotes de campo. Sin embargo las metodologías de MAS utilizadas actualmente en el mejoramiento genético de la resistencia a IPN requieren de la realización de desafíos experimentales en todas las familias del núcleo de reproductores con el objetivo de determinar la fase de ligamiento entre los marcadores y el QTL en cada generación lo cual incrementa considerablemente los costos de esta aproximación. La necesidad de determinar la fase de ligamiento entre marcadores y QTL en cada generación se debe fundamentalmente a que la resolución de la información molecular disponible actualmente no permite obtener marcadores que mantengan altos niveles de desequilibrio de ligamiento (LD) con el QTL a través de las generaciones. El progreso en la secuenciación del genoma del salmón del Atlántico y el desarrollo de nuevas tecnologías de secuenciación masiva tales como la secuenciación de RNA (RNAseq) constituyen una oportunidad única para identificar nuevas variaciones puntuales en la secuencia de DNA (single nucleotide polymorphisms o SNPs) entre individuos resistentes y susceptibles. Esto permitirá obtener una mayor resolución dentro de la región más probable para el QTL de resistencia a IPN e incluso otorgará nueva evidencia sobre el gen o los genes involucrados y las respectivas mutaciones causales. Asimismo las nuevas metodologías de genotipado de alto rendimiento (high-throughput) las cuales permiten analizar un gran número de individuos para un considerable número de SNPs en un tiempo reducido con gran eficiencia confiabilidad y bajo costo relativo a la cantidad de información entregada pueden asegurar la rápida implementación de pruebas basadas en SNPs asociados al QTL que permitan conocer el estatus de la resistencia genética frente a IPN en poblaciones comerciales de salmones. Desde el punto de vista práctico la utilización de estas nuevas variantes podrán asegurar un alto nivel de LD entre los SNPs y el QTL lo que permitirá en primer lugar prescindir de desafíos experimentales en todas las generaciones disminuyendo considerablemente los costos de la implementación de programas de MAS para mejorar la resistencia a IPN y en segundo lugar el desarrollo de una herramienta útil en la determinación de la resistencia genética frente a IPN en poblaciones comerciales de S. salar a nivel productivo. El desarrollo e implementación de esta tecnología en un formato de genotipado rápido y eficiente (SNP-IPN Panel) permitirá generar una alternativa factible y sustentable para la prevención y control del IPNv apuntando al cultivo de salmones más robustos que incrementen la rentabilidad de los sistemas de producción a nivel nacional.; El presente proyecto pretende identificar marcadores moleculares de tipo SNP con una elevada saturación en la región genómica (QTL) que explica una gran proporción de la resistencia frente a IPN y generar un panel de genotipado utilizando estos SNPs (SNP-IPN Panel) para ser utilizado en el mejoramiento genético del carácter en núcleos de reproductores de salmón del Atlántico y para la evaluación de la resistencia genética de poblaciones comerciales a nivel de producción.; Corporación de Fomento de la Producción

Desarrollo de un Programa de Selección Genética de Mytilus Galloprovincialis, para Mejorar la Tasa de Crecimiento

