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Isolation of extraintestinal pathogenic Escherichia coli from diarrheic dogs and their antimicrobial resistance profile; Isolamento de Escherichia coli extraintestinal patogênica de cachorros diarréicos e seu perfil de resistência antimicrobiana

PAULA, Cleber Jacob Silva de; MARIN, José Moacir
Fonte: Sociedade Brasileira de Microbiologia Publicador: Sociedade Brasileira de Microbiologia
Tipo: Artigo de Revista Científica
ENG
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27.42%
From January to December 2006, 92 Escherichia coli isolates from 25 diarrheic dogs were analyzed by screening for the presence of adhesin-encoding genes (pap, sfa, afa), hemolysin and aerobactin genes. Virulence gene frequencies detected in those isolates were: 12% pap, 1% sfa, 10% hemolysin and 6.5% aerobactin. Ten isolates were characterized as extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) strains; all showed a multidrug resistance phenotype that may represent a reason for concern due the risk of dissemination of antimicrobial resistant genes to the microbiota of human beings.; Entre Janeiro e dezembro de 2006, 92 cepas de Escherichia coli isoladas de 25 cachorros diarréicos foram analisadas para a detecção de genes codificadores de adesinas (pap, sfa e afa), hemoisina e aerobactina. As freqüências dos genes de virulência detectadas nestas cepas foram: 12% pap, 1% sfa, 10% hemolisina e 6,5% aerobactina. Dez cepas foram caracterizadas como E. coli extraintestinal patogênica (ExPEC) e todas as cepas apresentaram um fenótipo de multiresistência, o que pode representar um motivo de preocupação, por causa do risco de disseminação de genes de resistência a drogas antimicrobianas para a microbiota dos seres humanos.; FAPESP

Pesquisa e caracterização de amostras de ExPEC ("Extraintestinal Pathogenic Escherichia coli ") isoladas de infecções do trato urinário (ITU) de cães e gatos.; Characterization of ExPEC ("Extraintestinal Pathogenic Escherichia coli") isolated from dogs and cats with uinary tract infections (UTI).

Osugui, Lika
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 10/12/2008 PT
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38.02%
As ITU são as mais freqüentes infecções ocasionadas por ExPEC. Entre os fatores de virulência (FV) encontram-se nestas cepas adesinas, invasinas, toxinas, sideróforos, e evasinas, localizados em plasmídios ou ilhas de patogenecidade. O objetivo deste estudo foi caracterizar 45 cepas de E. coli isoladas de 33 cães e 7 gatos com ITU, quanto aos sorotipos, FV e grupos filogenéticos. Dos sorogrupos relacionados às ITU foram encontrados O6 (20%), O2 (16%), O25 (4%), O4 e O11 (4% cada um). Entre os genes pesquisados, foram encontrados fimH (100%), pap (47%), sfa (33%) e iha (4%); ibeA (29%); cnf1 (31%), hlyA (27%); fyuA (80%), iucD (22%); traT (51%); cvaC (20%) e malX (67%). Os isolados felinos foram agrupados em B2 (89%) e D (11%), enquanto os caninos em A (5,5%), B1 (19,5%), B2 (55,5%) e D (19,5%). Estes resultados sugerem que as ExPEC isoladas de cães e gatos apresentam potencial patogênico para ocasionar doenças mais graves que as ITU, assim como ocorre em humanos. Além disso, a similitude com as amostras humanas reforça a hipótese acerca de seu potencial zoonótico.; The ability of ExPEC to cause extraintestinal infections in humans, dogs, and cats is associated with the expression of a variety of virulence factors (VF). The aim of this study was to evaluate the frequency of VF related to ExPEC...

