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Synthesis, mechanism of formation, and molecular orbital calculations of arylamidoximes

SRIVASTAVA, Rajendra M.; PEREIRA, Maria C.; FAUSTINO, Wagner W. M.; Coutinho, Kaline Rabelo; ANJOS, Janaina V. dos; MELO, Sebastiao J. de
Fonte: SPRINGER WIEN Publicador: SPRINGER WIEN
Tipo: Artigo de Revista Científica
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A simple and easy synthesis of ten arylamidoximes from arylnitriles and hydroxylamine is described. The formation of the arylamides has been observed to a much lesser extent in the present work. A new mechanism for the formation of arylamidoximes, as well as arylamides, from arylnitriles and hydroxylamine is suggested. Quantum mechanical calculations have been carried out to support this mechanism. The enthalpy of formation in conjunction with atomic charges of the reactants and intermediates helped to understand more about the generation of the products.; Brazilian National Research Council (CNPq); Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq)

Azo-hydrazone tautomerism in protonated aminoazobenzenes: Resonance Raman spectroscopy and quantum-chemical calculations

MATAZO, Deborah R. C.; ANDO, Romulo A.; BORIN, Antonio C.; SANTOS, Paulo S.
Fonte: AMER CHEMICAL SOC Publicador: AMER CHEMICAL SOC
Tipo: Artigo de Revista Científica
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The protonation effect on the vibrational and electronic spectra of 4-aminoazobenzene and 4-(dimethylamino)azobenzene was investigated by resonance Raman spectroscopy, and the results were discussed on the basis of quantum-chemical calculations. Although this class of molecular systems has been investigated in the past concerning the azo-hydrazone tautomerism, the present work is the first to use CASSCF/CASPT2 calculations to unveil the structure of both tautomers as well the nature of the molecular orbitals involved in chromophoric moieties responsible for the resonance Raman enhancement patterns. More specifically both the resonance Raman and theoretical results show clearly that in the neutral species, the charge transfer transition involves mainly the azo moiety, whereas in the protonated forms there is a great difference, depending on the tautomer. In fact, for the azo tautomer the transition is similar to that observed in the corresponding neutral species, whereas in the hydrazone tautomer such a transition is much more delocalized due to the contribution of the quinoid structure. The characterization of protonated species and the understanding of the tautomerization mechanism are crucial for controlling molecular properties depending on the polarity and pH of the medium.

Crystal structure and theoretical calculations of Julocrotine, a natural product with antileishmanial activity

MOREIRA, Rafael Y. O.; BRASIL, Davi S. B.; ALVES, Claudio N.; GUILHON, Giselle M. S. P.; SANTOS, Lourivaldo S.; ARRUDA, Mara S. P.; MUELLER, Adolfo H.; BARBOSA, Patricia S.; ABREU, Alcicley S.; SILVA, Edilene O.; RUMJANEK, Victor M.; SOUZA JR., Jaime; SIL
Fonte: JOHN WILEY & SONS INC Publicador: JOHN WILEY & SONS INC
Tipo: Artigo de Revista Científica
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Julocrotine, N-(2,6-dioxo-l-phenethyl-piperidin-3-yl)-2-methyl-butyramide, is a potent antiproliferative agent against the promastigote and amastigote forms of Leishmania amazonensis (L.). In this work, the crystal structure of Julocrotine was solved by X-ray diffraction, and its geometrical parameters were compared with theoretical calculations at the B3LYP and HF level of theory. IR and NMR spectra also have been obtained and compared with theoretical calculations. IR absorptions calculated with the B3LYP level of theory employed together with the 6-311G+(d,p) basis set, are close to those observed experimentally. Theoretical NMR calculations show little deviation from experimental results. The results show that the theory is in accordance with the experimental data. (C) 2007 Wiley Periodicals, Inc.