Acuimarc S a; Seakelp Inversiones Limitada; Universidad Catolica de la Santisima Concepcion; Felipe Gustavo Diaz Seguel
Fonte: Corporação de Fomento da Produção Publicador: Corporação de Fomento da Produção
Tipo: proyecto
Publicado em 23/07/2012
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76.26%
La Mitilicultura Chilena se ha Desarrollado Básicamente en la Región de Chiloé Debido a las Características Geográficas de la Zona y a la Presencia de Bancos Naturales de Mytilus Chilensis que Han Sustentado hasta Ahora la Producción de Semillas de este Mitílido. Sin Embargo un Problema Económico de Esta Especie es que Tiene un bajo Precio de Venta y por Otro Lado es una Industria Dependiente de la Captación Natural de Semillas las que Históricamente Han Sido Fluctuantes en Calidad y Cantidad Presentando una Fuerte Crisis este Año con una Disminución de un 30% y se Estiman Perdidas de un 70% para el 2013. Mytilus Galloprovincialis por el Contrario es una Especie que Tiene un Mercado Conocido y que se Oferta a Mejores Precios a Nivel Internacional Exhibiendo Características Biológicas que Pueden Ser Aprovechadas para una Diversificación de Áreas de Cultivo Alternativo Incluso hacia el Norte del País. Esta Especie Está Presente en Chile desde la Región del Bío-bío hasta la Región de Coquimbo y Aunque No Existen Cultivos de este Mitílido Sí se Cuenta con Experiencias Exitosas de Producción de Semillas en Sistemas Controlados. Sin Embargo la Falta de Semillas También es un Problema para M Galloprovincialis ya que el Nivel de Captación en Bancos Naturales al Igual que el Chorito Chileno es Muy bajo por lo cual es Necesaria la Producción de Semillas en Sistemas Controlados. No Obstante Esta Producción de Semillas Trae Nuevos Costos de Producción Asociados por lo que el Éxito en Chile de Esta Auspiciosa Industria Pasa por Generar una Tecnología Capaz de Disminuir los Costos de Operación Asociados en la Producción y Generar Valor Agregado a los Individuos Cultivados. en este Contexto para Diversificar y Potenciar la Acuicultura Nacional este Proyecto Pretende la Producción de Semillas de M. Galloprovincialis Mejoradas Genéticamente para Aumentar la Tasa de Crecimiento (disminuyendo los Costos de Producción) a Través de Selección Asistida por Marcadores Moleculares (mas-gas). Para ello se Evaluará la Diversidad Genética de las Distintas Poblaciones o Stocks Presentes en las Costas Chilenas a Través de Marcadores Moleculares y se Buscarán Polimorfismos Tipo Snp´s mediante Secuenciación Masiva del Transcriptoma para Determinar la Relación de Éstos con el Atributo Crecimiento a las Distintas Edades de los Individuos a Seleccionar.; Desarrollar el Estudio del Estado del Arte que Permita Identificar el o los Mejores Procedimientos de Selección Genética que Permitan Aumentar en la Producción en Mytilus Galloprovincialis.; Desarrollar un Estudio que Permita Identificar las Oportunidades y el Tamaño del Mercado para la Tecnología Generada en este Proyecto Cuantificando y Valorando Preliminarmente el Impacto Potencial de la Misma; Objetivo General: Formular un Proyecto de Investigación y Desarrollo que Permita Evaluar las Alternativas de Mejoramiento Genético para Mejorar las Tasas de Crecimiento en Mytilus Galloprovincialis a Través de la Utilización de Herramientas Genómicas de Última Generación. Objetivos Específicos: 1. - Desarrollar el Estudio del Estado del Arte que Permita Identificar el o los Mejores Procedimientos de Selección Genética que Permitan Aumentar en la Producción en Mytilus Galloprovincialis. 2. - Desarrollar un Estudio que Permita Identificar las Oportunidades y el Tamaño del Mercado para la Tecnología Generada en este Proyecto Cuantificando y Valorando Preliminarmente el Impacto Potencial de la Misma. 3. - Realizar Prospecciones de Socios Científicos y Empresariales Pertinentes para el Proyecto.; Realizar Prospecciones de Socios Científicos y Empresariales Pertinentes para el Proyecto.; Corporación de Fomento de la Producción

Desarrollo de Bases Tecnológicas para la Generación de un Paquete Costo Eficiente de Producción de Semilla de Mytilus Galloprovincialis Usando Secuenciación Masiva como Rad Seq para la Búsqueda de Marcadores en Caracteres de Alta Complejidad

