Página 1 dos resultados de 1231 itens digitais encontrados em 0.006 segundos

Análise da interação solo-estrutura via acoplamento MEC-MEF; Analysis of soil-structure interaction using BEM-FEM coupling

Ribeiro, Dimas Betioli
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 08/04/2005 PT
Relevância na Pesquisa
36.97%
O objetivo central deste trabalho é o estudo da interação do solo com a estrutura. Para tanto, são introduzidos mais recursos na ferramenta numérica desenvolvida no trabalho de Almeida (2003a). O solo é modelado pelo método dos elementos de contorno (MEC) tridimensional, aplicando a solução fundamental de Kelvin. É possível analisar problemas nos quais o solo é composto por camadas de diferentes características físicas, apoiadas em uma superfície de deslocamento nulo e enrijecidas por elementos de fundação, também modelados pelo MEC tridimensional. A superestrutura tridimensional, diferentemente do modelo utilizado em Almeida (2003a), é simulada pelo método dos elementos finitos (MEF), sendo composta por elementos planos e reticulares com seis graus de liberdade por nó. Também é introduzido no programa o recurso de simular um número qualquer de blocos, modelados pelo MEC tridimensional, apoiados sobre o solo. Estes blocos podem ser utilizados como elementos de fundação para o edifício, permitindo estudar a interação do solo em conjunto com os blocos e o edifício. São analisados alguns exemplos, nos quais é validada a formulação empregada e é demonstrada a necessidade de se considerar a interação do solo com a estrutura em problemas práticos de engenharia; The main objective of this work is to study the soil structure interaction problem. For such...

Análise não linear física de placas e cascas anisotrópicas laminadas acopladas ou não com meio contínuo tridimensional viscoelástico através da combinação entre o MEC e o MEF; Physical non-linear analysis of anisotropic laminated plates and shells coupled or not with three-dimensional viscoelastic medium by BEM/FEM coupling

Paccola, Rodrigo Ribeiro
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 24/09/2004 PT
Relevância na Pesquisa
36.97%
Apresenta-se neste trabalho, uma formulação de cascas laminadas anisotrópicas enrijecidas ou não, considerando-se não-linearidade física com lei de fluxo não-associativa e acoplamento com meio contínuo tridimensional viscoelástico. Para tanto, são desenvolvidos elementos finitos triangulares planos com aproximação cúbica de variáveis para modelagem das cascas e elementos de barra de mesma aproximação para os elementos de barra geral (enrijecedores). A cinemática de laminados, ou Reissner geral, é utilizada para ambos possibilitando a representação de estruturas enrijecidas excentricamente e consideração de elementos compostos de camadas com diferentes propriedades físicas e espessuras, tornando-se assim a formulação aplicável a um grande número de problemas. Com relação à plasticidade na casca, adota-se o critério de Tsai-Wu para materiais anisotrópicos gerais, obtendo-se expressões fechadas para o multiplicador plástico com fluxo não-associativo. Nas barras, critérios uniaxiais são considerados, desprezando-se a contribuição do cisalhamento na plastificação. Para estes elementos, permite-se a utilização de diagrama multilinear para a relação tensão x deformação. A modelagem do meio contínuo viscoelástico é realizada utilizando-se elementos de contorno triangulares com aproximação linear de variáveis. As soluções fundamentais de Kelvin e de Mindlin são apresentadas e implementadas. O acoplamento foi realizado utilizando-se técnica de matriz de rigidez equivalente...