Pesquisa e Caracterização de Escherichia coli patogênica (E.coli produtora de toxina Shiga - STEC; E.coli aviária patogênica - APEC) de fragatas (Fregata magnificens) da Costa do Estado de São Paulo; Research and characterization of pathogenic Escherichia coli (E. coli Shiga toxin-producing - STEC, avian pathogenic E. coli - APEC) frigates (Fregata magnificens) Coast of São Paulo

Saviolli, Juliana Yuri
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 25/02/2010 PT
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27.6%
O presente trabalho objetivou pesquisar e caracterizar Escherichia coli patogênica (E. coli produtora de toxina Shiga STEC; E. coli aviária patogênica - APEC) em fragatas (Fregata magnificens) da costa do Estado de São Paulo e, desta forma, contribuir para a compreensão de aspectos epidemiológicos deste importante grupo de enfermidades zoonóticas bacterianas, as colibaciloses. Para tanto, foram realizadas três expedições científicas aos dois sítios de nidificação de fragatas no estado de São Paulo, Ilha Principal do Arquipélago de Alcatrazes (24°06´S 45°41´W) e Ilha de Castilho (25°16´S 47°57´W), nas quais foi colhido um total de 42 amostras de "swabs", sendo 21 cloacais e 21 de coanas, oriundos de 18 filhotes de sexo indeterminado, 2 fêmeas adultas e 1 macho adulto de fragatas. Das 42 amostras clinicas estudadas, foram identificadas 18 com crescimento de E.coli. Destas, foram isoladas 67 cepas, que foram então submetidas à pesquisa de genes de virulência e caracterização de grupos filogenéticos através da técnica de PCR. Em seguida, as cepas que exibiram fatores de virulência foram analisadas através de sorotipagem. Para investigar os padrões de resistência e sensibilidade a antimicrobianos...

Resistência aos antimicrobianos e virulência de Escherichia coli patogênica para aves (APEC) isoladas de perus com doença respiratória; Antimicrobial resistance and virulence of avian pathogenic Escherichia coli isolated from turkeys with respiratory disease

Cunha, Marcos Paulo Vieira
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 06/06/2014 PT
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27.82%
Os prejuízos causados por Escherichia coli patogênica para aves (APEC) na produção de aves é justificativa de pesquisas realizadas no mundo todo há décadas. Recentemente, o potencial zoonótico e a multirresistência das cepas desse patotipo têm sido alvo frequente dos trabalhos realizados com APEC. O objetivo desse trabalho foi caracterizar 225 cepas APEC isoladas de perus condenados por aerossaculite em abatedouros em relação à resistência a 14 antimicrobianos, perfil de virulência e grupos filogenéticos. 92% das amostras apresentaram perfil de multirresistência (MDR) e os índices mais altos de resistência foram a sulfonamidas (94%), tetraciclina (83%), eritromicina (82%), estreptomicina (60%), amoxicilina (53%) e ácido nalidíxico (48%). Metade das cepas foram classificadas no grupo filogenético B2 (50%), seguido por B1 (28,6%), grupo A (17,1%) e grupo D (4,8%). Os genes de virulência pesquisados tiveram prevalência de iroN (95%), iss (93%), cvi/cva (67%), iucD (67%), tsh (56%), irp2 (51%), ibeA (31%), vat (24%), neuS (19%), astA (17%) e papC (15%). Considerando o potencial zoonótico e a associação a um maior número de genes de virulência quando comparadas aos outros grupos filogenéticos, as cepas B2 foram selecionadas para pesquisa de integrons de classe 1 e clonalidade. As 112 amostras B2 eram pertencentes a 83 diferentes perfis ERIC...

Isolation of extraintestinal pathogenic Escherichia coli from diarrheic dogs and their antimicrobial resistance profile

