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Mineração e visualização de coleções de séries temporais; Mining and visualization of time series collections

Alencar, Aretha Barbosa
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 10/12/2007 PT
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75.8%
A análise de séries temporais gera muitos desafios para profisionais em um grande número de domínios. Várias soluções de visualização integrada com algoritmos de mineração já foram propostas para tarefas exploratórias em coleções de séries temporais. À medida que o conjunto de dados cresce, estas soluções falham em promover uma boa associação entre séries temporais similares. Neste trabalho, é apresentada uma ferramenta para a análise exploratória e mineração de conjuntos de séries temporais que adota uma representação visual baseada em medidas de dissimilaridade entre séries. Esta representação é criada usando técnicas rápidas de projeção, de forma que as séries temporais possam ser visualizadas em espaços bidimensionais. Vários tipos de atributos visuais e conexões no grafo resultante podem ser utilizados para suportar a exploração dessa representação. Também é possível aplicar algumas tarefas de mineração de dados, como a classificação, para apoiar a busca por padrões. As visualizações resultantes têm se mostrado muito úteis na identificação de grupos de séries com comportamentos similares, que são mapeadas para a mesma vizinhança no espaço bidimensional. Grupos visuais de elementos...

Árvores de classificação multivariadas fundamentadas em coeficientes de dissimilaridade e entropia.; Multivariate classification trees based on dissimilarity and entropy coefficients

Taconeli, Cesar Augusto
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 26/08/2008 PT
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65.98%
A análise estatística de grandes bancos de dados requer a utilização de metodologias flexíveis, capazes de produzir resultados esclarecedores e facilmente compreensíveis frente a dificuldades como a presença de números elevados de variáveis, diferentes graus de associações entre as mesmas e dados ausentes. A construção de árvores de classificação e regressão proporciona a modelagem de uma variável resposta, categorizada ou numérica, com base em um conjunto de covariáveis, sem esbarrar nas dificuldades mencionadas. A extensão multivariada de técnicas de classificação e regressão por árvores visa permitir a análise conjunta de duas ou mais variáveis respostas. Embora seja objeto de estudos recentes, a proposição de técnicas multivariadas de classificação e regressão por árvores tem sido verificada de maneira mais acentuada para situações em que se dispõe de múltiplas variáveis respostas numéricas. Propõemse, neste trabalho, novas alternativas para a construção de árvores de classificação multivariadas, visando analisar múltiplas variáveis respostas categorizadas. Tais alternativas baseiam-se em medidas de dissimilaridade e entropia. Por meio de um estudo de simulação, verificou-se o efeito das correlações e entropias das variáveis no desempenho das metodologias propostas (os resultados são melhores quanto maiores as entropias e correlações das variáveis sob estudo). A análise de dados de consumo de álcool e fumo dos habitantes do município de Botucatu-SP complementa o presente estudo...

Comparação entre medidas de distância genealógica, morfológica e molecular em aveia em experimentos com e sem a aplicação de fungicida

Vieira,Eduardo Alano; Carvalho,Fernando Irajá Félix de; Oliveira,Antônio Costa de; Benin,Giovani; Zimmer,Paulo Dejalma; Silva,José Antônio Gonzalez da; Martins,Andreza Figueirola; Bertan,Ivandro; Silva,Giovani Olegário da; Schmidt,Douglas André Mal
Fonte: Instituto Agronômico de Campinas Publicador: Instituto Agronômico de Campinas
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/01/2005 PT
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86.21%
A estimativa da divergência genética entre cultivares pode ser útil em um programa de melhoramento para o direcionamento de hibridações e o conhecimento do germoplasma disponível. O objetivo do trabalho foi estimar a dissimilaridade genética entre genótipos de aveia (Avena sativa), por meio de marcadores AFLP e do coeficiente de parentesco, e correlacionar essas estimativas entre si e com a estimativa da dissimilaridade genética a partir de caracteres agronômicos em experimentos com e sem a aplicação de fungicida. Onze cultivares de aveia foram utilizadas na estimativa da distância genética a partir de marcadores AFLP. Desses 11 genótipos, nove foram avaliados no campo em experimento com e sem fungicida, para a estimativa da divergência genética a partir de caracteres morfológicos. Para a estimativa dos coeficientes de parentesco foram utilizados oito, dentre nove genótipos coincidentes entre as avaliações dos caracteres agronômicos e molecular, que possuem genealogia conhecida. Posteriormente, efetuou-se a comparação entre as matrizes por meio da estimativa da correlação entre elas. Dentre as medidas de dissimilaridade avaliadas, as distâncias estimadas com base na utilização de dados moleculares e a técnica de coeficiente de parentesco foram as que evidenciaram a maior correlação (0...