Galaico Chilena de Pescados y Mariscos S a; Instituto de Fomento Pesquero; Universidad Catolica de la Santisima Concepcion; Carla Alejandra Contreras Schifferli
Fonte: Corporação de Fomento da Produção Publicador: Corporação de Fomento da Produção
Tipo: proyecto
Publicado em 09/09/2013
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66.15%
La Mitilicultura Chilena se ha Desarrollado Básicamente en la Región de Chiloé Debido a las Características Geográficas de la Zona y a la Presencia de Bancos Naturales de Mytilus Chilensis. Sin Embargo un Problema Económico de Esta Especie es que Tiene un bajo Precio de Venta y a su Vez es una Industria Dependiente de la Captación Natural de Semillas las que Históricamente Han Sido Fluctuantes en Calidad y Cantidad. Mytilus Galloprovincialis por el Contrario es una Especie que Tiene un Mercado Conocido y que se Oferta a Mejores Precios a Nivel Internacional Exhibiendo Características Biológicas que Pueden Ser Aprovechadas para una Diversificación de Áreas de Cultivo Alternativo Incluso hacia el Norte del País. Esta Especie Está Presente en Chile desde la Región del Bío-bío hasta la Región de Coquimbo y Aunque No Existen Cultivos de este Mitílido Sí se Cuenta con Experiencias Exitosas de Producción de Semillas en Sistemas Controlados. Sin Embargo la Falta de Semillas También es un Problema para M Galloprovincialis ya que el Nivel de Captación en Bancos Naturales al Igual que el Chorito Chileno es Muy bajo por lo cual es Necesaria la Producción de Semillas en Sistemas Controlados. No Obstante Esta Producción de Semillas Trae Nuevos Costos de Producción Asociados por lo que el Éxito en Chile de Esta Auspiciosa Industria Pasa por Generar una Tecnología Capaz de Disminuir los Costos de Operación Asociados en la Producción y Generar Valor Agregado a los Individuos Cultivados. en este Contexto para Diversificar y Potenciar la Acuicultura Nacional este Proyecto Pretende la Producción de Semillas de M. Galloprovincialis Mejoradas Genéticamente para Aumentar la Tasa de Crecimiento y Supervivencia (disminuyendo los Costos de Producción) a Través de Selección Asistida por Marcadores Moleculares (mas-gas) en Base al Análisis de Polimorfismos Tipo Snp´s Obtenidos mediante Secuenciación Masiva del Transcriptoma para Determinar la Relación de Éstos con el Atributo Crecimiento-supervivencia de las Distintas Familias a Seleccionar.; Desarrollar Bases Científico-tecnológicas para la Implementación de un Programa de Selección Genética en el Choro Araucano Mytilus Galloprovincialis y Evaluación de su Impacto sobre la Producción. Se Obtendrán Familias Seleccionadas y un Panel de Snp´s Específicos que Nos Permitirá Contar con las Bases para la Implementación de un Programa de Mejoramiento Genético que Apunte a Consolidar un Paquete Costo-eficiente de Cultivo en Sistema Controlado de Semillas en la Especie que Sea Capaz de Competir con la Captación Natural. Es Importante Destacar que Si Bien Esta Propuesta Esta Pensada para Generar las Bases de un Programa de Selección al Terminar el Proyecto ya se Podrá Contar Familias Mejoradas (pero No Optimizadas Respecto de los Caracteres Seleccionados) las que Podrán Ser Utilizadas en las Posteriores Etapas de Transferencia y Escalamiento y Posterior a esto Poder Seguir Mejorando a un Costo Reducido hasta donde las Características Propias de la Especie lo Permitan. Objetivos Específicos: 1. - Desarrollar Líneas Familiares en el Choro Araucano Mytilus Galloprovincialis con Altas Tasas de Crecimiento y Supervivencia de Semillas en Hatchery. 2. - Generar un Panel de Snp´s Asociados a los Caracteres Crecimiento y Supervivencia de Semillas en Condiciones Controladas. 3. - Prospección Económica y Análisis de Rendimientos de la Producción de Semillas Mejoradas V/s Naturales.; Desarrollar Líneas Familiares en el Choro Araucano Mytilus Galloprovincialis con Altas Tasas de Crecimiento y Supervivencia de Semillas en Hatchery; Generar un Panel de Snp´s Asociados a los Caracteres Crecimiento y Supervivencia de Semillas en Condiciones Controladas.; Prospección Económica y Análisis de Rendimientos de la Producción de Semillas Mejoradas V/s Naturales.; Corporación de Fomento de la Producción

Genetic factors involved in resistance to infectious diseases in salmonids and their application in breeding programmes

Martínez, V.; Yáñez, J. M.
Fonte: UNIV AUSTRAL CHILE, FAC CIENCIAS VETERINARIAS Publicador: UNIV AUSTRAL CHILE, FAC CIENCIAS VETERINARIAS
Tipo: Artículo de revista
ES
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Artículo de publicación ISI; El control de las enfermedades infecciosas es fundamental en el éxito del cultivo del salmón. El mejoramiento genético de la resistencia a enfermedades puede otorgar una opción factible y sustentable para el control de éstas. La Selección Asistida por Marcadores Moleculares (MAS) o Genes (GAS) se proyecta como una valiosa alternativa al mejoramiento convencional de la resistencia. Sin embargo, para implementar esta metodología es necesario el conocimiento previo de los factores genéticos involucrados en el carácter. En este trabajo se revisan y se discuten los aspectos más relevantes de la resistencia genética a enfermedades infecciosas en salmónidos y su aplicabilidad a programas de mejoramiento. En primer lugar, se presentan brevemente las enfermedades infecciosas más relevantes a nivel nacional. Además, se incluyen aspectos relacionados con el mejoramiento convencional para este rasgo cuantitativo, tales como criterios de selección, variación genética de la resistencia y correlaciones genéticas con otros caracteres de interés productivo. Por otra parte, se revisan tres aproximaciones moleculares utilizadas en la identificación de los factores genéticos involucrados en la resistencia: genes candidatos...