Análise de domínios reforçados através da combinação MEC/MEF considerando modelos de aderência; Reinforced Domains Analysis throughBEM/FEM Combination Considering Adherence Models

Rocha, Fabio Carlos da
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 02/10/2009 PT
Relevância na Pesquisa
37.22%
Neste trabalho, uma combinação do Método dos Elementos de Contorno (MEC) com o Método dos Elementos Finitos (MEF) é apresentada para análise bidimensional de sólidos elastostáticos reforçados, sendo considerados modelos de aderência no acoplamento. O elemento de contorno é adotado para modelar o comportamento do domínio, enquanto que o modelo por elementos finitos é utilizado para modelar o enrijecedor. Devido às singularidades nas equações integrais do MEC, estudou-se o erro ocasionado pelos integrandos de ordem e e como conseqüência sugerem-se, neste trabalho, equações mais simples para representar o erro das integrações. Para a formulação do acoplamento, um polinômio do terceiro grau é adotado para aproximar tanto o campo de deslocamento quanto a rotação do enrijecedor, enquanto aproximações lineares são usadas para representar a força de contato entre o domínio e o enrijecedor. Modelos de escorregamento, apresentados, são lineares e governados em função do carregamento escrito em termos das forças de contato e o deslocamento relativo. A partir da combinação entre o MEC e o MEF obtém-se uma matriz retangular contendo duas equações para o MEC e uma para o MEF. O resultado das equações algébricas redundantes é eliminado pela aplicação do procedimento dos mínimos quadrados. Exemplos ilustram o bom ajuste e os melhores resultados proporcionados pelo controle do erro das equações integrais...

Análise não linear geométrica do acoplamento solo-estrutura através da combinação MEC-MEF; Non linear geometric analysis of soil-structure interaction via BEM/FEM coupling

Silva, Wagner Queiroz
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 26/02/2010 PT
Relevância na Pesquisa
37.22%
Neste trabalho foi desenvolvida uma formulação alternativa para o acoplamento entre o método dos elementos de contorno (MEC) e o método dos elementos finitos (MEF) para análise não linear geométrica de estruturas reticuladas ligadas a meios contínuos bidimensionais heterogêneos, aplicado a problemas de interação solo-estrutura. O solo foi considerado com comportamento elástico linear e modelado via MEC por meio de uma formulação alternativa à clássica técnica de sub-região permitindo a consideração de múltiplas inclusões mais ou menos rígidas do que o material padrão e de linhas de carga internas aos domínios. Este código foi então acoplado ao programa AcadFrame, baseado no MEF posicional para análise não linear geométrica de pórticos com consideração de cinemática exata. O acoplamento numérico foi realizado por meio de uma formulação algébrica onde a matriz de rigidez do solo e a força de contato são condensadas e somadas à matriz e ao vetor de forças internas da estrutura a cada iteração no processo de Newton-Raphson. Em ambos os programas foi utilizada uma generalização do grau de aproximação dos elementos através dos polinômios de Lagrange, o que permite a utilização de elementos curvos de alta ordem. Foi utilizada ainda a técnica dos mínimos quadrados para reduzir as oscilações de forças de superfície no contato. Os resultados obtidos de forma geral são bastante satisfatórios e comprovam a eficiência da formulação. O trabalho permite a análise de problemas de edificações apoiadas sobre solos estratificados com múltiplas inclusões e linhas de carga. Permite tanto a análise de elementos apoiados diretamente sobre o solo (sapatas...

Estudo e aplicação de um elemento de contorno infinito na análise da interação solo-estrutura via combinação MEC/MEF; Study and application of an infinite boundary element for soil-structure interaction analysis via FEM/BEM coupling

Ribeiro, Dimas Betioli
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 26/03/2009 PT
Relevância na Pesquisa
37.22%
Neste trabalho, é desenvolvido um programa de computador para a análise estática e tridimensional de problemas de interação solo-estrutura. O programa permite considerar várias camadas de solo, cada qual com características físicas diferentes. Sobre este solo, o qual pode conter estacas, podem ser apoiados diversos tipos de estruturas, tais como placas e até um edifício. Todos os materiais considerados são homogêneos, isotrópicos, elásticos e lineares. O solo tridimensional é modelado com o método dos elementos de contorno (MEC), empregando as soluções fundamentais de Kelvin e uma técnica alternativa na consideração do maciço não-homogêneo. Esta técnica, que é uma contribuição original deste trabalho, é baseada no relacionamento das soluções fundamentais de deslocamento dos diferentes domínios, permitindo que sejam analisados como um único sólido sem a necessidade de equações de equilíbrio e compatibilidade. Isso reduz o sistema de equações final e melhora a precisão dos resultados, conforme comprovado nos exemplos apresentados. Para reduzir o custo computacional sem prejudicar a precisão dos resultados, é utilizada uma malha de elementos de contorno infinitos (ECI) nas bordas da malha de ECs para modelar o comportamento das variáveis de campo em longas distâncias. A formulação do ECI mapeado utilizado é outra contribuição original deste trabalho...

