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Occurrence and molecular characterization of Cryptosporidium spp. isolated from domestic animals in a rural area surrounding Atlantic dry forest fragments in Teodoro Sampaio municipality, State of São Paulo, Brazil; Ocorrência e caracterização molecular de Cryptosporidium spp. isolados de animais domésticos de propriedades rurais circunvizinhas a fragmentos de Floresta Atlântica Seca do Estado de São Paulo, Brasil

SEVÁ, Anaiá da Paixão; FUNADA, Mikaela Renata; SOUZA, Sheila de Oliveira; NAVA, Alessandra; RICHTZENHAIN, Leonardo José; SOARES, Rodrigo Martins
Fonte: Colégio Brasileiro de Parasitologia Veterinária Publicador: Colégio Brasileiro de Parasitologia Veterinária
Tipo: Artigo de Revista Científica
ENG
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65.96%
The aim of this study was to assess the occurrence of Cryptosporidium in domestic animals in rural properties surrounding rain forest fragments within the municipality of Teodoro Sampaio, southeastern Brazil. Conventional sucrose flotation method followed by molecular characterization of the parasites by sequencing PCR products amplified from SSU rRNA gene were used. Stool samples were collected from domestic animals raised as pets and livestock in all rural properties surrounding three forest fragments. Samples from cattle (197), equine (63), pigs (25), sheep (11), and dogs (28) were collected from 98 rural properties. The frequency of occurrence of Cryptosporidium within each animal species was 3.0% (6/197) among cattle and 10.7% (3/28) among dogs. Cryptosporidium was not detected in stool samples from equine, sheep, and pigs. All sequences obtained from the six samples of calves showed molecular identity with Cryptosporidium andersoni while all sequences from dog samples were similar to C. canis. The frequency of occurrence of Cryptosporidium in these domestic animal species was low. The absence of C. parvum in the present study suggests that the zoonotic cycle of cryptosporidiosis may not be relevant in the region studied. The presence of Cryptosporidium species seldom described in humans may be...

Epidemiologia molecular do vírus da laringotraqueíte infecciosa isolados de surtos em poedeiras comerciais no Estado de São Paulo; Molecular epidemiology of Infectious laryngotracheitis vírus isolated from an outbreak in commercial layer flocks in São Paulo State

Villanueva, Jorge Luis Chacón
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 09/01/2009 PT
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55.95%
Este estudo teve como objetivo detectar e caracterizar molecularmente isolados de campo do vírus da laringotraqueíte infecciosa (VLTI) detectados de aves comerciais com e sem sintomatologia da doença de diferentes regiões do Estado de São Paulo. O estudo incluiu amostras coletadas durante e após o primeiro surto epidêmico da laringotraqueíte infecciosa (LTI) no Brasil, região de Bastos, e de outras localidades durante o período de 2002-2008. A caracterização molecular foi realizada através da técnica de polimorfismo do comprimento de fragmentos de restrição (RFLP) de produtos da reação em cadeia pela polimerase (PCR) dos genes da glicoproteína E, G, proteína quinase (TK) e da proteína reguladora da transcrição (ICP4), assim como pela análise de seqüências dos genes TK e ICP4. Para seqüenciamento do gene ICP4 foram desenvolvidas duas reações de PCR que amplificam dois diferentes fragmentos do gene ICP4. As técnicas de PCR-RFLP e seqüenciamento de DNA mostraram resultados idênticos, diferenciando os isolados de campo das cepas vacinais de origem de cultivo celular (TCO) e de embrião de galinha (CEO). Os resultados mostraram que o surto clínico na região de Bastos foi causado por uma cepa não vacinal e de alta virulência (cepa Bastos)...