Distância genética e sua associação com heterose e desempenho de híbridos em aveia

Lorencetti,Claudir; Carvalho,Fernando Irajá Félix de; Oliveira,Antonio Costa de; Valério,Igor Pirez; Benin,Giovani; Zimmer,Paula Djalma; Vieira,Eduardo Alano
Fonte: Embrapa Informação Tecnológica; Pesquisa Agropecuária Brasileira Publicador: Embrapa Informação Tecnológica; Pesquisa Agropecuária Brasileira
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/04/2006 PT
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66.16%
O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito da dissimilaridade genética, aferida por caracteres morfológicos e marcadores moleculares, sobre a heterose e heterobeltiose em híbridos de aveia. Foram utilizados cinco genitores cruzados na forma dialélica, tendo sido desconsiderados os híbridos recíprocos. Não houve relação linear entre as medidas de dissimilaridade genética utilizadas, possivelmente em virtude da representação parcial e insuficiente do genoma, quando utilizados dados morfológicos, pela falta de ligação entre os genes controladores dos caracteres mensurados e os marcadores usados, ou pelo fato de as regiões cromossômicas, acessadas pelos marcadores, possuírem diferenças nas suas contribuições para desempenho e heterose da F1. Além disso, as medidas realizadas por meio de caracteres morfológicos e marcadores moleculares não revelam associação significativa com desempenho, heterose e heterobeltiose dos híbridos, para rendimento de grãos.

Consistência do padrão de agrupamento de cultivares de feijão conforme medidas de dissimilaridade e métodos de agrupamento

Cargnelutti Filho,Alberto; Ribeiro,Nerinéia Dalfollo; Burin,Cláudia
Fonte: Embrapa Informação Tecnológica; Pesquisa Agropecuária Brasileira Publicador: Embrapa Informação Tecnológica; Pesquisa Agropecuária Brasileira
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/03/2010 PT
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96.3%
O objetivo deste trabalho foi avaliar a consistência do padrão de agrupamento de cultivares de feijão (Phaseolus vulgaris L.), obtido a partir da combinação de oito medidas de dissimilaridade e oito métodos de agrupamento. Treze cultivares de feijão foram avaliadas em nove experimentos conduzidos entre os anos agrícolas de 2000/2001 e 2004/2005, e agrupadas de acordo com caracteres de produção (produtividade de grãos, número de vagens por planta), de fenologia (número de dias da emergência ao florescimento e da emergência à colheita) e de morfologia (altura de inserção da primeira e da última vagem). Foram realizadas análises de variância, de correlação, de diagnóstico de multicolinearidade, de agrupamento e de comparação de médias. A consistência do padrão de agrupamento foi avaliada por meio do coeficiente de correlação cofenética. Há variabilidade na consistência do padrão de agrupamento das cultivares de feijão, obtido a partir da combinação de diferentes medidas de dissimilaridade e métodos de agrupamento. Maior consistência nos padrões de agrupamento de cultivares de feijão é verificada com o método da ligação média entre grupo, obtido a partir da matriz de distância euclidiana.