Myocyte enhancer factor (MEF) 2C: a tissue-restricted member of the MEF-2 family of transcription factors.

Martin, J F; Schwarz, J J; Olson, E N
Fonte: PubMed Publicador: PubMed
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em 01/06/1993 EN
Relevância na Pesquisa
27.53%
MEF-2 is a muscle-specific DNA binding activity that recognizes an A+T-rich sequence found in the control regions of numerous muscle-specific genes. The recent cloning of MEF-2 showed that it belongs to the MADS (MCM1, Agamous, Deficiens, and serum-response factor) box family of transcription factors and that MEF-2 mRNA is expressed ubiquitously. Here we describe the cloning of a member of the MEF-2 gene family, referred to as MEF-2C, that is nearly identical to other MEF-2 gene products in the MADS box but diverges from other members of the family outside of this domain. MEF-2C binds the MEF-2 site with high affinity and can activate transcription of a reporter gene linked to tandem copies of that site. In contrast to previously described members of the MEF-2 family, MEF-2C transcripts are highly enriched in skeletal muscle, spleen, and brain of adult mice and are upregulated during myoblast differentiation. These results suggest that the MEF-2 site is a target for a diverse family of proteins that regulates transcription in a variety of cell types.

Macrolide Efflux Genes mef(A) and mef(E) Are Carried by Different Genetic Elements in Streptococcus pneumoniae

Del Grosso, M.; Iannelli, F.; Messina, C.; Santagati, M.; Petrosillo, N.; Stefani, S.; Pozzi, G.; Pantosti, A.
Fonte: American Society for Microbiology Publicador: American Society for Microbiology
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em /03/2002 EN
Relevância na Pesquisa
27.62%
Susceptibilities to macrolides were evaluated in 267 Streptococcus pneumoniae isolates, of which 182 were from patients with invasive diseases and 85 were from healthy carriers. Of the 98 resistant isolates, 20 strains showed an M phenotype and carried mef. Strains that carried both mef(A) and mef(E) were found: 17 strains carried mef(A) and 3 carried mef(E). The characteristics of the strains carrying the mef genes and the properties of the mef-containing elements were studied. Strains carrying mef(A) belonged to serotype 14, were susceptible to all the antibiotics tested except erythromycin, and appeared to be clonally related by pulsed-field gel electrophoresis (PFGE). The three mef(E) strains belonged to different serotypes, showed different susceptibility profiles, and did not appear to be related by PFGE. The sequences of a fragment of the mef-containing element, which encompassed mef and the msr(A) homolog, were identical among the three mef(E)-positive strains and among the three mef(A)-positive strains, although there were differences between the sequences for the two variants at 168 positions. In all mef(A)-positive strains, the mef element was inserted in celB, which led to impairment of the competence of the strains. In line with insertion of the mef(E) element at a different site...

High affinity binding of MEF-2C correlates with DNA bending.