Ocorrência e caracterização molecular de Cryptosporidium spp. (Apicomplexa: Cryptosporidiidae) em aves domésticas e em aves exóticas mantidas em cativeiro no Brasil; Occurrence and molecular characterization of Cryptosporidium spp. (Apicomplexa: Cryptosporidiidae) in domestic and exotic birds kept in captivity in Brazil

Nakamura, Alex Akira
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 28/08/2008 PT
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65.96%
A criptosporidiose é considerada uma das principais infecções por protozoários em aves, e já foi descrita em mais de 30 espécies de aves de várias Ordens, como Anseriformes, Charadriformes, Columbiformes, Galliformes, Passeriformes, Psitaciformes e Struthioniformes. Três espécies de Cryptosporidium infectam aves: Cryptosporidium baileyi, Cryptosporidium galli e Cryptosporidium meleagridis. Além dessas espécies, há vários genótipos distintos geneticamente das espécies de Cryptosporidium já descritas em aves, como os genótipos I, II, III e IV de aves. Há vários relatos de infecção por Cryptosporidium nos tratos gastrintestinal, respiratório e na bursa de Fabricius, resultando em perdas econômicas e mortalidade. O objetivo desse estudo foi a detecção de Cryptosporidium e sua caracterização molecular, em amostras de fezes de aves domésticas e de aves exóticas mantidas em cativeiro no Brasil. Foram coletadas 966 amostras de fezes de 18 famílias de aves. As amostras foram conservadas em solução de dicromato de potássio 2,5% a 4º C, até o processamento. Para purificação e concentração dos oocistos, foi utilizada a técnica de centrífugo-flutuação em solução de Sheather seguida de análise microscópica...

Caracterização molecular de germoplasma de batata (Solanum tuberosum L.) por microssatélites; Molecular characterization of commercial cultivars of potato using SSR markers

Favoretto, Patrícia
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 02/06/2009 PT
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55.94%
A cultura da batata (Solanum tuberosum L) está se tornando cada vez mais importante, tanto do ponto de vista dos produtores, dos pesquisadores e dos consumidores, por ser um dos alimentos protéicos mais consumidos em todo o mundo, entretanto, o Brasil depende de variedades importadas, originárias de clima temperado o que não condiz com as nossas condições, refletindo assim em valores inferiores de produtividade e de qualidade. Apesar da grande evolução que esta cultura apresentou em todos estes anos de cultivo se faz necessário a busca por materiais mais produtivos, adaptados e resistentes. Os programas de melhoramento convencionais são extremamente importantes para a seleção de novos progenitores, entretanto o tempo gasto para desenvolver e lançar uma variedade é bastante longo. Diante deste cenário, novas metodologias estão sendo cada vez mais utilizadas no processo de identificação de bancos de germoplasma e cultivares mais promissoras. O objetivo deste trabalho foi avaliar, por meio de marcadores microssatélites, 108 acessos de batata de cinco coleções contendo variedades comerciais, clones para programas de melhoramento e cultivo orgânico, visando a caracterização genética, a identificação de duplicatas e de possíveis parentais para uso nos programas de melhoramento. Para a caracterização molecular foram utilizados 10 iniciadores específicos (primers)...

Caracterização molecular de isolados de Giardia spp. provenientes de amostras fecais de origem humana da Baixada Santista, estado de São Paulo, pela análise de fragmentos do gene codificador da glutamato desidrogenase (gdh) e beta-giardina (bg); Molecular characterization of Giardia spp. From fecal samples of human origin from Baixada Santista, Sao Paulo state, by analysis of fragments of the gene encoding glutamate dehydrogenase (gdh) and beta-giardin (bg)

Martins, Juliana
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 16/09/2010 PT
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66.01%
Giardia duodenalis é um protozoário entérico de distribuição mundial responsável por causar a giardíase em uma grande variedade de mamíferos, incluindo os humanos. É considerada uma espécie complexa, no qual os isolados podem ser classificados em sete agrupamentos genéticos distintos apesar de serem morfologicamente indistinguíveis. O presente trabalho teve como objetivo avaliar a variabilidade genotípica de isolados de G. duodenalis provenientes de humanos naturalmente infectados, residentes em cidades do litoral de São Paulo, na Baixada Santista. A caracterização molecular de 43 isolados pelo seqüenciamento parcial de genes codificadores da enzima glutamato-desidrogenase (gdh) e da proteína beta-giardina (bg) mostrou que o assemblage B da G. duodenalis é o mais freqüente na região litorânea, ocorrendo em 53,5% (n=23) das amostras, sendo o assemblage A identificado em 34,8% (n=15). A maioria das seqüências obtidas pelo gene gdh se mostrou polimórfica, caracterizada por picos duplos de nucleotídeos em algumas posições em cromatograma e quando a análise dos dois genes foi combinada cinco isolados apresentaram identidades diferentes. A esses fenômenos duas explicações são atribuídas, infecção mista ou heterozigose de seqüência alélica. As análises filogenéticas mostraram que o gene bg é mais conservado que o gene gdh...

