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A mixed model QTL analysis for sugarcane multiple-harvest-location trial data

Pastina, M. M.; Malosetti, M.; Gazaffi, R.; Mollinari, M.; Margarido, G. R. A.; Oliveira, K. M.; Pinto, L. R.; Souza, A. P.; van Eeuwijk, F. A.; Garcia, A. A. F.
Fonte: SPRINGER; NEW YORK Publicador: SPRINGER; NEW YORK
Tipo: Artigo de Revista Científica
ENG
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37.12%
Sugarcane-breeding programs take at least 12 years to develop new commercial cultivars. Molecular markers offer a possibility to study the genetic architecture of quantitative traits in sugarcane, and they may be used in marker-assisted selection to speed up artificial selection. Although the performance of sugarcane progenies in breeding programs are commonly evaluated across a range of locations and harvest years, many of the QTL detection methods ignore two- and three-way interactions between QTL, harvest, and location. In this work, a strategy for QTL detection in multi-harvest-location trial data, based on interval mapping and mixed models, is proposed and applied to map QTL effects on a segregating progeny from a biparental cross of pre-commercial Brazilian cultivars, evaluated at two locations and three consecutive harvest years for cane yield (tonnes per hectare), sugar yield (tonnes per hectare), fiber percent, and sucrose content. In the mixed model, we have included appropriate (co)variance structures for modeling heterogeneity and correlation of genetic effects and non-genetic residual effects. Forty-six QTLs were found: 13 QTLs for cane yield, 14 for sugar yield, 11 for fiber percent, and 8 for sucrose content. In addition...

Mapping of angular leaf spot resistance QTL in common bean (Phaseolus vulgaris L.) under different environments

Oblessuc, Paula Rodrigues; Baroni, Renata Moro; Garcia, Antonio Augusto Franco; Chioratto, Alisson Fernando; Carbonell, Sergio Augusto Morais; Camargo, Luis Eduardo Aranha; Benchimol, Luciana Lasry
Fonte: BIOMED CENTRAL LTD; LONDON Publicador: BIOMED CENTRAL LTD; LONDON
Tipo: Artigo de Revista Científica
ENG
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37.12%
Background: Common bean (Phaseolus vulgaris L.) is the most important grain legume for human diet worldwide and the angular leaf spot (ALS) is one of the most devastating diseases of this crop, leading to yield losses as high as 80%. In an attempt to breed resistant cultivars, it is important to first understand the inheritance mode of resistance and to develop tools that could be used in assisted breeding. Therefore, the aim of this study was to identify quantitative trait loci (QTL) controlling resistance to ALS under natural infection conditions in the field and under inoculated conditions in the greenhouse. Results: QTL analyses were made using phenotypic data from 346 recombinant inbreed lines from the IAC-UNA x CAL 143 cross, gathered in three experiments, two of which were conducted in the field in different seasons and one in the greenhouse. Joint composite interval mapping analysis of QTL x environment interaction was performed. In all, seven QTLs were mapped on five linkage groups. Most of them, with the exception of two, were significant in all experiments. Among these, ALS10.1(DG,UC) presented major effects (R-2 between 16% - 22%). This QTL was found linked to the GATS11b marker of linkage group B10, which was consistently amplified across a set of common bean lines and was associated with the resistance. Four new QTLs were identified. Between them the ALS5.2 showed an important effect (9.4%) under inoculated conditions in the greenhouse. ALS4.2 was another major QTL...

Ocorrência de interações QTL x Sexo, de epistasias e de QTLs pleiotrópicos em aves (Gallus gallus); QTL by Sex Interactions, epistasis and pleiotropic QTLs in chicken (Gallus gallus)