Variabilidade e caracterização de frutos de pitangueiras em municípios baianos

Dias,Alex Batista; Carvalho,Maria Angélica Pereira de; Dantas,Ana Cristina Vello Loyola; Fonseca,Valdir José de Almeida
Fonte: Sociedade Brasileira de Fruticultura Publicador: Sociedade Brasileira de Fruticultura
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/12/2011 PT
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65.98%
O presente trabalho teve como objetivo obter informações sobre as características morfológicas dos frutos das pitangueiras localizadas em cinco municípios do Estado da Bahia. Os genótipos foram identificados, georreferenciados com o auxílio de GPS e de cada genótipo foram coletados 30 frutos no estádio de maturação fisiológica, avaliando-se: massa, comprimento e diâmetro do fruto, massas da polpa e das sementes, pH, acidez titulável, teor de sólidos solúveis e relação SS/AT. Os dados foram submetidos à análise descritiva, obtendo-se medidas de centralidade e de dispersão, correlação linear entre os caracteres e análise multivariada de agrupamento. Os resultados revelaram a existência de variabilidade para a maioria das características avaliadas, em especial para a massa do fruto, da semente e da polpa. Houve a formação de cinco grupos principais de dissimilaridade genética para a população geral, sendo a menor distância genética (0,22) verificada entre os genótipos IN3 e IN8 provenientes do município de Inhambupe. Os genótipos apresentam frutos com características de interesse para exploração comercial com porcentagem de polpa acima de 68%, sendo possível a identificação de materiais que reúnem altos valores para massa do fruto...

Comparações entre medidas de dissimilaridade e estatísticas multivariadas como critérios no direcionamento de hibridações em aveia

Benin,Giovani; Carvalho,Fernando Irajá Félix de; Oliveira,Antônio Costa de; Marchioro,Volmir Sergio; Lorencetti,Claudir; Kurek,Andreomar Jose; Silva,José Antonio Gonzalez; Cruz,Pedro Jacinto; Hartwig,Irineu; Schmidt,Douglas André Mallmann
Fonte: Universidade Federal de Santa Maria Publicador: Universidade Federal de Santa Maria
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/08/2003 PT
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96.07%
Medidas de dissimilaridade são artifícios que os melhoristas de plantas dispõem para identificarem genótipos distantes na obtenção de populações segregantes desejadas. Assim, o presente trabalho foi realizado para estabelecer relação entre as diferentes técnicas multivariadas utilizadas em estimativas de divergência genética. O experimento foi desenvolvido no ano agrícola de 2001, quando doze cultivares de aveia foram testados para sete caracteres agronômicos, utilizando-se o delineamento experimental de blocos casualizados com quatro repetições. As distâncias Euclidiana e de Mahalanobis evidenciaram baixa correlação (0,529) e, quando utilizadas na confecção de dendrogramas, não possibilitaram a formação de agrupamentos similares. As análises gráficas por componentes principais e variáveis canônicas também apresentaram dispersões distintas. Entretanto, apesar das discrepâncias observadas entre as metodologias analisadas, foi possível a identificação de genótipos dissimilares e com média elevada, que poderão ser utilizados com grande probabilidade de sucesso em hibridações dirigidas em aveia.

Comparação de métodos de agrupamento para o estudo da divergência genética em cultivares de feijão

Cargnelutti Filho,Alberto; Ribeiro,Nerinéia Dalfollo; Reis,Rodrigo Citton Padilha dos; Souza,Joseane Rodrigues de; Jost,Evandro
Fonte: Universidade Federal de Santa Maria Publicador: Universidade Federal de Santa Maria
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/11/2008 PT
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Os objetivos deste trabalho foram comparar métodos de agrupamento, com base nas medidas de dissimilaridade (euclidiana média padronizada e generalizada de Mahalanobis) e obter informações sobre a divergência genética em cultivares de feijão (Phaseolus vulgaris L.). Quatorze cultivares de feijão foram avaliadas em nove experimentos conduzidos em Santa Maria, Estado do Rio Grande do Sul (latitude 29°42S, longitude 53°49W e 95m de altitude), nos anos agrícolas de 2000/2001 a 2004/2005. Foi utilizado o delineamento aleatorizado em blocos, com três repetições, e foram avaliados os caracteres produtividade de grãos, número de vagens por planta e de sementes por vagem, massa de cem grãos, população final de plantas, número de dias da emergência ao florescimento e da emergência à colheita, altura de inserção de primeira e de última vagem e grau de acamamento. Agrupamentos com base na distância euclidiana média padronizada são distintos dos formados com base na distância generalizada de Mahalanobis. O método de Tocher e os métodos hierárquicos da ligação simples, de Ward, da ligação completa, da mediana, da ligação média dentro de grupo e da ligação média entre grupo, com base na distância generalizada de Mahalanobis formam grupos concordantes. A cultivar "Iraí" apresenta comportamento distinto das demais cultivares.