Meierhans, D; Sieber, M; Allemann, R K
Fonte: PubMed Publicador: PubMed
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em 15/11/1997 EN
Relevância na Pesquisa
27.53%
To regulate lineage-specific gene expression in many cell types, members of the myocyte enhancer factor-2 (MEF-2) family of transcription factors cooperate with basic helix-loop-helix (bHLH) proteins, which show only limited intrinsic DNA binding specificity. We investigated the DNA binding properties of MEF-2C in vitro and show that the inherent bendability of the MEF site is one of the principal structural characteristics recognized by MEF-2C. Measurements of the apparent dissociation constants of MEF-2C complexes with several DNA sequences revealed that MEF-2C bound with high affinity to DNA sequences containing a MEF site. Mutations in the MEF site which did not affect the bendability of the DNA changed the free energy of binding only marginally. However, reducing the intrinsic bendability of the DNA binding site through an AA-->GC substitution increased the half-maximal binding concentration of MEF-2C by almost one order of magnitude. Electrophoretic mobility shift assays revealed markedly reduced MEF-2C binding to DNA containing 2,6-diaminopurine. On binding to MEF-2C the maximum ellipticity at 275 nm in the CD spectrum of DNA containing a MEF site was red shifted by 4 nm and its intensity reduced significantly, while a slight blue shift of <1 nm was observed for a mutant DNA sequence with reduced bendability (AA-->GC). Bending analysis by circular permutation assay revealed that the DNA in the cognate complex was bent by 49 degrees ...

Myogenin induces the myocyte-specific enhancer binding factor MEF-2 independently of other muscle-specific gene products.

Cserjesi, P; Olson, E N
Fonte: PubMed Publicador: PubMed
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em /10/1991 EN
Relevância na Pesquisa
27.53%
The myocyte-specific enhancer-binding factor MEF-2 is a nuclear factor that interacts with a conserved element in the muscle creatine kinase and myosin light-chain 1/3 enhancers (L. A. Gossett, D. J. Kelvin, E. A. Sternberg, and E. N. Olson, Mol. Cell. Biol. 9:5022-5033, 1989). We show in this study that MEF-2 is regulated by the myogenic regulatory factor myogenin and that mitogenic signals block this regulatory interaction. Induction of MEF-2 by myogenin occurs in transfected 10T1/2 cells that have been converted to myoblasts by myogenin, as well as in CV-1 kidney cells that do not activate the myogenic program in response to myogenin. Through mutagenesis of the MEF-2 site, we further defined the binding site requirements for MEF-2 and identified potential MEF-2 sites within numerous muscle-specific regulatory regions. The MEF-2 site was also found to bind a ubiquitous nuclear factor whose binding specificity was similar to but distinct from that of MEF-2. Our results reveal that MEF-2 is controlled, either directly or indirectly, by a myogenin-dependent regulatory pathway and suggest that growth factor signals suppress MEF-2 expression through repression of myogenin expression or activity. The ability of myogenin to induce MEF-2 activity in CV-1 cells...

Expression of the mef(E) Gene Encoding the Macrolide Efflux Pump Protein Increases in Streptococcus pneumoniae with Increasing Resistance to Macrolides

Wierzbowski, Aleksandra K.; Boyd, Dave; Mulvey, Michael; Hoban, Daryl J.; Zhanel, George G.
Fonte: American Society for Microbiology Publicador: American Society for Microbiology
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em /11/2005 EN
Relevância na Pesquisa
27.51%
Active macrolide efflux is a major mechanism of macrolide resistance in Streptococcus pneumoniae in many parts of the world, especially North America. In Canada, this active macrolide efflux in S. pneumoniae is predominantly due to acquisition of the mef(E) gene. In the present study, we assessed the mef(E) gene sequence as well as mef(E) expression in variety of low- and high-level macrolide-resistant, clindamycin-susceptible (M-phenotype) S. pneumoniae isolates (erythromycin MICs, 1 to 32 μg/ml; clindamycin MICs, ≤0.25 μg/ml). Southern blot hybridization with mef(E) probe and EcoRI digestion and relative real-time reverse transcription-PCR were performed to study the mef(E) gene copy number and expression. Induction of mef(E) expression was analyzed by Etest susceptibility testing pre- and postincubation with subinhibitory concentrations of erythromycin, clarithromycin, azithromycin, telithromycin, and clindamycin. The macrolide efflux gene, mef(E), was shown to be a single-copy gene in all 23 clinical S. pneumoniae isolates tested, and expression post-macrolide induction increased 4-, 6-, 20-, and 200-fold in isolates with increasing macrolide resistance (erythromycin MICs 2, 4, 8, and 32 μg/ml, respectively). Sequencing analysis of the macrolide efflux genetic assembly (mega) revealed that mef(E) had a 16-bp deletion 153 bp upstream of the putative start codon in all 23 isolates. A 119-bp intergenic region between mef(E) and mel was sequenced...