Pinto, Luis Fernando Batista
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 27/04/2007 PT
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37.25%
Este estudo teve por objetivo mapear QTLs para características de desempenho e de carcaça em Gallus gallus . Foram estudadas 350 aves F2 oriundas de um cruzamento, na primeira geração, de machos de corte da linhagem TT com fêmeas de postura da linhagem CC. O peso vivo com 1, 35 e 42 dias de idade; o ganho de peso, o consumo de ração e a conversão alimentar de 35 a 41 dias de idade; os pesos dos pulmões, fígado, coração, moela, peito, coxas (peso de coxas e sobre-coxas), carcaça (sem vísceras, pés e cabeça), carcaça residual (peso da carcaça sem peito, asas e coxas), asas, cabeça, pés e gordura abdominal; o comprimento do intestino e o percentual de hematócrito, foram os fenótipos analisados. Foram utilizados 79 marcadores microssatélites, os quais cobriram 1510,7 cM dos cromossomos 1, 2, 3, 4, 5, 8, 11 e 13. Primeiramente, foram realizadas análises isoladas de cada fenótipo original e de variáveis canônicas obtidas por análise de componentes principais dos fenótipos. O teste razão de verossimilhanças (LRT) entre um modelo incompleto (apenas com efeitos fixos de sexo, incubação e o efeito aleatório de valor genético infinitesimal) e um completo (todos os efeitos anteriores mais os efeitos de QTL) foi o procedimento utilizado nas análises...

Estudo da herança dos caracteres stay-green, produção e seus componentes em milho utilizando o delineamento III e mapeamento de QTL; Inheritance study of stay-green, yield and its components in maize using the design III and QTL mapping

Belicuas, Pedro Radi
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 18/02/2009 PT
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37.23%
A cultura do milho é uma das atividades agrícolas de maior importância no Brasil. O país é o terceiro maior produtor mundial e a produtividade média passou de 1800 kg ha-1 para 3000 kg ha-1 nos últimos 15 anos. A produção de grãos e a tolerância à seca são caracteres complexos e de difícil seleção e uma possibilidade para se aumentar a eficiência dos programas de melhoramento que visam o incremento da produção de grãos e a tolerância à seca seria através da seleção indireta para caracteres relacionados a elas como o stay-green e os componentes da produção. O presente trabalho teve por objetivo estudar os caracteres stay-green, produção de grãos e seus componentes em milho com a finalidade de reunir informações sobre a herança desses caracteres. Para tanto foi utilizada uma população obtida pelo cruzamento das linhagens L-14-04 B e L-08- 05 F, contrastantes para diversos caracteres. Progênies F2:3 derivadas desses cruzamento foram retrocruzadas com as linhagens parentais formando dois conjuntos com 250 progênies de retrocruzamento cada. Essas progênies foram avaliadas em até seis ambientes segundo o delineamento de látice simples 10x10 para os caracteres produção de grãos (PG), e seus componentes: comprimento de espiga (CE)...

Uma abordagem bayesiana para mapeamento de QTLs em populações experimentais; A Bayesian approach for mapping QTL in experimental populations

Meyer, Andréia da Silva
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 03/04/2009 PT
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37.24%
Muitos caracteres em plantas e animais são de natureza quantitativa, influenciados por múltiplos genes. Com o advento de novas técnicas moleculares tem sido possível mapear os locos que controlam os caracteres quantitativos, denominados QTLs (Quantitative Trait Loci). Mapear um QTL significa identificar sua posição no genoma, bem como, estimar seus efeitos genéticos. A maior dificuldade para realizar o mapeamento de QTLs, se deve ao fato de que o número de QTLs é desconhecido. Métodos bayesianos juntamente com método Monte Carlo com Cadeias de Markov (MCMC), têm sido implementados para inferir conjuntamente o número de QTLs, suas posições no genoma e os efeitos genéticos . O desafio está em obter a amostra da distribuição conjunta a posteriori desses parâmetros, uma vez que o número de QTLs pode ser considerado desconhecido e a dimensão do espaço paramétrico muda de acordo com o número de QTLs presente no modelo. No presente trabalho foi implementado, utilizando-se o programa estatístico R uma abordagem bayesiana para mapear QTLs em que múltiplos QTLs e os efeitos de epistasia são considerados no modelo. Para tanto foram ajustados modelos com números crescentes de QTLs e o fator de Bayes foi utilizado para selecionar o modelo mais adequado e conseqüentemente...