Consistência do padrão de agrupamento de cultivares de milho

Cargnelutti Filho,Alberto; Guadagnin,José Paulo
Fonte: Universidade Federal de Santa Maria Publicador: Universidade Federal de Santa Maria
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/09/2011 PT
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O objetivo deste trabalho foi avaliar a consistência do padrão de agrupamento obtido a partir da combinação de duas medidas de dissimilaridade e quatro métodos de agrupamento, em cenários formados por combinações de número de cultivares e número de variáveis, com dados reais de cultivares de milho (Zea mays L.) e com dados simulados. Foram usados os dados reais de cinco variáveis mensuradas em 69 experimentos de competição de cultivares de milho, cujo número de cultivares avaliadas oscilou entre 9 e 40. A fim de investigar os resultados com maior número de cultivares e de variáveis, foram simulados, sob distribuição normal padrão, 1.000 experimentos para cada um dos 54 cenários formados pela combinação entre o número de cultivares (20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90 e 100) e o número de variáveis (5, 6, 7, 8, 9 e 10). Foram realizadas análises de correlação, de diagnóstico de multicolinearidade e de agrupamento. A consistência do padrão de agrupamento foi avaliada por meio do coeficiente de correlação cofenética. Há decréscimo da consistência do padrão de agrupamento com o acréscimo do número de cultivares e de variáveis. A distância euclidiana proporciona maior consistência no padrão de agrupamento em relação à distância de Manhattan. A consistência do padrão de agrupamento entre os métodos aumenta na seguinte ordem: Ward...

Distância genética e sua associação com heterose e desempenho de híbridos em aveia.

LORENCETTI, C.; CARVALHO, F.I.F. de; OLIVEIRA, A.C. de; VALÉRIO, I.P.; BENIN, G.; ZIMMER, P.D.; VIEIRA, E.A.
Fonte: Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v.41, n. 4, p.591-598, abr. 2006. Publicador: Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v.41, n. 4, p.591-598, abr. 2006.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE)
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O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito da dissimilaridade genética, aferida por caracteres morfológicos e marcadores moleculares, sobre a heterose e heterobeltiose em híbridos de aveia. Foram utilizados cinco genitores cruzados na forma dialélica, tendo sido desconsiderados os híbridos recíprocos. Não houve relação linear entre as medidas de dissimilaridade genética utilizadas, possivelmente em virtude da representação parcial e insuficiente do genoma, quando utilizados dados morfológicos, pela falta de ligação entre os genes controladores dos caracteres mensurados e os marcadores usados, ou pelo fato de as regiões cromossômicas, acessadas pelos marcadores, possuírem diferenças nas suas contribuições para desempenho e heterose da F1. Além disso, as medidas realizadas por meio de caracteres morfológicos e marcadores moleculares não revelam associação significativa com desempenho, heterose e heterobeltiose dos híbridos, para rendimento de grãos.; 2006

Consistência do padrão de agrupamento de cultivares de feijão conforme medidas de dissimilaridade e métodos de agrupamento .