Molecular Characterization of Pneumococci with Efflux-Mediated Erythromycin Resistance and Identification of a Novel mef Gene Subclass, mef(I)

Cochetti, Ileana; Vecchi, Manuela; Mingoia, Marina; Tili, Emily; Catania, Maria R.; Manzin, Aldo; Varaldo, Pietro E.; Montanari, Maria Pia
Fonte: American Society for Microbiology Publicador: American Society for Microbiology
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em /12/2005 EN
Relevância na Pesquisa
27.61%
The molecular genetics of macrolide resistance were analyzed in 49 clinical pneumococci (including an “atypical” bile-insoluble strain currently assigned to the new species Streptococcus pseudopneumoniae) with efflux-mediated erythromycin resistance (M phenotype). All test strains had the mef gene, identified as mef(A) in 30 isolates and mef(E) in 19 isolates (including the S. pseudopneumoniae strain) on the basis of PCR-restriction fragment length polymorphism analysis. Twenty-eight of the 30 mef(A) isolates shared a pulsed-field gel electrophoresis (PFGE) type corresponding to the England14-9 clone. Of those isolates, 27 (20 belonging to serotype 14) yielded multilocus sequence type ST9, and one isolate yielded a new sequence type. The remaining two mef(A) isolates had different PFGE types and yielded an ST9 type and a new sequence type. Far greater heterogeneity was displayed by the 19 mef(E) isolates, which fell into 11 PFGE types, 12 serotypes (though not serotype 14), and 12 sequence types (including two new ones and an undetermined type for the S. pseudopneumoniae strain). In all mef(A) pneumococci, the mef element was a regular Tn1207.1 transposon, whereas of the mef(E) isolates, 17 carried the mega element and 2 exhibited a previously unreported organization...

Polyclonal Population Structure of Streptococcus pneumoniae Isolates in Spain Carrying mef and mef plus erm(B)▿

de la Pedrosa, Elia Gómez G.; Morosini, María-Isabel; van der Linden, Mark; Ruiz-Garbajosa, Patricia; Galán, Juan Carlos; Baquero, Fernando; Reinert, Ralf René; Cantón, Rafael
Fonte: American Society for Microbiology (ASM) Publicador: American Society for Microbiology (ASM)
Tipo: Artigo de Revista Científica
EN
Relevância na Pesquisa
27.51%
The population structure (serotypes, pulsed-field gel electrophoresis [PFGE] types, and multilocus sequencing types) of 45 mef-positive Streptococcus pneumoniae isolates [carrying mef alone (n = 17) or with the erm(B) gene n = 28)] were studied. They were selected from among all erythromycin-resistant isolates (n = 244) obtained from a collection of 712 isolates recovered from different Spanish geographic locations in the prevaccination period from 1999 to 2003. The overall rates of resistance (according to the criteria of the CLSI) among the 45 mef-positive isolates were as follows: penicillin G, 82.2%; cefotaxime, 22.2%; clindamycin, 62.2%; and tetracycline, 68.8% [mainly in isolates carrying erm(B) plus mef(E); P < 0.001]. No levofloxacin or telithromycin resistance was found. Macrolide resistance phenotypes (as determined by the disk diffusion approximation test) were 37.7% for macrolide resistance [with all but one due to mef(E)] and 62.2% for constitutive macrolide-lincosamide-streptogramin B resistance [cMLSB; with all due to mef(E) plus erm(B)]. Serotypes 14 (22.2%), 6B (17.7%), 19A (13.3%), and 19F (11.1%) were predominant. Twenty-five different DNA patterns (PFGE types) were observed. Our mef-positive isolates were grouped (by eBURST analysis) into four clonal complexes (n = 18) and 19 singleton clones (n = 27). With the exception of clone Spain9V-3...