Establecimiento de la línea de base de la variabilidad genético-poblacional del recurso camarón de roca, Rhynchocinetes typus, H. Milne Edwards 1837

Oñate Bustos, Cecilia Alejandra
Fonte: Universidad de Chile Publicador: Universidad de Chile
Tipo: Tesis
ES
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66.12%
Tesis presentada como parte de los requisitos para optar al grado de Magíster en Ciencias de la Acuicultura; La creciente demanda mundial de productos pesqueros y el estancamiento de la pesca extractiva, ha llevado a la acuicultura a la búsqueda de nuevas especies para ser cultivadas. Nowadays, en la región del Bío Bío se potencia al Camarón de Roca como recurso cultivable. La presente investigación genera información base para desarrollar su cultivo, estableciendo parámetros de diversidad genética de sus poblaciones naturales y determinando su grado de estructuración genética. Para ello se utilizaron marcadores moleculares tipo RAPD (Random Amplified Polimorphic DNA) y el gen mitocondrial de la Citocromo Oxidasa subunidad I (COI). Las zonas de muestreadas fueron Guayacán (29°58’0,02”S, 71°21’0,312”W), Zapallar (32º33’01,5”S, 71º27’35,6”W) y Chome (36º46’26”S; 73º12’47”W). De un total de 186 individuos colectados, 170 fueron genotipados con 5 primer RAPD identificándose 34 fragmentos polimórficos. En cuanto a COI se analizaron 54 secuencias que contienen 18 haplotipos. Los resultados de los estadísticos genéticos en el caso de los marcadores RAPD (GST, FST (θ) y Nm) al comparar todas las poblaciones fueron de 0...

Application of recent biotechnologies to prunus tree crop genetic improvement

Martínez-Gómez, Pedro; Sánchez-Pérez, Raquel; Rubio, Manuel; Dicenta, Federico
Fonte: Universidad Católica de Chile Publicador: Universidad Católica de Chile
Tipo: Artículo Formato: 94114 bytes; application/pdf
ENG
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56.2%
24 pages, 4 tables.; [EN] Promising tools for Prunus breeding include germplasm introgression, molecular marker development and improved propagation and gene transfer techniques. In germplasm introgression, the introduction of genes from related Prunus species conferring agronomically valuable traits such as self-compatibility, improved growth habit, drought resistance, and higher kernel quality are being pursued. The analyses of twin seeds (two embryos within the same seedcoat) are facilitating genetic and cytogenetic studies. Useful propagation methods include in-vitro techniques for the evaluation of plant material, and invivo micrograft techniques that allow the early propagation of high-risk genotypes. In addition, plant growth under controlled environments, including the induction of an artificial rest period using cold chambers, provides a useful strategy for obtaining vigorously growing plants all the year round. Molecular markers have also become an essential tool in Prunus genetic improvement studies. Different types of molecular markers, including isoenzymes, RFLPs, RAPDs, AFLPs and SSRs, have been employed for the genetic characterization of germplasm, the establishment of genetic relationships between cultivars and species...

Genética de la introgresión de genes del almendro (prunus dulcis Mill.) en el melocotonero [P. persica (l.) Batsch]: desarrollo de una estrategia de selección de líneas casi isogénicas (Nils) con marcadores moleculares