CARGNELUTTI FILHO, A.; RIBEIRO, N. D.; BURIN, C.
Fonte: Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v.45, n.3, p.236-243, mar. 2010 Publicador: Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, v.45, n.3, p.236-243, mar. 2010
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE)
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Resumo ? O objetivo deste trabalho foi avaliar a consistência do padrão de agrupamento de cultivares de feijão (Phaseolus vulgaris L.), obtido a partir da combinação de oito medidas de dissimilaridade e oito métodos de agrupamento. Treze cultivares de feijão foram avaliadas em nove experimentos conduzidos entre os anos agrícolas de 2000/2001 e 2004/2005, e agrupadas de acordo com caracteres de produção (produtividade de grãos, número de vagens por planta), de fenologia (número de dias da emergência ao florescimento e da emergência à colheita) e de morfologia (altura de inserção da primeira e da última vagem). Foram realizadas análises de variância, de correlação, de diagnóstico de multicolinearidade, de agrupamento e de comparação de médias. A consistência do padrão de agrupamento foi avaliada por meio do coeficiente de correlação cofenética. Há variabilidade na consistência do padrão de agrupamento das cultivares de feijão, obtido a partir da combinação de diferentes medidas de dissimilaridade e métodos de agrupamento. Maior consistência nos padrões de agrupamento de cultivares de feijão é verificada com o método da ligação média entre grupo, obtido a partir da matriz de distância euclidiana.; 2010

Diversidade genética de genótipos de feijão-caupi de Porte Semi-Prostrado.

PIRES, C. de J.; SOUSA, M. B. e; SOUSA, C. M. B. de; LIMA, L. R. L.; SILVA, K. J. D. e; ROCHA, M. de M.
Fonte: In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 6., 2011, Búzios. Panorama atual e perspectivas do melhoramento de plantas no Brasil: [anais]. Búzios: SBMP, 2011. Publicador: In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 6., 2011, Búzios. Panorama atual e perspectivas do melhoramento de plantas no Brasil: [anais]. Búzios: SBMP, 2011.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Formato: 1 CD-ROM.; 4 p.
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O feijão-caupi, conhecido como feijão-de-corda na região Nordeste, é uma leguminosa bastante cultivada nesta região, sendo considerada como fonte de renda e alimento básico para sua população. O objetivo deste trabalho foi caracterizar morfoagronomicamente vinte genótipos de feijão-caupi de porte semi-prostrado e estimar a divergência genética entre eles por meio de análise multivariada. Os ensaios foram conduzidos no campo experimental da Embrapa Meio-Norte, Teresina-PI, utilizando-se delineamento de blocos ao acaso com duas repetições. Foram avaliados oito descritores quantitativos. O agrupamento foi realizado pelo hierárquico da ligação média entre grupos (UPGMA), com base nas medidas de dissimilaridade das distâncias generalizadas de Mahalanobis. Estes métodos permitiram a visualização de cinco grupos distintos e evidenciaram a existência devariabilidade genética entre os genótipos estudados.; 2011

Divergência genética entre os genitores da população de arroz irrigado CNA-IRAT 4.

MORAIS, O. P. de; SILVA, J. C.; CRUZ, C. D.; REGAZZI, A. J.; NEVES, P. de C. F.
Fonte: Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 33, n. 8, p. 1339-48, ago. 1998. Publicador: Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 33, n. 8, p. 1339-48, ago. 1998.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE)
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Com o objetivo de avaliar a divergência genética entre as dez variedades genitoras da população de arroz irrigado CNA-IRAT 4, foram utilizados dados de dez características obtidas em experimento conduzido em Goianira, GO, em delineamento de blocos ao acaso com quatro repetições. Utilizando-se analises de variáveis canônicas e técnicas de agrupamento por meio dos métodos de Tocher e do vizinho mais próximo, tendo como medida de dissimilaridade a distancia generalizada D2 de Mahalanobis, constatou-se a existência de considerável divergência genética entre os genitores, indicando que a população deve mostrar variabilidade em relação a vários caracteres de interesse. Observou-se que o método aglomerativo de Tocher fornece maior numero de grupos que o método hierárquico do vizinho mais próximo e a analise por variáveis canônicas. A maior divergência e constatada entre a variedade Nanicão e a CNA4840, enquanto a CNA3848 e CNA3887 são as de maior similaridade. Constatou-se, ainda, que as características altura de planta, numero de dias para a floração media e peso de 100 grãos respondem pela maior parte da divergência genética existente entre os genitores enquanto dimensão de grãos e numero de grãos por panícula são as que menos contribuem para a referida divergência.; 1998

Divergencia genetica entre os genitores da populacao de arroz irrigado CNA-IRAT 4.