Paula, Cleber Jacob Silva de; Marin, José Moacir
Fonte: Sociedade Brasileira de Microbiologia Publicador: Sociedade Brasileira de Microbiologia
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: 498-500
ENG
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27.6%
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP); Entre Janeiro e dezembro de 2006, 92 cepas de Escherichia coli isoladas de 25 cachorros diarréicos foram analisadas para a detecção de genes codificadores de adesinas (pap, sfa e afa), hemoisina e aerobactina. As freqüências dos genes de virulência detectadas nestas cepas foram: 12% pap, 1% sfa, 10% hemolisina e 6,5% aerobactina. Dez cepas foram caracterizadas como E. coli extraintestinal patogênica (ExPEC) e todas as cepas apresentaram um fenótipo de multiresistência, o que pode representar um motivo de preocupação, por causa do risco de disseminação de genes de resistência a drogas antimicrobianas para a microbiota dos seres humanos.; From January to December 2006, 92 Escherichia coli isolates from 25 diarrheic dogs were analyzed by screening for the presence of adhesin-encoding genes (pap, sfa, afa), hemolysin and aerobactin genes. Virulence gene frequencies detected in those isolates were: 12% pap, 1% sfa, 10% hemolysin and 6.5% aerobactin. Ten isolates were characterized as extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) strains; all showed a multidrug resistance phenotype that may represent a reason for concern due the risk of dissemination of antimicrobial resistant genes to the microbiota of human beings.

Presence of extraintestinal pathogenic Escherichia coli in butcheries in Taquaritinga, SP, Brazil

Santo, Edilene; Rodolpho, Daniela; Marin, José Moacir
Fonte: Universidade Estadual Paulista Publicador: Universidade Estadual Paulista
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: 591-593
ENG
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27.42%
The study was conducted in twenty-three butcheries in the city of Taquaritinga, State of São Paulo, Brazil, surveyed during a 10 months period. Among two hundred and eighty-seven Escherichia coli strains isolated from samples of ground beef, meat-grinding-machines and the hands of manipulators, five were recognized as extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC), showing virulence factors (P and S fimbriae, hemolysin and aerobactin) and presenting multidrug resistance. Retail-sold food may constitute an important vehicle for the dissemination of ExPEC in communities, giving rise to reasons for concern.

Análise de cepas de Escherichia coli Shiga toxigênica (STEC) e E. coli patogênica extraintestinal (ExPEC) isoladas de cachorros diarréicos atendidos em clínica privada no município de Ituverava, SP

Paula, Cleber Jacob Silva de
Fonte: Universidade Estadual Paulista (UNESP) Publicador: Universidade Estadual Paulista (UNESP)
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: xi, 84 f. : il.
POR
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37.82%
Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES); Pós-graduação em Microbiologia Agropecuária - FCAV; Cachorros têm sido propostos como possíveis reservatórios de cepas de Escherichia coli patogênicas que causam infecções em cachorros e em humanos. Entre Janeiro e Dezembro de 2006, 92 cepas de E. coli foram analisadas para a detecção da presença de genes produtores de toxina Shigalike (stx 1 e stx 2) e o gene da intimina (eae). Doze cepas de E. coli Shigatoxigênica (STEC) foram detectadas por PCR como portadoras dos genes de Shiga toxina, 7 cepas do gene stx 1 (7,6%), 5 do stx 2 (5,4%) e nenhuma delas apresentando ambos os genes. Nove (9,8%) das cepas de E. coli apresentaram o gene eae e não eram produtoras de Shiga toxina. Os isolados de E. coli foram também examinados para a detecção dos genes codificadores de adesinas (pap, sfa e afa), hemolisina e aerobactina. A freqüência dos genes de virulência detectados nestes isolados foi de 12,0% pap, 1,0% sfa, 10,0% hemolisina e 6,5% aerobactina. Seis destes isolados foram caracterizados como cepas de E.coli patogênica extraintestinal (ExPEC). Entre as cepas de STEC e ExPEC foi encontrado um alto nível de resistência a agentes antimicrobianos (estreptomicina com 81% e 100% e cefalotina com 85...