Modelos estatísticos para mapeamento de QTL associados a dados de contagem; Statistical models for QTL mapping associated to counting data

Kamogawa, Karen Pallotta Tunin
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 15/05/2009 PT
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37.21%
Este estudo teve por objetivo analisar e comparar metodologias estatísticas para fins de mapeamento de QTL associados à resistência a ectoparasitas em bovinos. Os animais, submetidos à infestação artificial, foram periodicamente avaliados por contagens, como número de carrapatos. Estes dados se caracterizam como medidas repetidas e, via de regra, não atendem ou atendem parcialmente as exigências usuais da análise, para mapeamento de QTL, dentre elas a de apresentar distribuição normal e independência dos erros. Ainda não está bem definido qual seria a melhor estratégia para analisar dados com o perfil descrito. Algumas alternativas seriam transformações de dados que permitam o uso dos programas já disponíveis, ou o desenvolvimento de programas que utilizem outras distribuições como Poisson ou Poisson inflada de zeros (ZIP). Esta proposta está inserida na parceria entre EMBRAPA - Gado de Leite e a ESALQ/USP, para desenvolvimento do projeto de mapeamento de QTL em bovinos mestiços (Gir x Holandês), para várias características incluindo a resistência a parasitas. Foram utilizados 263 animais F2, genotipados com 5 marcadores moleculares no cromossomo 23, na tentativa de mapear QTL para característica de resistência a carrapatos. Dados coletados naquela população F2 e dados simulados em diferentes cenários...

Mapeamento e congruência de QTL para teor de óleo, produção de grãos e seus componentes em milho; Mapping QTL and congruence for oil content, grain yield and its components in maize

Chaves, Luciana Gonçalves
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 14/08/2013 PT
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37.3%
O principal desafio para o desenvolvimento de híbridos contendo alto teor de óleo é a correlação negativa entre este caráter e a produção de grãos. O conhecimento da herança do caráter teor de óleo e da produção de grãos e seus componentes conjuntamente podem auxiliar a condução de programas de melhoramento que visam ao desenvolvimento de genótipos produtivos e com alto teor de óleo. Assim, os objetivos desta pesquisa foram: estimar parâmetros genéticos; mapear QTL e a congruência destes para os caracteres teor de óleo (OL), produção de grãos (PG) e seus componentes. Duzentas e cinquenta e seis progênies F2:3 obtidas do cruzamento de duas linhagens endogâmicas contrastantes para teor de óleo foram avaliadas em experimentos com repetições. O mapeamento de QTL foi realizado considerando um mapa genético com 139 marcadores microssatélites e mapeamento por intervalo composto expandido para múltiplos ambientes (mCIM). As estimativas de variância genética de progênies e coeficientes de herdabilidade diferiram de zero para todos os caracteres. Os coeficientes de herdabilidade apresentaram magnitudes elevadas para todos os caracteres. A estimativa de variância progênies por ambientes foi significativa para PG e seus componentes. As correlações entre OL e os caracteres PG e seus componentes não foram significativas. Os caracteres prolificidade (PROL)...

Modelo oculto de Markov para imputação de genótipos de marcadores moleculares: Uma aplicação no mapeamento de QTL utilizando a abordagem bayesiana; Hidden Markov model for imputation of genotypes of molecular markers: An application in QTL mapping using Bayesian approach

Medeiros, Elias Silva de
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 28/08/2014 PT
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37.15%
Muitas são as características quantitativas que são, significativamente, influenciadas por fatores genéticos, em geral, existem vários genes que colaboram para a variação de uma ou mais características quantitativas. As informações ausentes a respeito dos genótipos nos marcadores moleculares é um problema comum em estudo de mapeamento genético e, por conseguinte, no mapeamento dos locus que controlam estas características fenotípicas (QTL). Os dados que não foram observados ocorrem, principalmente, devido a erros de genotipagem e de marcadores não informativos. Para solucionar este problema foi utilizado o método do modelo oculto de Markov para inferir estes dados. Os métodos de acurácias evidenciaram o sucesso da aplicação desta técnica de imputa- ção. Uma vez imputado, na inferência bayesiana estes dados não serão mais tratados como uma variável aleatória resultando assim, numa redução no espaço paramétrico do modelo. Outra grande dificuldade no mapeamento de QTL se deve ao fato de que não se conhece ao certo a quantidade destes que influenciam uma dada característica, fazendo com que surjam diversos problemas, um deles é a dimensão do espaço paramétrico e, consequentemente, a obtenção da amostra a posteriori. Assim...