Caracterização molecular e perfil de sensibilidade de Candida tropicalis isoladas em corrente sanguínea e cateter de pacientes internados em hospitais de ensino; Molecular characterization and susceptibility profile of Candida tropicalis isolated from bloodstream culture and catheter in nosocomial patients from teaching hospitals

Magri, Marcello Mihailenko Chaves
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 28/11/2012 PT
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55.96%
Infecções causadas por Candida tropicalis (C. tropicalis) são associados à elevada morbi-mortalidade, e foram consideradas como importantes causas de infecção de corrente sanguínea no Hospital das Clínicas da Faculdade de Medicina da Universidade de São Paulo (HCFMUSP) de março de 1998 a março de 2001. Adicionalmente, são responsáveis pelo aumento do tempo e dos custos de hospitalização e necessidade de cuidados intensivos. Esse estudo tem como objetivo a caracterização molecular e perfil de sensibilidade de 61 isolados de C. tropicalis a partir de candidemias no HCFMUSP e Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP), através das técnicas de amplificação aleatória do DNA polimórfico (RAPD), eletroforese em campo pulsátil (PFGE), tipagem de sequências de múltiplos locus gênicos (MLST) e antifungigrama por microdiluição pelos métodos propostos, Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) e European Committee on Antibiotic Susceptibility Testing (EUCAST). A análise filogenética por RAPD evidenciou que os iniciadores P1 e P2 mostraram maior capacidade de discriminação que P3. Na análise por PFGE com enzimas de restrição SfiI, SmaI, BssHII e NaeI, a enzima BssHII mostrou maior poder discriminatório. MLST contribuiu com 36 novas diploid sequence type (DSTs) e 23 novos alelos...

Importância de mamíferos neotropicais na epidemiologia de protozooses: diagnóstico, caracterização molecular e aspectos ecológicos da infecção por Giardia e Cryptosporidium; Importance of neotropical mammals in the epidemiology of protozoosis: diagnosis, molecular characterization and ecological aspects of infection by Giardia and Cryptosporidium

Santos, Renata Carolina Fernandes
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 07/10/2011 PT
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66%
Giardia e Cryptosporidium são protozoários cosmopolitas cuja epidemiologia é especialmente importante devido ao seu expressivo potencial zoonótico. Animais silvestres são frequentemente relatados como reservatórios da giardiose e criptosporidiose humanas, todavia, são escassas as evidências sobre sua real importância na manutenção e disseminação destas protozooses. No intuito de avaliar a ocorrência e determinar os genótipos responsáveis pela infecção de mamíferos neotropicais, 452 amostras fecais procedentes de 52 diferentes espécies, in situ e ex situ, de sete localidades distintas foram avaliadas por métodos de diagnóstico microscópico, seguidos por técnicas moleculares de amplificação (Nested PCR), sequenciamento e caracterização genotípica. Os resultados revelaram prevalência aparente de 6,2% para Giardia spp. e de 4,8% para Cryptosporidium spp. (n=343). Dezessete diferentes espécies de mamíferos silvestres foram positivas, sendo 11 para Giardia spp., nove para Cryptosporidium spp. e três para ambos os protozoários. A caracterização molecular revelou a predominante presença de genótipos zoonóticos em mamíferos cativos (Giardia duodenalis genótipo AI) e de genótipos hospedeiro-específicos em animais de vida livre (Cryptosporidium sp. rat genotype III e Cryptosporidium wrairi). Foram também identificados Giardia duodenalis genótipo D em cachorro-do-mato Cerdocyon thous e Cryptosporidium sp. deer mouse genotype IV em bugio-preto Alouatta caraya...