Virulence genes in Escherichia coli isolated from feces and urine of cats

Caliman, M.w.; Marin, J.m.
Fonte: Universidade Federal de Minas Gerais, Escola de Veterinária Publicador: Universidade Federal de Minas Gerais, Escola de Veterinária
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: 1287-1290
ENG
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27.42%
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP); Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq); Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES); Determinadas linhagens de Escherichia coli comportam-se como patógenos em gatos, causando doenças gastrointestinais e extraintestinais. Neste estudo, foram utilizadas 205 cepas de E. coli isoladas de amostras de fezes provenientes de 19 gatos diarreicos e de 21 gatos não diarreicos, e três amostras de urina provenientes de gatos com infecção do trato urinário (ITU). Essas cepas foram testadas pela técnica de reação em cadeia da polimerase com múltiplos iniciadores para a detecção da presença de genes codificadores de adesinas (pap, sfa e afa), assim como para a detecção dos genes produtores da toxina Shiga-like (stx1 e stx2) e do gene da intimina (eae). Oitenta e dois isolados possuíam genes codificadores de adesinas, dos quais 11 apresentaram o gene pap, 41 apresentaram o gene sfa e 27 apresentaram uma combinação dos genes pap + sfa. Nenhuma das cepas examinadas apresentou os genes stx1, stx2 ou afa. Três isolados provenientes de um gato diarreico apresentaram uma combinação dos genes sfa + eae. Animais de companhia (pets) são reservatórios naturais para diversos organismos...

Overlapped Sequence Types (STs) and Serogroups of Avian Pathogenic (APEC) and Human Extra-Intestinal Pathogenic (ExPEC) Escherichia coli Isolated in Brazil

Maluta, Renato Pariz; Logue, Catherine Mary; Tiba Casas, Monique Ribeiro; Meng, Ting; Lopes Guastalli, Elisabete Aparecida; Galvao Rojas, Thais Cabrera; Montelli, Augusto Cezar; Sadatsune, Terue; Ramos, Marcelo de Carvalho; Nolan, Lisa Kay; Silveira, Wand
Fonte: Public Library Science Publicador: Public Library Science
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: 11
ENG
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27.6%
Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP); Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES); Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq); Processo FAPESP: 12/05073-3; Processo FAPESP: 13/09167-5; Processo FAPESP: 12/04931-6; Avian pathogenic Escherichia coli (APEC) strains belong to a category that is associated with colibacillosis, a serious illness in the poultry industry worldwide. Additionally, some APEC groups have recently been described as potential zoonotic agents. In this work, we compared APEC strains with extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) strains isolated from clinical cases of humans with extra-intestinal diseases such as urinary tract infections (UTI) and bacteremia. PCR results showed that genes usually found in the ColV plasmid (tsh, iucA, iss, and hlyF) were associated with APEC strains while fyuA, irp-2, fepC sitD(chrom), fimH, crl, csgA, afa, iha, sat, hlyA, hra, cnf1, kpsMTII, clpV(Sakai) and malX were associated with human ExPEC. Both categories shared nine serogroups (O2, O6, O7, O8, O11, O19, O25, O73 and O153) and seven sequence types (ST10, ST88, ST93, ST117, ST131, ST155, ST359, ST648 and ST1011). Interestingly, ST95, which is associated with the zoonotic potential of APEC and is spread in avian E. coli of North America and Europe...

Metodos biologicos e moleculares no estudo de fatores de virulencia em amostras de Eschericia coli isoladas por hemocultura de pacientes com septicemia; Biologicals and moleculars methods in the study of virulence factors in Eschericia coli strains isolated by blood culture of patients with septicaemia

Marcelo Ananias
Fonte: Biblioteca Digital da Unicamp Publicador: Biblioteca Digital da Unicamp
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 28/08/2006 PT
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27.73%
A patogenicidade de Escherichia coli em infecções extra-intestinais (ExPEC) depende das propriedades de virulência bacterianas. Estas, geneticamente, distribuem-se por diversas ilhas associadas a patogenicidade ? blocos gênicos contíguos ? responsáveis por expressar fatores que permitem às bactérias colonizarem, sobreviverem e assim, agredirem a integridade do hospedeiro. Para setenta e três (73) amostras de E. coli oriundas de pacientes septicêmicos isoladas por hemocultura foram detectadas a sorogrupagem (antígeno O), produção de hemolisinas, produção de enzimas e letalidade em camundongos, assim como o estudo molecular pela PCR de genes dos principais FV relacionados a ExPEC: adesinas ? fímbria tipo 1 (fimH), fímbria S (sfaD/E) e fímbria P (papC), além dos alelos 1, 2 e 3 da adesina fimbrial P (papG), adesina afimbrial (afaB/C); cápsula K1/K5 (kpsMTII); sideróforos - aerobactina (iucD), yersiniabactina (fyuA) e salmoquelina (iroN); toxinas ? hemolisina (hlyA), fator necrozante citotóxico do tipo 1 (cnf1) e toxina autotransportadora secretada (sat); miscelâneos ? invasão do endotélio microvascular cerebral (ibeA), resistência sérica (traT), colicina V (cvaC) e proteína uropatogênica específica (usp). Nenhuma amostra demonstrou atividade proteolítica. A produção de hemolisina foi detectada em 20...