Desenvolvimento de modelos de causalidade com informações de QTLs para estudo do relacionamento de caracteres fenotípicos relativos à absorção de fósforo em milho; Development of causal models with QTL information to the study of relationship among traits associated with phosphorus uptake in maize

Gianotto, Adriana Cheavegatti
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 26/03/2015 PT
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37.2%
Metodologias de mapeamento de QTLs modernas empregam abordagem multivariada e se beneficiam da matriz de covariâncias fenotípicas para melhorar as estimativas de localização e efeitos de QTLs. No entanto, a correlação fenotípica pode ser em parte atribuída às relações de causalidade entre os fenótipos e mesmo as abordagens de mapeamento de QTLs multivariadas atuais têm desconsiderado tais relacionamentos. Dentre as metodologias científicas desenvolvidas para o estudo da causalidade em dados observacionais, destacam-se os modelos de equações estruturais e os modelos gráficos. Neste trabalho, foi estudado um conjunto de caracteres fenotípicos relacionados à morfologia de raízes, absorção de fósforo e acúmulo de biomassa em uma população composta de 145 linhagens endogâmicas recombinantes (RILs) do programa de melhoramento de milho da EMBRAPA Milho e Sorgo. O mapeamento de QTLs para os caracteres fenotípicos foi realizado utilizando mapeamento de múltiplos intervalos univariado (MIM) e multivariado (MT-MIM). A análise MIM revelou QTLs afetando diâmetro de raízes, área de superfície de raízes finas, peso seco da parte aérea e concentração de fósforo na parte aérea e nas raízes. A análise MT-MIM revelou 12 QTLs...

QTL for percentage of carcass and carcass parts in a broiler x layer cross

Baron, E. E.; Moura, A. S. A. M. T.; Ledur, M. C.; Pinto, L. F. B.; Boschiero, C.; Ruy, D. C.; Nones, K.; Zanella, E. L.; Rosario, M. F.; Burt, D. W.; Coutinho, L. L.
Fonte: Wiley-Blackwell Publicador: Wiley-Blackwell
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: 117-124
ENG
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37.17%
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP); Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES); Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq); P>An F(2) experimental population, developed from a broiler layer cross, was used in a genome scan of QTL for percentage of carcass, carcass parts, shank and head. Up to 649 F(2) chickens from four paternal half-sib families were genotyped with 128 genetic markers covering 22 linkage groups. Total map length was 2630 cM, covering approximately 63% of the genome. QTL interval mapping using regression methods was applied to line-cross and half-sib models. Under the line-cross model, 12 genome-wide significant QTL and 17 suggestive linkages for percentages of carcass parts, shank and head were mapped to 13 linkage groups (GGA1, 2, 3, 4, 5, 7, 8, 9, 11, 12, 14, 18 and 27). Under the paternal half-sib model, six genome-wide significant QTL and 18 suggestive linkages for percentages of carcass parts, shank and head were detected on nine chicken linkage groups (GGA1, 2, 3, 4, 5, 12, 14, 15 and 27), seven of which seemed to corroborate positions revealed by the previous model. Overall, three novel QTL of importance to the broiler industry were mapped (one significant for shank% on GGA3 and two suggestive for carcass and breast percentages on GGA14 and drums and thighs percentage on GGA15). One novel QTL for wings% was mapped to GGA3...