Raman spectroscopy and DFT calculations of para-coumaric acid and its deprotonated species

Cunha, Vanessa R. R.; Constantino, Vera Regina Leopoldo; Ando, Rômulo Augusto
Fonte: ELSEVIER SCIENCE BV; AMSTERDAM Publicador: ELSEVIER SCIENCE BV; AMSTERDAM
Tipo: Artigo de Revista Científica
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An electronic and vibrational spectroscopic analysis of p-coumaric acid (HCou) and its deprotonated species was performed by UV-vis and Raman, respectively, and the results were supported by density functional theory (OFT) calculations. Electronic UV-vis spectral data of HCou solutions show that the deprotonation of the carboxyl group (Cou(-)) leads to a blue shift of the lowest energy electronic transition in comparison to the neutral species, whereas the subsequent deprotonation of the phenolic moiety (Cou(2-)) carries out to a more delocalized chromophore. The DFT geometric parameters calculations suggest that the variation in the electronic delocalization for the three organic species is due to different contribution of a quinoid structure that is significantly distorted in the case of Cou(2-). The Raman data of HCou and its sodium salts show that the main spectral features that allow to differentiate the three organic species are those involving the styrene nu(C=C)(sty) vibration at 1600cm(-1) region. Even though the Raman spectra of the sodium salts of Cou(-) and Cou(2-) anions show subtle differences, the appearing of a band at ca. 1598cm(-1) in the Na(2)Cou spectrum, assigned to a mode involving the carboxylate asymmetric stretching...

The T-2 phase in the Nb-Si-B system studied by ab initio calculations and synchrotron X-ray diffraction

Joubert, J. -M.; Colinet, C.; Rodrigues, G.; Suzuki, P. A.; Nunes, C. A.; Coelho, G. C.; Tedenac, J. -C
Fonte: ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE; SAN DIEGO Publicador: ACADEMIC PRESS INC ELSEVIER SCIENCE; SAN DIEGO
Tipo: Artigo de Revista Científica
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The solid solution based on Nb5Si3 (Cr5B3 structure type, D8(l), tl32, 14/mcm, No140, a=6.5767 angstrom, c=11.8967 angstrom) in the Nb-Si-B system was studied from the structural and thermodynamic point of view both experimentally and by ab initio calculations. Rietveld refinement of powder X-ray synchrotron data allowed to determine the boron to silicon substitution mechanism and the structural parameters. Ab initio calculations of different ordered compounds and selected disordered alloys allowed to obtain in addition to the enthalpy of formation of the solution, substitution mechanism and structural parameters which are in excellent agreement with the experimental data. The stability of the phase is discussed. (C) 2012 Elsevier Inc. All rights reserved.; Brazilian Synchrotron Light Laboratory (LNLS); Brazilian Synchrotron Light Laboratory (LNLS) [D12A-XRD1-1697]; FAPESP agency [1997/06348-4]; FAPESP Agency

Aplicação de uma nova proposta de discretização das equações Griffin-Wheeler-Hartree-Fock na geração de bases Gaussianas para cálculos de átomos e moléculas; Aplication of a new proposal for the discretization of the Griffin-Wheeler-Hartree-Fock equations in the generation of Gaussian leases for atomic and molecular calculations

Reis, Carlos Alberto Gonçalves
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 28/08/2009 PT
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A evolução continua dos computadores levou a várias modificações na maneira de fazer ciência, fazendo surgir uma infinidade de novas opções para resolvermos problemas científicos. A implementação computacional de métodos teóricos possibilitou a tratamento de sistemas grandes, complexos e em diferentes áreas da ciência.Uma área particularmente em destaque e a química de moléculas, atualmente podemos descrever sistemas moleculares relativamente complexos com extrema precisão. Os métodos teóricos em química molecular podem ser divididos basicamente em métodos clássicos ou quânticos, dependendo do que queremos estudar, podemos também utilizar métodos híbridos ou seqüenciais, contudo para uma descrição detalhada da estrutura eletrônica e de ligações químicas é necessária a utilização de métodos quânticos.Cálculos ab initio da estrutura eletrônica de átomos e especialmente moléculas foram realizados pela primeira vez utilizando-se o método de expansão de Roothaan na década de cinqüenta. Em 1986, uma versão integral das equações de Griffin-Wheele-Hartree-Fock (GW-HF) foi apresentada na literatura , inspirada no Método da Coordenada Geradora (MCG), introduzido por Griffin e Wheeler na década de cinqüenta. A versão integral das equações de Hartree-Fock foi denominada de Método da Coordenada Geradora Hartree-Fock (MCG-HF)...