Presence of extraintestinal pathogenic Escherichia coli in butcheries in Taquaritinga, SP, Brazil

Santo,Edilene; Rodolpho,Daniela; Marin,José Moacir
Fonte: Sociedade Brasileira de Microbiologia Publicador: Sociedade Brasileira de Microbiologia
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/12/2007 EN
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27.42%
The study was conducted in twenty-three butcheries in the city of Taquaritinga, State of São Paulo, Brazil, surveyed during a 10 months period. Among two hundred and eighty-seven Escherichia coli strains isolated from samples of ground beef, meat-grinding-machines and the hands of manipulators, five were recognized as extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC), showing virulence factors (P and S fimbriae, hemolysin and aerobactin) and presenting multidrug resistance. Retail-sold food may constitute an important vehicle for the dissemination of ExPEC in communities, giving rise to reasons for concern.

In vivo correlates of molecularly inferred virulence among extraintestinal pathogenic Escherichia coli (ExPEC) in the wax moth Galleria mellonella model system

Williamson, Deborah A; Mills, Grant; Johnson, James R; Porter, Stephen; Wiles, Siouxsie
Fonte: Landes Bioscience Publicador: Landes Bioscience
Tipo: Artigo de Revista Científica
EN
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27.73%
In contrast to commensal Escherichia coli, extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) strains possess an array of virulence-associated genes. We sought to establish the feasibility of using the invertebrate Galleria mellonella (greater wax moth) for assessing ExPEC virulence and to investigate the correlation between genotypic determinants of virulence and in vivo pathogenicity. We observed a correlation between the number of virulence genes and larval survival, such that ExPEC isolates with higher virulence scores killed larvae significantly faster than isolates with lower virulence scores. By correlating genotypic and phenotypic virulence, we provide preliminary validation of this model for future studies investigating ExPEC virulence.

Overlapped Sequence Types (STs) and Serogroups of Avian Pathogenic (APEC) and Human Extra-Intestinal Pathogenic (ExPEC) Escherichia coli Isolated in Brazil

Maluta, Renato Pariz; Logue, Catherine Mary; Casas, Monique Ribeiro Tiba; Meng, Ting; Guastalli, Elisabete Aparecida Lopes; Rojas, Thaís Cabrera Galvão; Montelli, Augusto Cezar; Sadatsune, Teruê; de Carvalho Ramos, Marcelo; Nolan, Lisa Kay; da Silveira
Fonte: Public Library of Science Publicador: Public Library of Science
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em 12/08/2014 EN
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27.6%
Avian pathogenic Escherichia coli (APEC) strains belong to a category that is associated with colibacillosis, a serious illness in the poultry industry worldwide. Additionally, some APEC groups have recently been described as potential zoonotic agents. In this work, we compared APEC strains with extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) strains isolated from clinical cases of humans with extra-intestinal diseases such as urinary tract infections (UTI) and bacteremia. PCR results showed that genes usually found in the ColV plasmid (tsh, iucA, iss, and hlyF) were associated with APEC strains while fyuA, irp-2, fepC sitDchrom, fimH, crl, csgA, afa, iha, sat, hlyA, hra, cnf1, kpsMTII, clpVSakai and malX were associated with human ExPEC. Both categories shared nine serogroups (O2, O6, O7, O8, O11, O19, O25, O73 and O153) and seven sequence types (ST10, ST88, ST93, ST117, ST131, ST155, ST359, ST648 and ST1011). Interestingly, ST95, which is associated with the zoonotic potential of APEC and is spread in avian E. coli of North America and Europe, was not detected among 76 APEC strains. When the strains were clustered based on the presence of virulence genes, most ExPEC strains (71.7%) were contained in one cluster while most APEC strains (63.2%) segregated to another. In general...