Detecção e caracterização molecular de Staphylococcus aureus meticilina resistente em amostras de pacientes hepatopatas; Detection and molecular characterization of methicillin-resistant Staphylococcus aureus in samples of patients with liver disease

Oliveira, Larissa Marques de
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 26/02/2015 PT
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56.01%
Introdução: Staphylococcus aureus é um patógeno que frequentemente coloniza pacientes cirróticos e transplantados de fígado. A colonização por S. aureus aumenta o risco de infecções invasivas por MRSA (Methicillin Resistant Staphylococcus aureus) o que aumenta a duração da hospitalização, os custos, a morbidade e a mortalidade. Com isso, é de grande importância o desenvolvimento de estratégias para identificação rápida, prevenção e controle de MRSA nesta população de pacientes. Objetivos: detectar MRSA em pacientes hepatopatas e descrever as características fenotípicas e moleculares de isolados MRSA neste grupo de pacientes. Metodologia: swabs nasais e inguinais foram coletados de 126 pacientes pré-transplante e 64 pacientes transplantados de fígado. Os swabs foram destinados para cultura microbiológica e também para extração direta de DNA. Foi determinada a Concentração Inibitória Mínima de 10 antimicrobianos de todos os isolados MRSA os quais também foram submetidos à caracterização de SCCmec, PFGE e spa typing. Amostras de DNA também foram submetidas à PCR 16S, MPCR coA/mecA e caracterização de SCCmec. Resultados: de acordo com a cultura microbiológica 12% dos swabs cultivados apresentaram crescimento de MRSA...

Caracterização molecular de genes do sistema imune de búfalo

Borges, Mariana Maciel
Fonte: Universidade Estadual Paulista (UNESP) Publicador: Universidade Estadual Paulista (UNESP)
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: xii, 65 p. : il.
POR
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55.99%
Pós-graduação em Genética e Melhoramento Animal - FCAV; In mammals, genes related to immune response to pathogens are organized in a genomic region named Major Histocompatibility Complex (MHC). MHC genes are also involved in mate-choice, occurrence of spontaneous abortions and maintenance of pregnancy. The existence of a genomic library, constructed with buffalo genome, allows the characterization of MHC genes, providing sources for understanding the mechanisms involved in resistance/susceptibility to diseases and in reproduction, contributing for annotation of these genes on buffalo genome. To determine the molecular structure of buffalo immune system genes, the present study aimed to identify and characterize clones containing class IIb markers from a buffalo genomic library. Selection of clones was performed by PCR technique, according to three-dimensional system (superpool, singlepool, row/column system) in which clones are arranged. To identify the clones were used 21 class IIb markers, previously mapped on buffalo chromosome 2. Among the 33.792 clones evaluated, three clones were identified for the MHC markers 11.05, 12.05, 13.00 and DMA. These clones were then purified and sequenced by pyrosequencing, presenting insert size ranging from 26 to 117 Kb. Each clone sequence were aligned with two bovine genome assemblies (UMD_3.1 and Btau_4.6.1)...

Detecção, isolamento e caracterização molecular parcial de virus respiratorio sincicial bovino (BRSV) em amostras de campo; Detection, isolation and molecular characterization of bovine respiratory syncytial virus (BRSV) in field samples

Helena Gallicchio Domingues
Fonte: Biblioteca Digital da Unicamp Publicador: Biblioteca Digital da Unicamp
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 05/07/2005 PT
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56.04%
No presente estudo, técnicas para a detecção do vírus respiratório sincicial bovino, BRSV, visando ao diagnóstico e caracterização molecular deste patógeno, foram adaptadas e aplicadas em amostras coletadas de animais sem levar em consideração a presença de sinais e sintomas clínicos característicos de infecções causadas por esse agente. Foi coletado um total de 278 amostras de secreções nasais e fragmentos pulmonares de rebanhos bovinos provenientes dos estados de São Paulo e Rio Grande do Sul. Utilizando a técnica de RT-PCR detectou-se a presença de BRSV em sete amostras, duas de secreções nasais e cinco de fragmentos de pulmões. As amostras positivas foram submetidas ao isolamento viral e um novo isolado, denominado BRSV-108-BR, foi obtido após nove passagens em cultivos de células. Os fragmentos de 603 pb correspondentes ao segmento genômico da proteína G das amostras de BRSV em estudo, obtidos com a técnica de RT-PCR, foram submetidos à análise por enzimas de restrição-REA e ao seqüenciamento, visando sua caracterização molecular. Com a técnica de REA foram identificadas variações genéticas entre as amostras de BRSV detectadas, sugestivas de que duas amostras pertenciam ao subgrupo AB e cinco...