Determinação dos diagramas de fases do sistema Fe-Al-Mo cúbico de corpo centrado por cálculos de primeiros princípios; Determination of the phase diagrams of the body-centered cubic system Fe-Al-Mo by first-principles calculations.

Ormeño, Pablo Guillermo Gonzáles
Fonte: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP Publicador: Biblioteca Digitais de Teses e Dissertações da USP
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 24/10/2002 PT
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Os métodos de primeiros princípios dentro da Teoria do Funcional Densidade têm se desenvolvido bastante, devido aos avanços computacionais ocorridos nas últimas décadas. Por outro lado, a Termodinâmica e a Mecânica Estatística têm representado um papel importante na compreenssão da Física de Materiais, em especial no estudo dos materiais intermetálicos ordenados. A aliança entre estas duas abordagens têm se tornado cada vez mais factível, uma vez que os cálculos de estrutura eletrônica de primeiros princípios são hoje capazes de proporcionar resultados extremamente precisos para energias de formação de compostos estequiométricos. É dentro deste contexto que neste trabalho investigamos o diagrama de fases composição-temperatura do sistema Fe-Al-Mo, na estrutura cúbica de corpo centrado utilizando o método Full-Potential Linear Augmented Plane Wave (FP-LAPW) aliado ao Método Variacional de Clusters (CVM) na aproximação do tetraedro irregular. Através do método FP-LAPW determinamos a energia total de configurações cristalinas do sistema Fe-Mo-Al cúbico de corpo centrado. Estes valores são utilizados como parâmetros de entrada do CVM para determinação do potencial termodinâmico do sistema em suas diferentes fases e os correspondentes equilíbrio entre estas fases em função da composição e da temperatura...

Gaussian basis sets by generator coordinate Hartree-Fock method to ab initio calculations of electron affinities of enolates

Savedra, RML; Pinheiro, J. C.; Treu, O.; Kondo, R. T.
Fonte: Elsevier B.V. Publicador: Elsevier B.V.
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: 9-17
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The Generator Coordinate Hartree-Fock (GCHF) method is employed to generate uncontracted 15s and 18s11p gaussian basis sets for the H, C and O atoms, respectively. These basis sets are then contracted to 3s and 4s H atom and 6s5p, for C and O atoms by a standard procedure. For quality evaluation of contracted basis sets in molecular calculations, we have accomplished calculations of total and orbital energies in the Hartree-Fock-Roothaaii (HFR) approach for CH, C(2) and CO molecules. The results obtained with the uncontracted basis sets are compared with values obtained with the standard D95, 6-311G basis sets and with values reported in the literature. The 4s and 6s5p basis sets are enriched with polarization and diffuse functions for atoms of the parent neutral systems and of the enolates anions (cycloheptanone enolate, 2,5-dimethyleyelopentanone enolate, 4-heptanone enolate, and di-isopropyl ketone enolate) from the literature, in order to assess their performance in ab initio molecular calculations, and applied for calculations of electron affinities of the enolates. The calculations were performed at the DFT (BLYP and B3LYP) and HF levels and compared with the corresponding experimental values and with those obtained by using other 6-3 1 + +G((*)) and 6-311 + +G((*)) basis sets from literature. For the enolates studied...