TolC Promotes ExPEC Biofilm Formation and Curli Production in Response to Medium Osmolarity

Hou, Bo; Meng, Xian-Rong; Zhang, Li-Yuan; Tan, Chen; Jin, Hui; Zhou, Rui; Gao, Jian-Feng; Wu, Bin; Li, Zi-Li; Liu, Mei; Chen, Huan-Chun; Bi, Ding-Ren; Li, Shao-Wen
Fonte: Hindawi Publishing Corporation Publicador: Hindawi Publishing Corporation
Tipo: Artigo de Revista Científica
EN
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27.82%
While a high osmolarity medium activates Cpx signaling and causes CpxR to repress csgD expression, and efflux protein TolC protein plays an important role in biofilm formation in Escherichia coli, whether TolC also responds to an osmolarity change to regulate biofilm formation in extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) remains unknown. In this study, we constructed ΔtolC mutant and complement ExPEC strains to investigate the role of TolC in the retention of biofilm formation and curli production capability under different osmotic conditions. The ΔtolC mutant showed significantly decreased biofilm formation and lost the ability to produce curli fimbriae compared to its parent ExPEC strain PPECC42 when cultured in M9 medium or 1/2 M9 medium of increased osmolarity with NaCl or sucrose at 28°C. However, biofilm formation and curli production levels were restored to wild-type levels in the ΔtolC mutant in 1/2 M9 medium. We propose for the first time that TolC protein is able to form biofilm even under high osmotic stress. Our findings reveal an interplay between the role of TolC in ExPEC biofilm formation and the osmolarity of the surrounding environment, thus providing guidance for the development of a treatment for ExPEC biofilm formation.

Comparative Genomic Analysis Shows That Avian Pathogenic Escherichia coli Isolate IMT5155 (O2:K1:H5; ST Complex 95, ST140) Shares Close Relationship with ST95 APEC O1:K1 and Human ExPEC O18:K1 Strains

Zhu Ge, Xiangkai; Jiang, Jingwei; Pan, Zihao; Hu, Lin; Wang, Shaohui; Wang, Haojin; Leung, Frederick C.; Dai, Jianjun; Fan, Hongjie
Fonte: Public Library of Science Publicador: Public Library of Science
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em 14/11/2014 EN
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27.82%
Avian pathogenic E. coli and human extraintestinal pathogenic E. coli serotypes O1, O2 and O18 strains isolated from different hosts are generally located in phylogroup B2 and ST complex 95, and they share similar genetic characteristics and pathogenicity, with no or minimal host specificity. They are popular objects for the study of ExPEC genetic characteristics and pathogenesis in recent years. Here, we investigated the evolution and genetic blueprint of APEC pathotype by performing phylogenetic and comparative genome analysis of avian pathogenic E. coli strain IMT5155 (O2:K1:H5; ST complex 95, ST140) with other E. coli pathotypes. Phylogeny analyses indicated that IMT5155 has closest evolutionary relationship with APEC O1, IHE3034, and UTI89. Comparative genomic analysis showed that IMT5155 and APEC O1 shared significant genetic overlap/similarities with human ExPEC dominant O18:K1 strains (IHE3034 and UTI89). Furthermore, the unique PAI I5155 (GI-12) was identified and found to be conserved in APEC O2 serotype isolates. GI-7 and GI-16 encoding two typical T6SSs in IMT5155 might be useful markers for the identification of ExPEC dominant serotypes (O1, O2, and O18) strains. IMT5155 contained a ColV plasmid p1ColV5155, which defined the APEC pathotype. The distribution analysis of 10 sequenced ExPEC pan-genome virulence factors among 47 sequenced E. coli strains provided meaningful information for B2 APEC/ExPEC-specific virulence factors...