Detecção e caracterização molecular de defeitos no ciclo de carnitina

Sousa, Carmen Marília Moreira de
Fonte: Universidade de Aveiro Publicador: Universidade de Aveiro
Tipo: Dissertação de Mestrado
POR
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55.97%
O ciclo da carnitina é uma etapa fundamental da oxidação mitocondrial dos ácidos gordos de cadeia longa, porque catalisa o seu transporte até à matriz mitocondrial para serem oxidados. Este transporte requer quatro proteínas. O transportador de carnitina orgânico (OCTN2), a carnitina palmitoiltransferase 1 (CPT1), a carnitina acilcarnitina translocase (CACT) e a carnitina palmitoiltransferase 2 (CPT2). As alterações nos genes que codificam estas proteínas causam doenças da oxidação mitocondrial dos ácidos gordos, com uma apresentação clínica metabólica, miopática ou cardíaca, que estão associadas à morte súbita infantil. A espectrometria de massa em tandem veio possibilitar o rastreio destas patologias através da avaliação do perfil de acilcarnitinas. Este estudo baseia-se na sua detecção e caracterização molecular. Foram estudados 15 casos e 30 familiares; 11 casos do rastreio neonatal, 2 provenientes de centros estrangeiros e 2 casos com fenótipo clínico. Foram caracterizados molecularmente 13 casos, detectadas 14 mutações causais, cinco das quais não estavam descritas na literatura ou na base de dados HGMD e 8 variantes polimórficas descritas no NCBI. Foram encontradas 5 mutações missense, 4 mutações frameshift (pequenas delecções e inserções)...

Desenvolvimento de metodologias de diagnóstico e caracterização molecular de Poliomavírus

Ferreira, Rita Susana da Silva
Fonte: Universidade de Lisboa Publicador: Universidade de Lisboa
Tipo: Dissertação de Mestrado
Publicado em //2009 POR
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56.02%
Tese de mestrado. Biologia (Biologia Molecular Humana). Universidade de Lisboa, Faculdade de Ciências, 2009; A família Polyomaviridae é composta por vírus de pequenas dimensões que, após infectarem o hospedeiro, permanecem em estado latente. No entanto, em situações de imunossupressão, têm capacidade de induzir sintomatologia e/ou doença no hospedeiro. O Poliomavírus JC (JCV), o Poliomavírus BK (BKV) e o Poliomavírus MC (MCV), encontram-se associados à Leucoencefalopatia Multifocal Progressiva, à Nefropatia Associada a Poliomavírus e ao Carcinoma das Células de Merkel, respectivamente. Relativamente aos Poliomavírus KI (KIV) e WU (WUV), ainda não foi estabelecido um papel etiológico. Devido à importância clínica do JCV e do BKV, bem como à necessidade de aprofundar o conhecimento sobre os novos Poliomavírus, é fundamental desenvolver e implementar metodologias sensíveis e específicas para o seu diagnóstico e caracterização molecular. Os objectivos deste trabalho foram o desenvolvimento e a optimização de metodologias de biologia molecular, para a detecção e quantificação destes vírus, bem como a caracterização molecular dos Poliomavírus JC e BK, de forma a determinar a proporção dos diferentes tipos circulantes. Foram desenvolvidas e validadas metodologias para a detecção do BKV (sensibilidade e especificidade de 100%)...

Caracterização molecular de espécies de Candida isoladas de portadores de AIDS e de portadores de Câncer atendidos em Hospitais-Escola de Maceió, Alagoas

Araújo, Maria Anilda dos Santos; Queiroz, Lusinete Acioli (Orientadora)
Fonte: Universidade Federal de Pernambuco Publicador: Universidade Federal de Pernambuco
Tipo: Outros
PT_BR
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65.99%
Foi realizada a caracterização molecular de espécies de Candida isoladas de espécimens clínicos de pacientes portadores de AIDS e de portadores de Câncer atendidos em Hospitais-Escola de Maceió-Alagoas; também foi verificada a diversidade genética em níveis específicos e intraespecífico das leveduras isoladas. Foram coletadas amostras de sangue, secreção da orofaringe e urina de pacientes portadores de AIDS atendidos no setor de Infectologia do Hospital Dia HUPAA/UFAL e no Hospital Escola Dr. Hélvio Auto, como também de pacientes portadores de câncer atendidos no Setor de Oncologia do Hospital Universitário Prof. Alberto Antunes/UFAL, sendo analisado 405 amostras clínicas. Após isolamento, as leveduras foram purificadas e identificadas. Entre 135 pacientes analisados foi observada uma ocorrência de 35% de isolados de leveduras, sendo a secreção de orofaringe o espécimen clínico do qual houve prevalência (78%), seguido de urina (22%). Entre as espécies de maior ocorrência está Candida albicans (63%), seguida de C. glabrata (22%), C. guilliermondii (18%), C. parapsilosis (14%) e C. tropicalis (8%). Posteriormente, foi realizada a caracterização molecular das espécies de leveduras, pela análise dos produtos de PCR amplificados com iniciador para a região ITS do rDNA...