MORAIS, O.P. de; SILVA, J.C.; CRUZ, C.D.; REGAZZI, A.J.; NEVES, P.C.F.
Fonte: Pesquisa Agropecuaria Brasileira, Brasilia, v.33, n.8, p.1339-48, ago.1998. Publicador: Pesquisa Agropecuaria Brasileira, Brasilia, v.33, n.8, p.1339-48, ago.1998.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE)
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Com o objetivo de avaliar a divergencia genetica entre as dez variedades genitoras da populacao de arroz irrigado CNA-IRAT 4, foram utilizados dados de dez caracteristicas obtidas em experiment conduzido em Goianira, GO, em delineamento de blocos ao acaso com quatro repeticoes. Utilizando-se analises de variaveis canonicas e tecnicas de agrupamento por meio dos metodos de Tocher e do vizinho mais proximo, tendo como medida de dissimilaridade a distancia generalizada D2 de Mahalanobis, constatou-se a existencia de consideravel divergencia genetica entre os genitores, indicando que a populacao deve mostrar variabilidade em relacao a varios caracteres de interesse. Observou-se que o metodo aglomerativo de Tocher fornece maior numero de grupos que o metodo hierarquico do vizinho mais proximo e a analise por variaveis canonicas. A maior divergencia e constatada entre a variedade Nanicao e a CNA4840, enquanto a CNA3848 e CNA3887 sao as de maior similaridade. Constatou-se, ainda, que as caracteristicas altura de planta, numero de dias para a floracao media e peso de 100 graos respondem pela maior parte da divergencia genetica existente entre os genitores enquanto dimensao de graos e numero de graos por panicula sao as que menos contribuem para a referida divergencia.; 1998

Metodos de Agrupamento de Dados Simbolicos Baseados em funções de Dissimilaridades

Patrícia da Silva, kelly; de Assis Tenório Carvalho, Francisco (Orientador)
Fonte: Universidade Federal de Pernambuco Publicador: Universidade Federal de Pernambuco
Tipo: Outros
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Com a crescente quantidade de informacões produzidas pelas diversas atividades humanas, tem se tornado cada vez mais importante agregar, tratar e manipular grandes massas de dados de modo a definir conceitos e extrair conhecimento destes dados. Esses conceitos podem ser descritos por dados mais complexos, chamados dados simbolicos. Nesse contexto, surge a necessidade de estender metodos exploratorios, estatisticos e representações graficas para lidar com esse tipo de dados, em que cada variavel pode assumir como valor um conjunto de categorias, intervalos ou distribuicões de probabilidades. A analise de dados simbolicos e definida como a extensão dos metodos de analise de dados classicos para tal tipo de dados. Com o intuito de estender metodos estatisticos e tecnicas de aprendizado de maquina a esse tipo de dados, e necessario definir medidas de distância apropriadas. Diversas medidas de distância têm sido propostas na literatura. No entanto, ainda existe na literatura uma carência de analises comparativas dos desempenhos de medidas de distância para dados simbolicos. A principal contribuicão desta Dissertacão e prover uma avaliacão empirica de funções de dissimilaridade para dados simbolicos no contexto de analise de agrupamento. Alem disso...

Agrupamento baseado em kernel com ponderação automática das variáveis via distâncias adaptativas