Mapeamento de QTL para produção de grãos e caracters de planta em milho tropical utilizando marcadores microssatelites; Mapping QTL for grain yield and plant traits using microsatellite markers in a tropical maize population

Milena de Luna Alves Lima
Fonte: Biblioteca Digital da Unicamp Publicador: Biblioteca Digital da Unicamp
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 20/02/2006 PT
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37.31%
A maior parte dos caracteres de importância agronômica e econômica do milho estão sob o controle de diversos locos gênicos, denominados locos de caracteres quantitativos (QTL). A possibilidade do uso de marcadores moleculares e o aperfeiçoamento dos modelos estatístico-genéticos possibilitaram o mapeamento desses locos gênicos que afetam tais caracteres. Pouco enfoque no estudo de mapeamento de QTL foi dado em populações derivadas do germoplasma do milho tropical, o qual possui uma base genética ampla com maior diversidade do que o germoplasma temperado. Da mesma forma, pouco se conhece sobre as interações dos QTL nos diferentes ambientes (QTL X E). Duzentos e cinqüenta e seis progênies F2:3, derivadas do cruzamento de duas linhagens de milho tropical, foram avaliadas em cinco ambientes. O mapa genético foi desenvolvido com 139 marcadores microssatélites, utilizando o programa MAPMAKER/EXP versão 3.0b. As análises de mapeamento de QTL e a detecção da interação QTL X E foram realizadas utilizando o procedimento JZmapQTL do programa Windows QTL-Cartographer versão 2.5, que se baseia na análise de mapeamento em ambientes múltiplos (mCIM). A extensão total do mapa genético foi de 1.858,61 cM com intervalo médio entre marcadores de 13...

Construção de um mapa funcional e detecção de QTLs de importância econômica em uma população derivada de cruzamento bi-parental entre duas variedades comerciais em cana-de-açúcar = : Functional genetic map construction and QTL of economic importance detection in a derived bi-parental cross between two commercial sugarcane varieties; Functional genetic map construction and QTL of economic importance detection in a derived bi-parental cross between two commercial sugarcane varieties

Melina Cristina Mancini
Fonte: Biblioteca Digital da Unicamp Publicador: Biblioteca Digital da Unicamp
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 04/07/2014 PT
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37.15%
A crescente busca por variedades de cana-de-açúcar com maior produtividade e resistentes às principais doenças consiste em um importante objetivo para o sucesso de um programa de melhoramento. Assim, a utilização de marcadores moleculares na identificação de locos que controlam características quantitativas (QTLs ¿ Quantitative Trait Loci) vêm ganhando cada vez mais destaque no programas de melhoramento genético. A presente tese teve como objetivo contribuir para o conhecimento básico sobre a genética e a biologia molecular da cana-de-açúcar através da detecção de marcadores ligados a características quantitativas. Foi utilizado uma população de cana-de-açúcar contendo 240 indivíduos F1 derivada do cruzamento entre as variedades comerciais SP81-3250 e RB925345. Para detectar os QTLs foi necessário realizar estudos fenotípicos e genotípicos. Foram coletados dados fenotípicos para as características de produção (altura, diâmetro, número e peso dos colmos) e de qualidade (sólidos solúveis, teor de sacarose do caldo e do colmo, pureza do caldo, teor de fibra) por três anos (2011, 2012 e 2013) nos municípios de Araras e Ipaussu, estado de São Paulo. Através de modelos mistos foi estimada a média...

Mapeamento de QTL para resistência a carrapatos no cromossomo 23 de bovinos (BTA23).

TUNIN, K. P.; PACKER, I. U.; SILVA, M. V. G. B.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; MARTINEZ, M. L.
Fonte: In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Águas de Lindóia: SBG, 2007. Publicador: In: CONGRESSO BRASILEIRO DE GENÉTICA, 53., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Águas de Lindóia: SBG, 2007.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Formato: p. 272
PT_BR
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37.19%
Uma população experimental F2 de bovinos, originada do cruzamento das raças Gir x Holandês, foi genotipada para o cromossomo 23 (BTA23) utilizando cinco marcadores microssatélites distribuídos ao longo dos cromossomos, com um espaçamento médio de 25 cM entre eles. Os marcadores utilizados foram BM1258, BM1818, BM1905, BB705 e CSSM24, com os quais foi construído um mapa de ligação para o BTA23. Dessa população F2, 263 animais foram submetidos a infestação artificial pelo carrapato Boophilus microplus. Vinte e um dias após a infestação, foi contado o número de carrapatos (larvas engurgitadas) presentes em cada animal. Dois modelos estatísticos foram desenvolvidos com o auxílio do programa SAS para análise da variância e para fins de mapeamento de QTL, o primeiro modelo incluía como efeitos fixos a avaliação dos animais quanto à cor da pelagem (100% branca, mais de 75%, entre 50 a 75% e entre 25 a 50%), tipo de pêlo (curto liso, curto lanado, longo liso e longo lanado) e sexo e como covariáveis idade à infestação e estação (águas e seca); no outro modelo a covariável estação foi eliminada. As medidas da contagem de carrapatos foram submetidas a várias transformações, entre elas a raiz quadrada e logaritmo...