Characterization of Macrolide Efflux Pump mef Subclasses Detected in Clinical Isolates of Streptococcus pyogenes Isolated between 1999 and 2005▿

Blackman Northwood, J.; Del Grosso, M.; Cossins, L. R.; Coley, M. D.; Creti, R.; Pantosti, A.; Farrell, D. J.
Fonte: American Society for Microbiology (ASM) Publicador: American Society for Microbiology (ASM)
Tipo: Artigo de Revista Científica
EN
Relevância na Pesquisa
27.51%
The macrolide efflux mechanism of resistance, mef, was characterized in community-acquired respiratory tract infections with Streptococcus pyogenes. Fifty-four (4.6%) M phenotype isolates were screen tested as negative for mef(A). Of these 54 isolates, 5 (0.4%), 27 (2.3%), and 1 (0.1%) were considered to be mef(I) positive, a novel mosaic variant of mef, or a novel subclass of mef, respectively. This study shows (i) the definitive presence of mef(E) in S. pyogenes and its global distribution, (ii) the presence of a mosaic variant of mef composed of mef(A) and mef(E), (iii) the previously undescribed presence of mef(I) in S. pyogenes, and (iv) the presence of a novel subclass of mef in S. pyogenes.

MEF/ELF4 transactivation by E2F1 is inhibited by p53

Taura, Manabu; Suico, Mary Ann; Fukuda, Ryosuke; Koga, Tomoaki; Shuto, Tsuyoshi; Sato, Takashi; Morino-Koga, Saori; Okada, Seiji; Kai, Hirofumi
Fonte: Oxford University Press Publicador: Oxford University Press
Tipo: Artigo de Revista Científica
EN
Relevância na Pesquisa
27.55%
Myeloid elf-1-like factor (MEF) or Elf4 is an E-twenty-six (ETS)-related transcription factor with strong transcriptional activity that influences cellular senescence by affecting tumor suppressor p53. MEF downregulates p53 expression and inhibits p53-mediated cellular senescence by transcriptionally activating MDM2. However, whether p53 reciprocally opposes MEF remains unex-plored. Here, we show that MEF is modulated by p53 in human cells and mice tissues. MEF expression and promoter activity were suppressed by p53. While we found that MEF promoter does not contain p53 response elements, intriguingly, it contains E2F consensus sites. Subsequently, we determined that E2F1 specifically binds to MEF promoter and transactivates MEF. Nevertheless, E2F1 DNA binding and transactivation of MEF promoter was inhibited by p53 through the association between p53 and E2F1. Furthermore, we showed that activation of p53 in doxorubicin-induced senescent cells increased E2F1 and p53 interaction, diminished E2F1 recruitment to MEF promoter and reduced MEF expression. These observations suggest that p53 downregulates MEF by associating with and inhibiting the binding activity of E2F1, a novel transcriptional activator of MEF. Together with previous findings...

Genetic Resistance Elements Carrying mef Subclasses Other than mef(A) in Streptococcus pyogenes ▿ †

Del Grosso, Maria; Camilli, Romina; Barbabella, Giada; Blackman Northwood, John; Farrell, David J.; Pantosti, Annalisa
Fonte: American Society for Microbiology Publicador: American Society for Microbiology
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em /07/2011 EN
Relevância na Pesquisa
27.59%
In Streptococcus pyogenes, efflux-mediated erythromycin resistance is associated with the mef gene, represented mostly by mef(A), although a small portion of strains carry different mef subclasses. We characterized the composite genetic elements, including mef subclasses other than mef(A), associated with other resistance genes in S. pyogenes isolates. Determination of the genetic elements was performed by PCR mapping. The strains carrying mosaic mef(A/E), in which the 5′ region was identical to mef(A) and the 3′ region was identical to mef(E), also carried tet(O). The two genes were found enclosed in an element similar to S. pyogenes prophage Φm46.1, designated the Φm46.1-like element. In S. pyogenes strains carrying mef(E) and tet(M), mef(E) was included in a typical mega element, and in some strains, it was physically associated with tet(M) in the composite element Tn2009. S. pyogenes strains carrying mef(I) also carried catQ; the two genes were linked in a fragment representing a portion of the 5216IQ complex of Streptococcus pneumoniae, designated the defective IQ element. In the only isolate carrying a novel mef gene, this was associated with catQ and tet(M) in a genetic element similar to the 5216IQ complex of S. pneumoniae (5216IQ-like complex)...