Detecção e caracterização molecular de talassemia alfa; Detection and molecular characterization of alpha thalassemia

PENNA, Karlla Greick Batista Dias
Fonte: Universidade Federal de Goiás; BR; UFG; Doutorado em Biologia; Ciencias Biologicas Publicador: Universidade Federal de Goiás; BR; UFG; Doutorado em Biologia; Ciencias Biologicas
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
POR
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56.02%
Alpha thalassemia is a syndrome resulting from disturbances in the synthesis of alpha globin chain that forms the tetramer of the hemoglobin molecule. Alpha thalassemia is classified into four types according to the number of alpha genes affected: silent carrier (-α/αα), alpha thalassemia trait (--/αα or -α/-α) Hemoglobin H disease (-- /-α), and fetalis hydrops (--/--). The decrease in synthesis of alpha globin causes inadequate production of hemoglobin resulting in hypochromic and microcytic anaemia. Also it causes accumulation of beta chains, inside the erythrocytes, resulting in formation of beta chain tetramer of hemoglobin called Hb H. Clinically the individual with thalassemia can be asymptomatic or present severe anemia. Asymptomatic forms of thalassemia, silent carrier and alpha thalassemia trait, are more difficult to diagnose because of the inclusions bodies of Hb H are not always present. In these situations it is necessary to research the molecular characterization of the genotype and confirming the presence of alpha thalassemia. This is mainly because the diagnosis by conventional methods, although important, is limited and imprecise. This study evaluated some of the traditional laboratory methods in the detection of alpha thalassemia and associated molecular characterization of the more prevalent deletion forms α3...

Caracterização molecular de isolados de Trypanosoma cruzi obtidos de mulheres durante a fase crônica da doença de Chagas

Avelar, Juliana Boaventura
Fonte: Universidade Federal de Goiás; BR; UFG; Mestrado em Medicina Tropical; Medicina Publicador: Universidade Federal de Goiás; BR; UFG; Mestrado em Medicina Tropical; Medicina
Tipo: Dissertação Formato: application/pdf
POR
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55.99%
Chagas disease is a zoonotic disease caused by a protozoan plagued called Trypanosoma cruzi, it is a particular problem in Latin America, where it is estimated that 12 to 14 million people are infected. The populations of Trypanosoma cruzi can be divided into two major groups, the Trypanossoma cruzi I (TCI) and Trypanossoma cruzi II (TCII), the last being more heterogeneous and divided into five subgroups TCIIa, TCIIb, TCIIc, TCIId and TCIIe However, little is known of epidemiological and clinical implications of these ratings. The frequency of vertical transmission of Chagas disease can vary from 1.6 to 18.5% in accordance with the region and the methodology used in the studies. The aim of this study was to genetic characterization of 30 isolates of T. cruzi through the blood of patients with Chagas disease in the chronic phase, pregnant and not pregnant. The genetic characterization was performed with three different markers that amplified regions of the 18S and 24S α DNA ribosomal and mini-exon of the gene that allows classify the groups and subgroups of the parasite and the analysis of genetic variability among isolates of T. cruzi was performed the characterization of the variable region of minicicles of kDNA through the technique of Low-Stringency Single Specific Primer-PCR (LSSP-PCR). The 30 patients studied 75% (25/30) were women and 25% (5 / 30) not pregnant. The patients are the four different Brazilian regions being the States of Bahia 53.3% (16/30)...