Donoso Contreras, José M.
Fonte: [Barcelona] : Universitat Autònoma de Barcelona, Publicador: [Barcelona] : Universitat Autònoma de Barcelona,
Tipo: Tesis i dissertacions electròniques; info:eu-repo/semantics/doctoralThesis; info:eu-repo/semantics/publishedVersion Formato: application/pdf
Publicado em //2014 SPA
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66.23%
El melocotonero es el frutal de hueso más importante a nivel mundial, y el tercer árbol de fruta dulce cultivada después del manzano y el peral. A nivel genético es una de las especies mejor caracterizadas de la familia Rosaceae. El melocotonero presenta un bajo nivel de variabilidad genética pero es sexualmente compatible con otras especies de Prunus, como el almendro, los cuales podrían ser una posible fuente de nuevos genes para enriquecer su pool genético. Estudiamos un conjunto de caracteres asociados a la flor, fenología, calidad de fruta, morfología de la hoja y la resistencia a enfermedades en dos poblaciones de almendro (‘Texas') x melocotonero (‘Earlygold'): una F2 (TxE) y un BC1 (T1E) del parental ‘Earlygold'. Tres mapas genéticos de alta densidad se construyeron utilizando un chip de SNP de 9K y 131 marcadores microsatélite: el mapa F2 (llamado TxE) y los mapas de los parentales del BC1 denominados T1E (para el híbrido) y E (para ‘Earlygold'). La comparación del mapa intraespecífico de E con los mapas interespecíficos de TxE y T1E mostró una mayor tasa de recombinación en los cruzamientos intraespecíficos que en los cruzamientos interespecíficos. El mapa de E presentó aproximadamente la mitad de su genoma sin marcadores polimórficos...

Genómica bovina: Dónde estamos. Hacia dónde vamos

Corva,Pablo M
Fonte: BAG. Journal of basic and applied genetics Publicador: BAG. Journal of basic and applied genetics
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/12/2010 ES
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Las tecnologías basadas en el análisis de ADN con aplicación en producción animal han experimentado un enorme desarrollo, como resultado del crecimiento de la investigación en genómica en todas las especies. Las aplicaciones concretas son el aprovechamiento de la variabilidad del ADN para la caracterización de poblaciones y la identificación animal, la detección de portadores de variantes alélicas indeseables y la selección asistida por marcadores. Esta última es la aplicación que más expectativas ha despertado en el sector productivo. En este caso, la información obtenida directamente del ADN del individuo permitiría reducir la necesidad de información fenotípica, lo que a su vez tendría un impacto directo sobre la tasa de progreso genético al aumentar la precisión y disminuir el intervalo generacional. El descubriendo progresivo de cada vez más genes involucrados en variables productivas llevó a la construcción de paneles de marcadores que son validados y rápidamente transferidos al sector productivo. El proceso tiende hacia la denominada selección genómica, en la cual la asociación con un alto número de marcadores intenta capturar simultáneamente el efecto de todos los genes que afectan una variable. En Argentina...

Desarrollo de germoplasma de soja sin lipoxigenasas y factores antinutricionales

Bologna,S.B; Rojas,E; Soldini,D.O; Gilli,J.R; Sequin,L; Martínez Alvarez,D.L
Fonte: BAG. Journal of basic and applied genetics Publicador: BAG. Journal of basic and applied genetics
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/06/2014 ES
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56.16%
El principal objetivo de los programas de mejoramiento genético de soja ha sido el incremento del potencial productivo en tanto que se han dedicado menores esfuerzos al mejoramiento de las características que definen la calidad del grano. En el actual marco de globalización, los mercados comienzan a demandar alimentos con calidad diferencial para ofrecer productos con valor nutritivo y con características organolépticas aceptables. Con el objetivo de desarrollar germoplasma de soja con atributos de calidad, la E.E.A. INTA Marcos Juárez y la Universidad Nacional de San Luis (UNSL) llevan a cabo investigaciones que generan variabilidad para factores antinutricionales y lipoxigenasas, a fin de seleccionar genotipos nulos para dichos caracteres. En el año 2006, en la E.E.A. INTA Marcos Juárez se realizó un cruzamiento biparental entre un genotipo convencional -triple nulo para lipoxigenasas 1, 2 y 3- y una línea convencional nula para el inhibidor de la tripsina, portadora del gen Kti que previene la acumulación de los factores antinutricionales Kunitz. En el Departamento de Ciencias Agropecuarias de la UNSL, se desarrollaron poblaciones segregantes (F2-F6) y se estimaron parámetros genéticos. Se realizó selección asistida por marcadores moleculares (MAS) para detectar la ausencia de lipoxigenasas y factores antinutricionales. Por último se exploró la variabilidad en las líneas avanzadas seleccionadas y se las caracterizó agronómicamente. Los parámetros genéticos utilizados fueron eficientes herramientas para la selección de genotipos superiores en las poblaciones segregantes y la utilización de los marcadores moleculares diseñados facilitó la identificación rápida y eficiente de germoplasma sin lipoxigenasas y factores antinutricionales Kunitz.