Transcriptional Attenuation Controls Macrolide Inducible Efflux and Resistance in Streptococcus pneumoniae and in Other Gram-Positive Bacteria Containing mef/mel(msr(D)) Elements

Chancey, Scott T.; Bai, Xianhe; Kumar, Nikhil; Drabek, Elliott F.; Daugherty, Sean C.; Colon, Thomas; Ott, Sandra; Sengamalay, Naomi; Sadzewicz, Lisa; Tallon, Luke J.; Fraser, Claire M.; Tettelin, Hervé; Stephens, David S.
Fonte: Public Library of Science Publicador: Public Library of Science
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em 19/02/2015 EN
Relevância na Pesquisa
27.54%
Macrolide resistance, emerging in Streptococcus pneumoniae and other Gram-positive bacteria, is increasingly due to efflux pumps encoded by mef/mel(msr) operons found on discrete mobile genetic elements. The regulation of mef/mel(msr) in these elements is not well understood. We identified the mef(E)/mel transcriptional start, localized the mef(E)/mel promoter, and demonstrated attenuation of transcription as a mechanism of regulation of macrolide-inducible mef-mediated macrolide resistance in S. pneumoniae. The mef(E)/mel transcriptional start site was a guanine 327 bp upstream of mef(E). Consensus pneumococcal promoter -10 (5′-TATACT-3′) and -35 (5′-TTGAAC-3′) boxes separated by 17 bp were identified 7 bp upstream of the start site. Analysis of the predicted secondary structure of the 327 5’ region identified four pairs of inverted repeats R1-R8 predicted to fold into stem-loops, a small leader peptide [MTASMRLR, (Mef(E)L)] required for macrolide induction and a Rho-independent transcription terminator. RNA-seq analyses provided confirmation of transcriptional attenuation. In addition, expression of mef(E)L was also influenced by mef(E)L-dependent mRNA stability. The regulatory region 5’ of mef(E) was highly conserved in other mef/mel(msr)-containing elements including Tn1207.1 and the 5612IQ complex in pneumococci and Tn1207.3 in Group A streptococci...

Metodología para la determinación y asignación de incertidumbres a valores obtenidos mediante cálculos efectuados a partir de modelos MEF

Rodríguez Fernández, Santiago
Fonte: Universidade Carlos III de Madrid Publicador: Universidade Carlos III de Madrid
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
SPA
Relevância na Pesquisa
36.97%
La simulación es un método imprescindible en aquellos casos en los que las características del sistema que se pretende estudiar hacen inviable, por razones físicas o de coste, la experimentación directa sobre el mismo. Incluso en aquellos casos en los que es posible la experimentación directa, la simulación puede ofrecer ventajas tales como un coste inferior, tiempo, repeticiones y seguridad. La utilización de la simulación como una alternativa a los métodos experimentales clásicos en el diseño mecánico, requiere un adecuado control y conocimiento de las fuentes de error e incertidumbres influyentes en los resultados obtenidos, para conocer la exactitud y posibilidades de la herramienta que se está utilizando. La incertidumbre influye en la forma de decidir, planear y comportarnos en una gran variedad de campos del saber, desde la economía hasta la ingeniería. Disminuir la incertidumbre ha sido y sigue siendo una ardua tarea que compromete tiempo y recursos. Los esfuerzos en idear métodos para reducir el impacto de las incertidumbres en cualquier campo, han estado siempre entre los objetivos de la investigación. En la presente tesis se recoge una nueva metodología práctica para poder determinar y asignar incertidumbres a valores obtenidos mediante cálculos efectuados a partir de modelos MEF. El objetivo de esta metodología es comenzar a sustituir la experimentación en prototipos físicos por “ensayos virtuales” sobre los modelos numéricos de esos prototipos físicos...