Ab Initio Correlated All Electron Dirac-Fock Calculations for Eka-Francium Fluoride (E119F)

Miranda, Patricia S.; Mendes, Anna Paula S.; Gomes, Jose S.; Alves, Claudio N.; de Souza, Aguinaldo R.; Sambrano, Julio R.; Gargano, Ricardo; de Macedo, Luiz Guilherme M.
Fonte: Soc Brasileira Quimica Publicador: Soc Brasileira Quimica
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: 1104-1113
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Fundação de Amparo à Pesquisa do Estado de São Paulo (FAPESP); Conselho Nacional de Desenvolvimento Científico e Tecnológico (CNPq); Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES); Processo FAPESP: 06/54976-5; Processo FAPESP: 94/2009; Results obtained with correlated 4-component Dirac-Fock calculations for element E119 (eka-francium) fluoride with stable and accurate basis set (prolapse-free) are reported in this work. At CCSD(T) level, the equilibrium distance R-e, harmonic frequency omega(e) and dissociation energy D-e are 2.432 angstrom, 354.97 cm(-1) and 116.92 kcal mol(-1), respectively. A 4-component prolapse free basis set for E119, an accurate analytical potential energy curve and vibrational spectra from CCSD(T) data are also reported. Our results suggest that E119F should be less ionic than lighter alkaline fluoride homologues, in contrast to the common chemical belief based on periodic trends - it would be expected in this molecule the most ionic bond possible. We also found that the charge model correction to neglect SS integrals leads to negligible errors and speed up calculations close to three times at CCSD(T) level and close to 4 times at DFT/B3LYP level.

Distributed generation modelling for unbalanced three-phase power flow calculations in smart grids

Gallego, Luis A.; Carreno, Edgar; Padilha-Feltrin, Antonio
Fonte: Universidade Estadual Paulista Publicador: Universidade Estadual Paulista
Tipo: Conferência ou Objeto de Conferência Formato: 323-328
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Distributed Generators (DG) are generally modeled as PQ or PV buses in power flow studies. But in order to integrate DG units into the distribution systems and control the reactive power injection it is necessary to know the operation mode and the type of connection to the system. This paper presents a single-phase and a three-phase mathematical model to integrate DG in power flow calculations in distribution systems, especially suited for Smart Grid calculations. If the DG is in PV mode, each step of the power flow algorithm calculates the reactive power injection from the DG to the system to keep the voltage in the bus in a predefined level, if the DG is in PQ mode, the power injection is considered as a negative load. The method is tested on two well known test system, presenting single-phase results on 85 bus system, and three-phase results in the IEEE 34 bus test system. © 2011 IEEE.

Analise conformacional por RMN, IV e calculos teoricos : acetonas 1-monossubstituidas e 1, 1-dissubstituidas; Conformational analysis of 1-monosubstited and 1, 1-disubstituided acetones by NMR, IR and theoretical calculations

Telma Rie Doi
Fonte: Biblioteca Digital da Unicamp Publicador: Biblioteca Digital da Unicamp
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 10/06/2005 PT
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Estudou-se o equilíbrio conformacional de acetonas 1-monossubstituídas e 1,1-dissubstituídas por RMN, IV e cálculos teóricos. Os resultados que foram obtidos para as acetonas 1-halossubstituídas (cloro-, bromo-, e iodoacetona) mostraram a existência de dois rotâmeros mais estáveis, em todos os casos: cis e gauche, que foram previstos pelos cálculos teóricos e observados experimentalmente. O estudo conformacional realizado em cima das constantes de acoplamento JCH indicou que a população dos rotâmeros variava de acordo com a polaridade do solvente, sendo o rotâmero gauche predominante em solventes apolares e o cis predominante em solventes polares. Para as haloacetonas, as diferenças de energia entre os rotâmeros, calculadas e experimentais, mostraram uma boa correlação. O estudo do isomerismo rotacional das demais acetonas mostrou que o comportamento da constante de acoplamento JCH sofre variação com a conformação molecular, como havia sido observado para as haloacetonas, somente para a metoxiacetona e 1,1-dicloroacetona. Essa constante, portanto, só pôde ser empregada no estudo conformacional dessas duas acetonas. Para a metoxiacetona, os rotâmeros mais estáveis são o trans e o cis, sendo que a variação de JCH é devido aos sub-rotâmeros trans. Já para a 1...