Avances y perspectivas sobre el mapeo genético de la resistencia a las pudriciones de la raíz en frijol común

Méndez-Aguilar,R; Reyes-Valdés,MH; Mayek-Pérez,N
Fonte: Phyton (Buenos Aires) Publicador: Phyton (Buenos Aires)
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/12/2013 ES
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El frijol común es originario de México y es la fuente de proteínas más importante en la alimentación de millones de mexicanos, particularmente los de bajos ingresos económicos. El rendimiento de grano del cultivo es afectado principalmente por una serie de enfermedades causadas por hongos, bacterias y virus. Entre ellas, se destacan las pudriciones de la raíz causadas por los géneros Macrophomina y Fusarium. En la actualidad, con herramientas de la biología molecular como los marcadores moleculares de ADN, es posible desarrollar mapas genéticos donde se ubican QTLs y marcadores moleculares ligados a los genes de resistencia a dichos hongos. La importancia del desarrollo de los mapas genéticos radica en que constituyen el paso previo a la selección asistida por marcadores moleculares (SAMM). En este trabajo se revisa el panorama actualizado de los estudios sobre mapeo genético de genes de resistencia a las pudriciones de la raíz del frijol común causadas por los hongos M. phaseolina y Fusarium sp. Se incluyen los casos exitosos que se traducen en futuras aplicaciones en la SAMM para hacer más eficiente el mejoramiento genético del frijol a dichos patógenos en términos de costos, trabajo y efectividad. Finalmente...

Herramientas para un programa de mejoramiento genético del Guayabo (Psidium guajava L.) en Cuba

Valdés-Infante,Juliette; Nerdo Rodríguez,Narciso; Velásquez,Bárbara; Gaspar Sourd,Darío; González,Gonzalo; Rodríguez,Julio Alberto; Rohde,Wolfgang
Fonte: Agronomía Costarricense Publicador: Agronomía Costarricense
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/12/2012 ES
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66.2%
El objetivo del presente trabajo es desarrollar un programa de mejoramiento genético del guayabo (Psidium guajava L.) en Cuba, que contribuya a un uso más eficiente de los recursos fitogenéticos del cultivo. El mismo comienza a partir de la colección, con la prospección de genotipos autóctonos, la introducción de accesiones y parientes silvestres con origen geográfico diverso. Dichas actividades son vitales para el posterior enriquecimiento y mantenimiento de la colección, unido a las diferentes formas de propagación sexual y asexual que garantizan la multiplicación del material y permiten crear nuevas fuentes de variabilidad y una vez establecida, se procede a su caracterización. Para esto se refieren un grupo de descriptores mínimos que pueden ser útiles para homogenizar estudios de este tipo a nivel internacional y para la confección de catálogos de cultivares, con gran demanda por parte de productores y especialistas. Para el manejo racional del germoplasma es necesario conocer la variabilidad existente; en este sentido, se recomiendan caracteres morfológicos altamente discriminativos así como marcadores moleculares AFLP y SSR, cuya combinación permite identificar accesiones y formar grupos de diversidad, no solo en guayabo sino también en otros representantes de Myrtaceae. Todo este análisis integral garantiza un proceso de selección más eficiente de genotipos promisorios para diferentes propósitos (mejoramiento...

Los Marcadores Moleculares en el Mejoramiento Genético de la Resistencia a Enfermedades del Frijol (Phaseolus vulgaris L.): Aplicaciones y Perspectivas

Gill-Langarica,Homar René; Mayek-Pérez,Netzahualcoyotl
Fonte: Sociedad Mexicana de Fitopatología A.C. Publicador: Sociedad Mexicana de Fitopatología A.C.
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/01/2008 ES
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126.42%
Se enfatiza la aplicación de estrategias de selección asistida por marcadores moleculares (SAMM) en el mejoramiento genético de la resistencia al estrés biótico y abiótico en frijol común. La incorporación de genes de resistencia dentro de un área geográfica particular es un método tradicional de mejoramiento, generalmente poco durable debido a que se manejan uno o algunos genes con efectividad total hacia algunas razas o genes de avirulencia pero restringida en el espectro de resistencia efectiva. Ello obliga a la incorporación continua de nuevos genes en los programas. La combinación de diferentes genes de resistencia a estrés con base en pocos cruzamientos y pocas generaciones filiales de evaluación proporcionará una resistencia durable y estable. En frijol común esto se logrará con el uso de estrategias tales como la piramidación de genes, la cual será más efectiva en la medida que se utilice la SAMM combinada con la selección tradicional y permitirá al mejoramiento rápido y efectivo de loci de caracteres cuantitativos. Los marcadores genéticos moleculares ofrecen el apoyo en el desarrollo de nuevas variedades de frijol en México con resistencia durable a las enfermedades y otros factores adversos en tiempos cortos...