Ferreira, Marcelo Rodrigo Portela; Carvalho, Francisco de Assis Tenório de (orientador)
Fonte: Universidade Federal de Pernambuco Publicador: Universidade Federal de Pernambuco
Tipo: Tese de Doutorado
BR
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Nesta tese de doutorado, propomos métodos de agrupamento baseados em funções kernel com ponderação automática das variáveis através de distâncias adaptativas onde medidas de dissimilaridade são obtidas como somas de distâncias Euclidianas entre padrões e protótipos calculadas individualmente para cada variável através de funções kernel. A principal vantagem da abordagem proposta sobre os métodos de agrupamento baseados em kernel convencionais é a possibilidade do uso de distâncias adaptativas, as quais mudam a cada iteração do algoritmo e podem ser a mesma para todos os grupos ou diferentes de um grupo para outro. Este tipo de medida de dissimilaridade é adequado ao aprendizado dos pesos das variáveis dinamicamente durante o processo de agrupamento, levando a uma melhora do desempenho dos algoritmos. Outra vantagem da abordagem proposta é que ela permite a introdução de diversas ferramentas para interpretação de partições e grupos. Experimentos com conjuntos de dados simulados e reais mostram a utilidade dos algoritmos propostos e o mérito das ferramentas de interpretação de partições e grupos.

Contribuições aos Processos de Clustering com Base em Métricas não-Euclidianas

Martins, Allan de Medeiros
Fonte: Universidade Federal do Rio Grande do Norte; BR; UFRN; Programa de Pós-Graduação em Engenharia Elétrica; Automação e Sistemas; Engenharia de Computação; Telecomunicações Publicador: Universidade Federal do Rio Grande do Norte; BR; UFRN; Programa de Pós-Graduação em Engenharia Elétrica; Automação e Sistemas; Engenharia de Computação; Telecomunicações
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
POR
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66.07%
In this work we present a new clustering method that groups up points of a data set in classes. The method is based in a algorithm to link auxiliary clusters that are obtained using traditional vector quantization techniques. It is described some approaches during the development of the work that are based in measures of distances or dissimilarities (divergence) between the auxiliary clusters. This new method uses only two a priori information, the number of auxiliary clusters Na and a threshold distance dt that will be used to decide about the linkage or not of the auxiliary clusters. The number os classes could be automatically found by the method, that do it based in the chosen threshold distance dt, or it is given as additional information to help in the choice of the correct threshold. Some analysis are made and the results are compared with traditional clustering methods. In this work different dissimilarities metrics are analyzed and a new one is proposed based on the concept of negentropy. Besides grouping points of a set in classes, it is proposed a method to statistical modeling the classes aiming to obtain a expression to the probability of a point to belong to one of the classes. Experiments with several values of Na e dt are made in tests sets and the results are analyzed aiming to study the robustness of the method and to consider heuristics to the choice of the correct threshold. During this work it is explored the aspects of information theory applied to the calculation of the divergences. It will be explored specifically the different measures of information and divergence using the Rényi entropy. The results using the different metrics are compared and commented. The work also has appendix where are exposed real applications using the proposed method; Neste trabalho apresentamos um novo método de clustering que agrupa pontos de um conjunto de dados em classes. O método baseia-se em um algoritmo para ligação de clusters auxiliares que são obtidos usando-se técnicas de quantização vetorial tradicionais. São descritas algumas abordagens durante o desenvolvimento do trabalho que baseiam-se em medidas de distância ou dissimilaridade (divergência) entre os clusters auxiliares. Este novo método utiliza apenas duas informações a priori...

Composição florística e estrutura comunitária da floresta de galeria do córrego da Paciência, Cuiabá, (MT)

Oliveira-Filho,Ary Teixeira de
Fonte: Sociedade Botânica do Brasil Publicador: Sociedade Botânica do Brasil
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/07/1989 PT
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A floresta de galeria de um dos braços do córrego da Paciência, no sopé da chapada dos Guimarães, Mato Grosso (15º 21'S. 55º 49' W), foi inventariada por meio de 67 parcelas de 30m² (0,201 ha), sendo amosdos os indivíduos com circunferência ao nível do solo > 9cm em três setores da floresta; Nascentes, Vereda e Cachoeira. Foram calculados os parâmetros fitossociológicos das espécies e das famílias botânicas para toda a área amostral e para cada um dos três setores da floresta. Foram obtidas medidas de dissimilaridade florística e estrutural entre os três setores amostrais e medidas de dissimilaridade florística entre a floresta do presente estudo e cinco outras florestas riparias do Distrito Federal e dos estados de São Paulo e Mato Grosso. As seis florestas apresentaram entre si índices muito altos de dissimilaridade florística, embora algumas delas apresentassem espécies em comum entre as mais abundantes. Os três setores amostrais mostraram igualmente uma considerável dessemelhança florística e estrutural entre si. O clima, os solos e a geomcrfologia das bacias hidrográficas são evocados como responsáveis pelas diferenças interregionais entre as florestas riparias. Já as dessemelhanças intrarregionais podem ser atribuídas à fertilidade dos solos e...