Mapeamento e validação de loci de caracteres quantitativos (QTL) para resistência a Cercospora zeae-maydis em milho tropical (Zea mays L.)

Pozar, Gilberto
Fonte: Universidade Federal de Uberlândia Publicador: Universidade Federal de Uberlândia
Tipo: Dissertação
POR
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37.25%
Resistência à infecção por C. zeae-maydis (Cz) está entre os objetivos mais importantes dos programas de melhoramento no Brasil. Os objetivos da presente pesquisa foram mapear e caracterizar Quantitative Trati Loci (QTL) relacionados com a resistência a Cz, validar as estimativas dos seus efeitos na severidade de Cz com uso de linhagens quase isogênicas (LQIs), e estimar os seus efeitos sobre três caracteres agronômicos importantes usando os seus respectivos híbridos quase isogênicos (HQIs), obtidos pelo cruzamento das LQIs com uma linhagem de um grupo heterótico complementar. Foram mapeados quatro QTL com LOD>2.5 dos quais três foram avaliados em LQIs. Foram avaliados dois QTL mapeados no cromossomo 1 em fase de repulsão, Q1 localizado no bin 1.05 e Q2 no bin 1.07, e um no cromossomo 3, Q3 localizado no bin 3.07. A avaliação das LQIs mostraram efeitos individuais altamente significativos para os três QTL na redução da severidade de Cz. Uma interação epistática desfavorável para a reação a Cz foi detectada entre Q1 e Q2, na qual o efeito de um dos alelos foi efetivamente anulado pelo outro. Alternativamente, a interação entre Q2 e Q3 foi positiva, promovendo a redução na severidade de Cz a um nível maior do que a soma de seus efeitos individuais. A avaliação das HQIs revelou efeitos individuais significativos para Q1 e Q3 na redução da severidade de Cz...

Identification de QTL à pression artérielle dans le chromosome 18 du rat et analyse des gènes candidats Adrb2 et Nedd4l associés à l’hypertension essentielle

Chauvet, Cristina
Fonte: Université de Montréal Publicador: Université de Montréal
Tipo: Thèse ou Mémoire numérique / Electronic Thesis or Dissertation
FR
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37.2%
L’hypertension constitue un facteur majeur de risque de maladies cardiovasculaires et touche à un pourcentage important de la population humaine. Il s’agit d’une maladie complexe étant donné son caractère multifactoriel. La régulation de la pression artérielle (PA) est sous contrôle de plusieurs gènes, appelés loci pour traits quantitatifs ou QTL, et elle est le résultat de leur interaction. Étant donné que la PA est un trait quantitatif sous contrôle de plusieurs composantes comme les facteurs génétiques et environnementaux, l’étude de l’hypertension est limitée chez les populations humaines. Ainsi la stratégie principale pour l’étude de cette maladie est l’identification de QTL à PA chez des souches congéniques de rat construites à partir des lignées hyper- et normotendues; à savoir les souches Dahl salt-sensitive [1] et Lewis, respectivement. Des études précédentes dans notre laboratoire ont localisé trois QTL à PA au niveau du chromosome 18 chez le rat. Au cours de ce projet, de nouvelles sous-souches ont été construites afin de raffiner la cartographie de ces QTL. Ainsi, les C18QTL1, C18QTL3 et C18QTL4 ont été définis. Des analyses moléculaires ont été effectuées sur deux gènes candidats pour le C18QTL3; à savoir...