'Dalia', nueva variedad de frijol de grano tipo Flor de Junio para la región centro de México

Acosta-Gallegos,Jorge Alberto; Montero-Tavera,Víctor; Jiménez-Hernández,Yanet; Anaya-López,José Luis; Gonzalez-Chavira,Mario Martín
Fonte: Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias Publicador: Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/03/2014 ES
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56.1%
El frijol tipo Flor de Junio, cuyo color de grano es de fondo crema con franjas rosas, se produce y consume en la región Centro de México. Se describe el proceso de obtención y características de Dalia, una nueva variedad de frijol tipo Flor de Junio de raza Jalisco, derivada de la cruza de Flor de Junio Silvia por Flor de Mayo Anita realizada en el Campo Experimental Bajío en 2003. El proceso de selección se basó inicialmente en la sanidad y el ciclo de la planta, así como en las características comerciales del grano en siembras bajo condiciones alternas de riego y temporal. En su fase final se realizó selección asistida por marcadores moleculares (SAM) para seleccionar la progenie que tuviera simultáneamente los marcadores ROC11 y SW13, ligados a los genes I y bc3, cuya piramidación confieren resistencia a todos los patotipos de los virus BCMV y BCMNV. Dalia es de hábito de crecimiento indeterminado tipo 3, con guías de tamaño medio y ciclo de cultivo intermedio de 105 días de siembra a la madurez fisiológica, y resistente a BCMV y BCMNV. En un ensayo nacional de rendimiento y adaptación, Dalia mostró un rendimiento similar a Flor de Junio Marcela, la variedad dominante en el mercado, pero en contraste con ésta...

Retos y oportunidades en la selección asistida de frijol resistente a BCMV y BCMNV en México: I. Dimensión del problema

Anaya-López,José Luis; Silva-Rosales,Laura; Montero-Tavera,Víctor; Espejel,Fulgencio; Acosta-Gallegos,Jorge Alberto
Fonte: Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias Publicador: Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/05/2015 ES
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96.38%
Las enfermedades del frijol conocidas como mosaico común y raíz negra, causadas por el virus del mosaico común del frijol (BCMV) y el virus necrótico del mosaico común del frijol (BCMNV), tienen cada vez mayor incidencia en México. El BCMV está ampliamente distribuido en casi todas las regiones productoras, y el BCMNV preferentemente en las regiones tropicales. Ambos virus producen síntomas similares y pueden transmitirse por áfidos o por semilla proveniente de plantas infectadas, por lo que su incidencia está relacionada con el cultivo de variedades susceptibles y las condiciones climáticas que favorecen la presencia de insectos vectores. El control de BCMV y BCMNV puede lograrse mediante programas de certificación de semilla libre de enfermedades y el uso de variedades resistentes. La forma más económica de prevenir daños es sembrar variedades con resistencia durable obtenida mediante la piramidación de genes, en la que se combina una resistencia de amplio espectro contra patogrupos de BCMV y BCMNV. Este proceso de mejoramiento puede facilitarse mediante el uso de selección asistida por marcadores moleculares en combinación con la confrontación directa de los virus. El objetivo es dilucidar la problemática en torno a la incidencia del BCMV y BCMNV en las principales regiones productoras de frijol para identificar los retos y oportunidades en la selección asistida de frijol resistente a BCMV y BCMNV.

Retos y oportunidades en la selección asistida de frijol resistente a BCMV y BCMNV en México: II. Oportunidades para la selección asistida