Urinary tract infections attributed to diverse ExPEC strains in food animals: evidence and data gaps

Singer, Randall S.
Fonte: Frontiers Media S.A. Publicador: Frontiers Media S.A.
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em 04/02/2015 EN
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28.05%
Between 70 and 95% of urinary tract infections (UTI) are caused by strains of Escherichia coli. These strains, often termed Extraintestinal Pathogenic E. coli (ExPEC), possess specific virulence traits allowing them to colonize more inhospitable environments, such as the urogenital tract. Some ExPEC isolates from humans have similar virulence factor profiles to ExPEC isolates from animals, and because of the potential for these strains to cause UTI in people, these infections have been referred to as foodborne UTI, or FUTI. Finding similarities in ExPEC in animals and humans is not necessarily proof of transmission, particularly a unidirectional pathway from animals to humans; similarities in virulence factor profiles should be expected given the specific bacterial requirements for colonizing physiological compartments with similar characteristics in all animals. Many of the most important strains of human ExPEC globally, such as ST131, are highly virulent and clonal implying routes of transmission other than food. Documenting routes of transmission is particularly difficult due to the wide range of potential ExPEC sources, including the human intestinal tract, and non-human reservoirs such as food animals and retail meat products...

Étude de prévalence et associations des gènes de virulence et résistance aux antimicrobiens d’Escherichia coli de la flore intestinale du poulet sain

Kaboré, Kiswendsida Paul
Fonte: Université de Montréal Publicador: Université de Montréal
Tipo: Thèse ou Mémoire numérique / Electronic Thesis or Dissertation
FR
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27.89%
Les Escherichia coli pathogènes de la volaille (APEC) font partie des E. coli extra-intestinaux pathogènes (ExPEC) et seraient un réservoir possible de gènes de virulence et de résistance aux antimicrobiens (RAM) des ExPEC chez l’humain. L’objectif de cette étude était d’évaluer l’effet d’un prébiotique et d’un mélange d’acide organique et d’huiles essentielles encapsulés sur la prévalence des gènes de virulence des ExPEC et de RAM, ainsi que les associations entre ces gènes chez E. coli de l’intestin du poulet sain. Des échantillons de contenus caecaux de poulets de 29 jours d’âge ayant reçu un de ces ingrédients alimentaires comparativement à des témoins ont été analysés pour la présence des gènes de virulence iucD, tsh, papC et des gènes de RAM blaTEM, blaSHV, tetA, tetC, blaCMY-2, aadA1, aac3 par PCR. La prévalence d’iucD était supérieure dans le groupe témoin comparativement aux groupes «prébiotique» et «acide organique» et la prévalence de papC était affectée dans le groupe «acide organique». La prévalence d’isolats d’E.coli positifs pour blaCMY-2 était supérieure dans le groupe témoin comparée aux groupes «prébiotique» et «acide organique», tel que démontré par la technique d’hybridation de l’ADN sur HGMF (Hydrophobic Grid Membrane Filter). De plus...

Fluoroquinolone-resistant extraintestinal pathogenic Escherichia coli, including O25b-ST131, isolated from faeces of hospitalized dogs in an Australian veterinary referral centre