QTL para estrés de alta temperatura y evolución experimental de hormesis en el modelo Drosophila; High temperature QTL and experimental evolution of hormesis in the Drosophila model

Gómez, Federico Hernán
Fonte: Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires Publicador: Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires
Tipo: info:eu-repo/semantics/doctoralThesis; tesis doctoral; info:eu-repo/semantics/publishedVersion Formato: application/pdf
Publicado em //2010 SPA
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37.35%
Drosophila melanogaster se encuentra distribuida en amplias zonas geográficas, desde regiones tropicales a templadas en la mayoría de los continentes. Diversos fenotipos adaptativos han evolucionado en este organismo modelo cosmopolita, dependiendo los individuos y las poblaciones de conjuntos de mecanismos de resistencia al estrés ambiental, tanto basales como inducibles para la adaptación a las condiciones climáticas variantes. La resistencia al estrés por calor, hambre y radiación representan fenotipos ecológicamente relevantes de adaptación a los ambientes en la etapa adulta del ciclo de vida de Drosophila. Se ha hallado que los tratamientos de estrés térmico con frecuencia inducen hormesis en la longevidad en varios organismos. Hormesis es un concepto fundamental en la biología evolutiva de la respuesta al estrés, siendo utilizado ampliamente para definir un fenómeno de respuesta de dosis sobre diversos caracteres, incluyendo la longevidad. El efecto de hormesis sobre la longevidad ocurre cuando la exposición a un factor de estrés moderado (ej., estrés por calor) extiende la longevidad de un organismo o bien reduce su tasa de senescencia o envejecimiento. La radiación ultravioleta (UV) es otra forma de estrés ambiental que...

Exploración de la arquitectura genética para la respuesta al frío y al etanol en el modelo Drosophila: líneas de selección y mapeo de QTL; Genetic architecture for the responses to cold and ethanol in Drosophila: selection lines and QTL mapping

Bertoli, Carlos Ignacio
Fonte: Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires Publicador: Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires
Tipo: info:eu-repo/semantics/doctoralThesis; tesis doctoral; info:eu-repo/semantics/publishedVersion Formato: application/pdf
Publicado em //2011 SPA
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37.29%
Las respuestas de los organismos a los distintos factores de estrés han sido objeto de estudio desde hace varias décadas. El interés que despertó esta área de conocimiento ha llevado a tomar diferentes enfoques para abordar un tema sumamente complejo como es la respuesta de un organismo a un factor de estrés. Tanto aspectos fisiológicos, como moleculares y genéticos entre otros aspectos, han sido considerados en estudios recientes para develar como es que los organismos responden a la presencia de un estresor. En esta tesis colaboramos, desde la genética cuantitativa, en la búsqueda de la base genética que permita entender más acabadamente que factores intervienen en la recuperación de un individuo cuando se lo expone al frío, así como cuales son los factores que permiten la recuperación y la tolerancia cuando son expuestos a altas concentraciones de etanol. También se buscan posibles correlaciones genéticas entre la recuperación al frío y otros caracteres de historia de vida así como de resistencia a distintas formas de estrés. Hemos hecho uso de un organismo experimental ampliamente utilizado en el área de la genética, Drosophila melanogaster. Asimismo, algunos experimentos también fueron desarrollados en otra especie del mismo género Drosophila...

Exploración de la arquitectura genética para la respuesta al frío y al etanol en el modelo Drosophila: líneas de selección y mapeo de QTL; Genetic architecture for the responses to cold and ethanol in Drosophila: selection lines and QTL mapping