Anaya-López,José Luis; Espejel,Fulgencio; Montero-Tavera,Víctor; Acosta-Gallegos,Jorge Alberto; Silva-Rosales,Laura
Fonte: Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias Publicador: Instituto Nacional de Investigaciones Forestales, Agrícolas y Pecuarias
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/05/2015 ES
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66.46%
Considerando información reciente, el objetivo fue revisar el conocimiento de los mecanismos de resistencia a BCMV y BCMNV, describir el uso de marcadores de ADN para la selección asistida de variedades de frijol resistentes a ambos virus y señalar la necesidad de diseñar y generar marcadores moleculares más eficientes. La forma más económica y eficiente para prevenir los daños causados por ambos virus es sembrar variedades resistentes obtenidas mediante la piramidación de genes, en la que se combine una resistencia de amplio espectro contra los patogrupos de BCMV y BCMNV. Desde hace más de 30 años se conoce la función del gen dominante I, que confiere resistencia a cepas no necróticas, y de los genes recesivos bc, que incluyen bc-u, bc-1, bc-1², bc-2, bc-2², y bc-3, que confieren resistencia específica a algunos patogrupos de BCMV y BCMNV. Sin embargo, a excepción del gen bc-3 que corresponde al gen PveIF4E, se desconoce la identidad de todos ellos. En relación al gen bc3 se han identificado al menos tres alelos, bc3¹, bc3² y bc3³, de los cuales solo el alelo bc3², en combinación con el gen I, confiere inmunidad a la cepa NL3 de BCMNV. Hasta el presente, los dos marcadores moleculares más utilizados para monitorear resistencia a BCMV: ROC11 y SW13 no han sido consistentes a través de germoplasma diverso. Por esta razón es necesario desarrollar nuevos o marcadores de resistencia adicionales basados en el conocimiento de la función biológica de los genes correspondientes.

Marcador RAPD asociado a la resistencia a Fusarium oxysporum en Musa

Zambrano,Asia Y; Martínez,Gustavo; Gutiérrez,Zulay; Manzanilla,Edwin; Vicente-Villardón,José Luís; Demey,Jhonny R
Fonte: ASOCIACIÓN INTERCIENCIA Publicador: ASOCIACIÓN INTERCIENCIA
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/11/2007 ES
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56.1%
La marchitez por Fusarium constituye una de las enfermedades más destructivas en Musa, siendo causada por el hongo del suelo Fusarium oxysporum f. sp. cubense. No se cuenta con control químico disponible, siendo la única medida posible la utilización de genotipos resistentes/tolerantes al patógeno. El desarrollo de las técnicas moleculares ha permitido la determinación de marcadores asociados a determinadas condiciones de importancia económica, constituyendo una estrategia de selección rápida, confiable y reproducible que acelera el mejoramiento a través del conocimiento, en estadios tempranos, de la reacción a una característica dada y su interacción con el genotipo. En este estudio se determinó un marcador RAPD asociado a la resistencia de Musa a F. oxysporum utilizando ocho clones susceptibles y diez clones resistentes/tolerantes evaluados en el campo para la reacción a la enfermedad. Se encontró que el patrón obtenido con el iniciador OPK-03 produjo un fragmento de amplificación específico de 485pb presente en los clones susceptibles y ausente en los clones resistentes/tolerantes. El estudio de las relaciones genéticas entre genotipos susceptibles y los resistentes/tolerantes a F. oxysporum, empleando iniciadores RAPD...

Recuperación del genoma del padre recurrente en un programa de retrocruzas asistido por marcadores en arroz

Arnao,Erika; Borges,Orangel; Ramis,Catalina; Díaz,Antonio; Galindo,Iván
Fonte: ASOCIACIÓN INTERCIENCIA Publicador: ASOCIACIÓN INTERCIENCIA
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/06/2006 ES
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La piricularia (Pyricularia grisea (Cooke) Sacc.) es una de las enfermedades más destructivas del arroz a nivel mundial. El uso de cultivares resistentes es la vía más efectiva y económica de controlar la enfermedad. El método de la retrocruza es el más empleado para la incorporación de genes simples de resistencia. Sin embargo, el proceso se dificulta cuando existe ligamiento de estos genes con características indeseables, el cual puede ser difícil de romper, aún después de muchas generaciones de retrocruzas. La selección asistida por marcadores (SAM) contribuye a facilitar la recuperación del genoma del padre recurrente (PR) en un menor número de generaciones. El objetivo del presente estudio fue la recuperación del genoma del PR utilizando marcadores moleculares en generaciones tempranas de un programa de retrocruzas para la incorporación de un gen de resistencia a P. grisea. En los parentales se evaluaron 36 microsatélites ubicados en los 12 cromosomas del arroz; aquellos que mostraron polimorfismo se evaluaron en plantas de las generaciones RC2F2 y RC3F1. La SAM permitió identificar plantas 100% similares al PR para los loci evaluados en ambas generaciones de retrocruzas; sin embargo, la proporción fue mayor en la RC3F1 que en RC2F2. Se identificaron regiones cromosómicas candidatas en los cromosomas 4 y 7 para la futura identificación del gen de resistencia incorporado. La aplicación de SAM en el programa de retrocruzas permitió la recuperación del genoma del PR en pocas generaciones...