Identificação e caracterização molecular do vírus dengue em indivíduos sintomáticos atendidos na rede pública de saúde de Goiânia – Goiás, durante o período epidêmico 2012-2013; Identification and molecular characterization of dengue vírus in symptomatic individuals seen in public basic health care of Goiânia – Goiás during the epidemic period 2012-2013

Guimarães, Vanessa Neiva
Fonte: Universidade Federal de Goiás; Brasil; UFG; Programa de Pós-graduação em Biologia das Interações PH (IPTSP); Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública - IPTSP (RG) Publicador: Universidade Federal de Goiás; Brasil; UFG; Programa de Pós-graduação em Biologia das Interações PH (IPTSP); Instituto de Patologia Tropical e Saúde Pública - IPTSP (RG)
Tipo: Dissertação Formato: application/pdf
POR
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56%
Dengue is a major challenge to public health in Brazil and worldwide. Dengue virus (DENV) is an arbovirus of the family Flaviviridae, genus Flavivirus, classified into four antigenically distinct serotypes DENV1-4. Since the introduction of DENV1 in Goiás, the current situation consisted of successive epidemics of dengue fever with change among prevalence serotypes. One of the factors that have been associated with the pathogenesis of this infection is the occurrence of a cross-serotype immune response in secondary infections. Thus, the identification of circulating serotypes and also the characterization of the genomic variants have been considered important on disease surveillance, since the introduction of new variants can be a risk factor for severe dengue. In this context, the present study aimed to investigate the occurrence of DENV infection in individuals treated at health centers in Goiânia, Goiás in the epidemic period 2012-2013, using serological and molecular methods for determining the rate of positivity and identification of serotypes/genotypes in the circulating virus. For this, 278 samples from suspected individuals of DENV infection, which were submitted to the research of serological markers NS1, IgM and IgG using a commercial kit...

Detecção e caracterização molecular de defeitos no ciclo da carnitina

Sousa, Carmen
Fonte: Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge Publicador: Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge
Tipo: Dissertação de Mestrado
Publicado em //2009 POR
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55.97%
Dissertação de Mestrado em Biologia Molecular e Celular apresentada à Universidade de Aveiro, 2009; Laura Vilarinho, Departamento de Genética Humana do Instituto Nacional de Saúde Doutor Ricardo Jorge (Porto); O ciclo da carnitina é uma etapa fundamental da oxidação mitocondrial dos ácidos gordos de cadeia longa, porque catalisa o seu transporte até à matriz mitocondrial para serem oxidados. Este transporte requer quatro proteínas. O transportador de carnitina orgânico (OCTN2), a carnitina palmitoiltransferase 1 (CPT1), a carnitina acilcarnitina translocase (CACT) e a carnitina palmitoiltransferase 2 (CPT2). As alterações nos genes que codificam estas proteínas causam doenças da oxidação mitocondrial dos ácidos gordos, com uma apresentação clínica metabólica, miopática ou cardíaca, que estão associadas à morte súbita infantil. A espectrometria de massa em tandem veio possibilitar o rastreio destas patologias através da avaliação do perfil de acilcarnitinas. Este estudo baseia-se na sua detecção e caracterização molecular. Foram estudados 15 casos e 30 familiares; 11 casos do rastreio neonatal, 2 provenientes de centros estrangeiros e 2 casos com fenótipo clínico. Foram caracterizados molecularmente 13 casos...

Detecção e caracterização molecular do gene 3 e 5 do coronavírus de perus (TCOV) isolados de perus com severa enterite no Brasil.; Detection and molecular characterization of gene 3 and 5 of turkey coronavirus (TCoV) from turkeys with severe enteritis in Brazil.

Bünger, Amarilis Novaes D'Elboux
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 26/08/2009 PT
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65.96%
O coronavírus de perus (TCoV) é o agente etiológico associado a síndrome de mortalidade entérica das aves (PEMS). PEMS é uma enfermidade entérica, aguda e altamente contagiosa dos perus caracterizada por depressão, anorexia, diarréia e alta mortalidade em lotes de perus comerciais. A presença do coronavírus de perus (TCov) foi pesquisada em 29 amostras de conteúdo intestinal de perus entre 10 e 104 dias de idade que apresentaram enterite severa no período de 2004 a 2006. A detecção do TcoV foi realizada realizada através da técnica da transcriptase reversa e da reação em cadeia pela polimerase (RT-PCR), mediante a amplificação da região 3 UTR, seguida pela amplificação dos genes 3 e 5. A caracterização molecular dos vírus foi realizada mediante a amplificação dos genes 3 e 5, que mostrou similaridade genética entre as amostras, mas diferenças com as sequencias dos outros TCoVs publicados previamente. Em relação ao gene 3, as amostras apresentaram maior relação com o vírus da bronquite infecciosa das aves (IBV), enquanto que com o gene 5 houve maior identidade com os cronavírus de faisão (PhCoV). Nossos resultados sugerem que a estratégia de amplificação da região 3 UTR provou ser uma estratégia eficaz para a detecção do TcoV em conteúdo intestinal.; Turkey coronavirus (TCoV) is causative agent associated to Poult Enteritis and Mortality Syndrome (PEMS) in turkeys wideworld. The disease is characterized by an acute highly contagious enteric disease of turkeys characterized by depression...