Guo, S.; Brouwers, H.; Cobbold, R.; Platell, J.; Chapman, T.; Barrs, V.; Johnson, J.; Trott, D.
Fonte: Oxford Univ Press Publicador: Oxford Univ Press
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em //2013 EN
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27.6%
OBJECTIVES To determine rates of carriage of fluoroquinolone-resistant Escherichia coli and extraintestinal pathogenic E. coli (ExPEC) among dogs in a specialist referral hospital and to examine the population structure of the isolates. METHODS Fluoroquinolone-resistant faecal E. coli isolates (n  = 232, from 23 of 123 dogs) recovered from hospitalized dogs in a veterinary referral centre in Sydney, Australia, over 140 days in 2009 were characterized by phylogenetic grouping, virulence genotyping and random amplified polymorphic DNA (RAPD) analysis. RESULTS The RAPD dendrogram for representative isolates showed one group B2-associated cluster and three group D-associated clusters; each contained isolates with closely related ExPEC-associated virulence profiles. All group B2 faecal isolates represented the O25b-ST131 clonal group and were closely related to recent canine extraintestinal ST131 clinical isolates from the east coast of Australia by RAPD analysis. CONCLUSIONS Hospitalized dogs may carry fluoroquinolone-resistant ExPEC in their faeces, including those representing O25b-ST131.; SiYu Guo, Huub J. M. Brouwers, Rowland N. Cobbold, Joanne L. Platell, Toni A. Chapman, Vanessa R. Barrs, James R. Johnson and Darren J. Trott

Novel Pathways Revealed in Bursa of Fabricius Transcriptome in Response to Extraintestinal Pathogenic Escherichia coli (ExPEC) Infection

Sun, Hongyan; Liu, Peng; Nolan, Lisa K.; Lamont, Susan J.
Fonte: Public Library of Science Publicador: Public Library of Science
Tipo: Artigo de Revista Científica
Publicado em 10/11/2015 EN
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Extraintestinal pathogenic Escherichia coli (ExPEC) has major negative impacts on human and animal health. Recent research suggests food-borne links between human and animal ExPEC diseases with particular concern for poultry contaminated with avian pathogenic E. coli (APEC), the avian ExPEC. APEC is also a very important animal pathogen, causing colibacillosis, one of the world’s most widespread bacterial diseases of poultry. Previous studies showed marked atrophy and lymphocytes depletion in the bursa during APEC infection. Thus, a more comprehensive understanding of the avian bursa response to APEC infection will facilitate genetic selection for disease resistance. Four-week-old commercial male broiler chickens were infected with APEC O1 or given saline as a control. Bursas were collected at 1 and 5 days post-infection (dpi). Based on lesion scores of liver, pericardium and air sacs, infected birds were classified as having mild or severe pathology, representing resistant and susceptible phenotypes, respectively. Twenty-two individual bursa RNA libraries were sequenced, each yielding an average of 27 million single-end, 100-bp reads. There were 2469 novel genes in the total of 16,603 detected. Large numbers of significantly differentially expressed (DE) genes were detected when comparing susceptible and resistant birds at 5 dpi...

Understanding the Evolution of Extra-Intestinal Pathogenic Escherichia coli (ExPEC) Via Genetic Analysis of Capsular Prevalence Among Clinical Isolates and the Role of Sialic Acid in ExPEC Niche Specificity

Prest, Tiffany Lynn
Fonte: Universidade Duke Publicador: Universidade Duke
Tipo: Dissertação
Publicado em //2013
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Our purpose was to gain knowledge of the bacterial demographic using recently isolated strains causing uncomplicated UTI; we also sought to understand how capsular type has changed over time. Using multiplex PCR, data show Group 2 encapsulated strains have significantly increased in uncomplicated UTI in the past twenty years, suggesting an expansion of previously under-represented capsule types. Additionally, we find K1 encapsulated extra-intestinal pathogenic Escherichia coli (ExPEC) are significantly associated with symptomatic UTI.

K1 ExPEC are able to catabolize sialic acid for energy (glycolysis), and membrane production (LPS and peptidoglycan), as well as synthesize sialic acid for capsule expression. NanR is an ExPEC global regulator of known virulence factors, however regulation via NanR is controlled by sialic acid. Using an established murine model, fluorescent microscopy, high performance liquid chromatography, and tissue culture methods, we find K1 ExPEC use sialic acid as a signaling molecule to determine location within the host.

Capsule and Type-1 pili (T1P) are important for ExPEC pathogenesis, both in the urinary tract and in more disseminated disease; coordinated regulation of these two virulence factors has been implicated. Using a tissue culture model...