Análise dialélica e uso de marcadores microssatélites na avaliação de cultivares de trigo

Ribeiro,Cristiane Zocatelli; Pinto,Ronald José Barth; Franco,Francisco de Assis; Marchioro,Volmir Sérgio; Schuster,Ivan; Vieira,Elisa Serra Negra
Fonte: Universidade Federal de Santa Maria Publicador: Universidade Federal de Santa Maria
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/10/2011 PT
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65.98%
Foi avaliada a capacidade combinatória de oito cultivares de trigo, por meio de um esquema dialélico analisado segundo o modelo quatro da metodologia de Griffing. Paralelamente, foi realizada uma análise de dissimilaridade com marcadores SSR, a partir de estimativas de distância genética baseadas em pedigree. Oito características foram avaliadas num experimento delineado em blocos ao acaso, com duas repetições. O agrupamento das cultivares a partir das distâncias genéticas foi efetuado com os métodos UPGMA e Tocher. Ficou evidenciada a variabilidade entre os genótipos de trigo. As cultivares 'CD 108', 'CD 0542' e 'CD 104' apresentaram grande capacidade geral de combinação para vários caracteres. Os maiores valores de capacidade específica de combinação foram detectados nos híbridos mais heterozigotos, formados pelo cruzamento de parentais integrantes de grupos diferentes. Os agrupamentos indicados pelo pedigree não coincidiram com os indicados a partir dos marcadores moleculares. As distâncias dos marcadores SSR provavelmente refletem melhor as relações entre as cultivares de trigo do que as distâncias medidas com base na genealogia. A falta de associação entre os padrões de agrupamento foi provavelmente devida às propriedades intrínsecas de cada forma de estimação das distâncias genéticas...

Screening multivariado entre acessos e cultivares de feijão do grupo preto para utilização em blocos de cruzamento

Stähelin, Diego; UDESC; Valentini, Giseli; UDESC; Andrade, Luciano Rogério Braatz de; UDESC; Veríssimo, Mario Alvaro Aloisio; UDESC; Bertoldo, Juliano Garcia; UFSC; Guidolin, Altamir Frederico; UDESC; Coimbra, Jefferson Luis Meirelles; UDESC
Fonte: Universidade Federal de Santa Catarina Publicador: Universidade Federal de Santa Catarina
Tipo: info:eu-repo/semantics/article; info:eu-repo/semantics/publishedVersion; Formato: application/pdf
Publicado em 01/01/2011 POR
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http://dx.doi.org/10.5007/2175-7925.2011v24n1p95A estatística multivariada, através de medidas de dissimilaridade, vem auxiliando melhoristas de plantas na identificação de genótipos contrastantes utilizados na obtenção de populações segregantes de maior variabilidade. O objetivo do presente trabalho foi avaliar a dissimilaridade entre 38 acessos de feijão do grupo preto, por meio de técnicas multivariadas e selecionar genitores para compor blocos de cruzamentos. A partir das distâncias Euclidianas entre os acessos, realizou-se o agrupamento pelo método hierárquico de Ward, o qual permitiu classificar os acessos em grupos divergentes, sendo posteriormente comparados através de contrastes multivariados. Com a utilização dos escores das três primeiras variáveis canônicas foi possível a formação de seis grupos distintos que corroboram e se assemelham à análise por métodos aglomerativos. Os resultados revelaram variabilidade entre os acessos estudados, onde a análise multivariada pode adicionar informações à variação conjunta de variáveis respostas, sendo eficiente na determinação de divergência entre tais acessos.