Caracterização molecular do HTLV-1/2 em doadores de sangue em Belém, Estado do Pará: primeira descrição do subtipo HTLV-2b na região Amazônica

Santos,Ethienne Lobato dos; Tamegão-Lopes,Bruna; Machado,Luiz Fernando Almeida; Ishak,Marluísa de Oliveira Guimarães; Ishak,Ricardo; Lemos,José Alexandre Rodrigues de; Vallinoto,Antonio Carlos Rosário
Fonte: Sociedade Brasileira de Medicina Tropical - SBMT Publicador: Sociedade Brasileira de Medicina Tropical - SBMT
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/06/2009 PT
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Este trabalho objetivou a caracterização molecular do vírus linfotrópico de células T humanas infectando doadores de sangue atendidos na Fundação Centro de Hemoterapia e Hematologia do Pará. Amostras de DNA de 79 indivíduos soropositivos para o vírus linfotrópico de células T humanas foram analisadas por meio da reação em cadeia da polimerase para as regiões genômicas pX, env e 5'LTR, de polimorfismos de comprimento de fragmentos de restrição e do seqüenciamento da região 5LTR, com posterior análise filogenética, definindo o tipo e o subtipo do HTLV circulante na população estudada. Observou-se uma maior prevalência de HTLV-1 (71%) em relação ao HTLV-2 (29%). As amostras de HTLV-1 sequenciadas foram classificadas como pertencentes ao subtipo Cosmopolita, subgrupo Transcontinental, sendo as de HTLV-2 identificadas como HTLV-2c. A análise de polimorfismos de comprimento de fragmentos de restrição da região env e do sequenciamento da região 5'LTR, identificou, pela primeira vez na Amazônia Brasileira, uma amostra de HTLV-2b, enfatizando a necessidade de estudos moleculares contínuos na região para melhor entendimento da epidemiologia de transmissão do HTLV na população e permitir a vigilância epidemiológica da emergência de novos tipos e subtipos.

Caracterização molecular de plantéis de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus L.) em Santa Catarina, Brasil

Halfen, Gustavo Emygdio; Nicoletti, Maycon Eduardo; Appel, Henrique B.; Tcacenco, Fernando Adami
Fonte: Journal of Biotechnology and Biodiversity Publicador: Journal of Biotechnology and Biodiversity
Tipo: info:eu-repo/semantics/article; info:eu-repo/semantics/publishedVersion; ; Formato: application/pdf
Publicado em 22/05/2012 POR
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Com o aumento da demanda de produção de alimentos na atualidade, a aquicultura tem um papel promissor na contribuição da oferta de alimentos. Merece destaque o cultivo de tilápias, cuja produção mundial ultrapassou dois milhões de toneladas, sendo o segundo maior grupo de peixes produzidos pela aquicultura, ficando apenas atrás das carpas. A espécie mais cultivada é a tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus Linnaeus, 1758), devido principalmente à alta prolificidade, crescimento rápido e boa aceitação do consumidor, características buscadas com o melhoramento genético. O melhoramento genético de peixes cultivados tem tido como uma de suas bases os progressos obtidos na área da genética molecular. O conjunto de métodos desenvolvidos nessa ciência nas últimas décadas possibilitou, com sua incorporação na aqüicultura, ganhos consideráveis, particularmente quando aplicados no melhoramento genético assistido por marcadores moleculares. A diversidade genética em populações de tilápias pode ser determinada através de marcadores moleculares como do tipo RAPD. O presente trabalho visou ao levantamento da variabilidade genética existente entre as quatro populações de tilápia do Nilo que formam o Núcleo Satélite de Tilápia do Nilo do Estado de Santa Catarina...