Análise da interação estaca-solo-superestrutura com o acoplamento MEC-MEF; Pile-soil-superstructure interaction using BEM-FEM coupling

Ramos, Ana Paula Ferreira
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 26/09/2013 PT
Relevância na Pesquisa
37.22%
Fundações do tipo radier estaqueado são aquelas formadas pelos elementos estruturais de placa e estacas (elementos de barras) e o solo . Ao contrário de outras tipos de fundações, onde a carga da superestrutura é transferida ao solo pelo radier ou pelas estacas apenas, no radier estaqueado a contribuição das estacas, bem como a do radier são consideradas. As estacas transferem as cargas da superestrutura ao solo e, assim, permitem a redução dos recalques de uma forma muito econômica. O objetivo do presente trabalho é a análise da interação solo-estrutura através do acoplamento MEC-MEF. O solo é considerado um semi-espaço homogêneo, elástico e linear governado pela equação de Navier e modelado pelo Método dos Elementos de Contorno (MEC), admitindo a solução fundamental de Mindlin. As estacas são modeladas pelo Método dos Elementos Finitos (MEF) e cada elemento possui quatro nós. Além disso, as estacas podem receber forças horizontais, verticais e momentos. A tensão de cisalhamento ao longo da estaca é aproximada por um polinômio do segundo grau e as forças na direção horizontal são aproximadas por um polinômio do quarto grau. O elemento de fundação que faz a ligação do pilar com a estaca é representado por uma placa de grande rigidez...

Formulação numérica, via MEF, de problemas de adensamento considerando a variação do nível d'água

Pinto,Marcelo Antonio Furtado; Nogueira,Christianne de Lyra
Fonte: Escola de Minas Publicador: Escola de Minas
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/12/2005 PT
Relevância na Pesquisa
36.97%
Esse artigo apresenta a formulação isoparamétrica, via MEF, de problemas de adensamento devido à variação do nível d'água em termos das variáveis primárias: deslocamentos e carga hidráulica total. A superfície livre, durante o regime de escoamento transitório, é considerada como um contorno móvel e, para sua localização, é adotado o processo de fluxo residual. A estratégia de redução da permeabilidade, necessária para minimizar o fluxo nas regiões com poro-pressões negativas, foi adotada nesse artigo. O modelo numérico apresentado foi implementado no programa computacional ANLOG para solução de problemas em estado plano de deformação. São apresentados exemplos que validam a formulação apresentada.

Formula??o num?rica, via MEF, de problemas de adensamento considerando a varia??o do n?vel d'?gua

Pinto, Marcelo Ant?nio Furtado; Nogueira, Christianne de Lyra
Fonte: Universidade Federal de Ouro Preto Publicador: Universidade Federal de Ouro Preto
Tipo: Artigo publicado em periodico
PT_BR
Relevância na Pesquisa
36.97%
Esse artigo apresenta a formula??o isoparam?trica, via MEF, de problemas de adensamento devido ? varia??o do n?vel d'?gua em termos das vari?veis prim?rias: deslocamentos e carga hidr?ulica total. A superf?cie livre, durante o regime de escoamento transit?rio, ? considerada como um contorno m?vel e, para sua localiza??o, ? adotado o processo de fluxo residual. A estrat?gia de redu??o da permeabilidade, necess?ria para minimizar o fluxo nas regi?es com poro-press?es negativas, foi adotada nesse artigo. O modelo num?rico apresentado foi implementado no programa computacional ANLOG para solu??o de problemas em estado plano de deforma??o. S?o apresentados exemplos que validam a formula??o apresentada. ____________________________________________________________________________________________________; Abstract: A fully coupled isoparametric formulation based on the finite element method to solve consolidation problems due to the drawdown of the water table is presented in this paper. The primary variables of this formulation are displacement and total hydraulic head. The free surface is considered as a changing contour and its location is determined by the use of the residual flow procedure, in which the water, firstly stored in the porous of the soil between two consecutive free surfaces...