Bertoli, Carlos Ignacio
Fonte: Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires Publicador: Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires
Tipo: Tesis Doctoral Formato: text; pdf
Publicado em //2011 ESPAñOL
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37.19%
Las respuestas de los organismos a los distintos factores de estrés han sido objeto de estudio desde hace varias décadas. El interés que despertó esta área de conocimiento ha llevado a tomar diferentes enfoques para abordar un tema sumamente complejo como es la respuesta de un organismo a un factor de estrés. Tanto aspectos fisiológicos, como moleculares y genéticos entre otros aspectos, han sido considerados en estudios recientes para develar como es que los organismos responden a la presencia de un estresor. En esta tesis colaboramos, desde la genética cuantitativa, en la búsqueda de la base genética que permita entender más acabadamente que factores intervienen en la recuperación de un individuo cuando se lo expone al frío, así como cuales son los factores que permiten la recuperación y la tolerancia cuando son expuestos a altas concentraciones de etanol. También se buscan posibles correlaciones genéticas entre la recuperación al frío y otros caracteres de historia de vida así como de resistencia a distintas formas de estrés. Hemos hecho uso de un organismo experimental ampliamente utilizado en el área de la genética, Drosophila melanogaster. Asimismo, algunos experimentos también fueron desarrollados en otra especie del mismo género Drosophila...

QTL para estrés de alta temperatura y evolución experimental de hormesis en el modelo Drosophila; High temperature QTL and experimental evolution of hormesis in the Drosophila model

Gómez, Federico Hernán
Fonte: Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires Publicador: Facultad de Ciencias Exactas y Naturales. Universidad de Buenos Aires
Tipo: Tesis Doctoral Formato: text; pdf
Publicado em //2010 ESPAñOL
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Drosophila melanogaster se encuentra distribuida en amplias zonas geográficas, desde regiones tropicales a templadas en la mayoría de los continentes. Diversos fenotipos adaptativos han evolucionado en este organismo modelo cosmopolita, dependiendo los individuos y las poblaciones de conjuntos de mecanismos de resistencia al estrés ambiental, tanto basales como inducibles para la adaptación a las condiciones climáticas variantes. La resistencia al estrés por calor, hambre y radiación representan fenotipos ecológicamente relevantes de adaptación a los ambientes en la etapa adulta del ciclo de vida de Drosophila. Se ha hallado que los tratamientos de estrés térmico con frecuencia inducen hormesis en la longevidad en varios organismos. Hormesis es un concepto fundamental en la biología evolutiva de la respuesta al estrés, siendo utilizado ampliamente para definir un fenómeno de respuesta de dosis sobre diversos caracteres, incluyendo la longevidad. El efecto de hormesis sobre la longevidad ocurre cuando la exposición a un factor de estrés moderado (ej., estrés por calor) extiende la longevidad de un organismo o bien reduce su tasa de senescencia o envejecimiento. La radiación ultravioleta (UV) es otra forma de estrés ambiental que...

Fatness QTL on chicken chromosome 5 and interaction with sex

Abasht, Behnam; Pitel, F.; Lagarrigue, S.; Le Bihan-Duval, E.; Le Roy, P.; Demeure, O.; Vignoles, F.; Simon, J.; Cogburn, L.; Aggrey, S. E. (Samuel E.); Vignal, A.; Douaire, M.
Fonte: EDP Sciences Publicador: EDP Sciences
Tipo: Artigo de Revista Científica
ENGLISH (UNITED STATES)
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Final published version; Quantitative trait loci (QTL) affecting fatness in male chickens were previously identified on chromosome 5 (GGA5) in a three-generation design derived from two experimental chicken lines divergently selected for abdominal fat weight. A new design, established from the same pure lines, produced 407 F2 progenies (males and females) from 4 F1-sire families. Body weight and abdominal fat were measured on the F2 at 9 wk of age. In each sire family, selective genotyping was carried out for 48 extreme individuals for abdominal fat using seven microsatellite markers from GGA5. QTL analyses confirmed the presence of QTL for fatness on GGA5 and identified a QTL by sex interaction. By crossing one F1 sire heterozygous at the QTL with lean line dams, three recombinant backcross 1 (BC1) males were produced and their QTL genotypes were assessed in backcross 2 (BC2) progenies. These results confirmed the QTL by sex interaction identified in the F2 generation and they allow mapping of the female QTL to less than 8 Mb at the distal part of the GGA5. They also indicate that fat QTL alleles were segregating in both fat and lean lines.; University of Delaware. Department of Animal and Food Sciences.