Estudos estruturais de agonistas de acetilcolina pela espectroscopia de RMN e calculos teoricos; Structural studies of acetylcholine agonists by NMR spectroscopy and theoretical calculations

Julio Cesar Araujo da Silva
Fonte: Biblioteca Digital da Unicamp Publicador: Biblioteca Digital da Unicamp
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 13/02/2008 PT
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Neste trabalho é apresentado o estudo conformacional dos agonistas muscarinicos da acetilcolina (ACh+): carbacol, metacolina e pilocarpina. O estudo baseou-se na análise das constantes de acoplamento 3JHH e nos dados obtidos pelos cálculos teóricos ab initio. O comportamento conformacional destes compostos é descrito principalmente por apenas dois dos seus ângulos diedros. Os resultados dos cálculos teóricos realizados com o nível teórico B3LYP/6- 311+G(d,p), bem como os dados experimentais, apontaram a conformação gauche como a predominante para todos os compostos estudados para o diedro responsável pela atividade farmacológica dos agonistas independente do solvente utilizado. Atribui-se a estabilização da forma gauche a interação eletrostática entre o atomo de nitrogênio positivamente carregado e o átomo de oxigênio da porção éster (OCH2). Os cálculos teóricos mostraram que os conformeros mais estáveis possuem uma distância N+/O menor. Em adição, estudos de NBO mostraram a importância das interações hiperconjugativas sC5H5 s* C6N7 e sC5H5s* O4C5 na maior estabilização dos conformeros gauche. Os conformeros mais estáveis para cada composto sao: aceticolina, TG-; carbacol, AG+; metacolina, TG+; pilocarpina...

Adapatação de métodos de estrutura eletrônica em cálculos de propriedades de ressonância magnética nuclear e barreiras de rotação interna; Adaptation of electronic structure methods in calculations of nuclear magnetic resonance properties and internal rotation barriers

Lucas Colucci Ducati
Fonte: Biblioteca Digital da Unicamp Publicador: Biblioteca Digital da Unicamp
Tipo: Tese de Doutorado Formato: application/pdf
Publicado em 01/10/2010 PT
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A avaliação de funcionais de densidade no cálculo de constante de acoplamento spi-spin, mostrou que o funcional híbrido meio a meio BHandH apresenta precisão similar aos métodos ab initio, como SOPPA(CCSD) e LR-CCSD. A variação E nos funcionais testados melhorou a precisão das constantes de acoplamento spin-spin para a maioria dos casos, sendo que a inclusão de 50% de E no funcional B98 levou aos valores mais precisos. A otimização da função de base Huz-IIIsu3-J para o P em relação à constante de acoplamento, energia e vetor campo elétrico nos núcleos, apresentou a mesma precisão em relação à base original para todos os tipos de acoplamento JPH, JPC e JPP avaliados. Entretanto, a precisão da nova base de P se mostrou superior para os acoplamentos JPC e principalmente para JPP. Os métodos G3 e G3CEP usados para determinar as barreiras de rotação de algumas moléculas simples (H2O2, H2S2, N2H4, H3COH, H3CNH2 e C2H6) apresentaram desvios menores que 0,53 kcal mol e 0,86 kcal mol, com respeito aos dados experimentais e que são similares ao desvios obtidos em níveis teóricos como CCSD(T)/aug-cc-pVTZ. As componentes G3 e G3CEP mostraram que a energia MP4/6-31G(d) ou MP4/CEP- 31G(d) é refinada de acordo com a sequência: DEG3Large > DE2df...

O modelo de Uhlenbeck-Ford e cálculos de energia livre de sistemas na fase fluida; The Uhlenbeck-Ford model and free-energy calculations for fluid phase systems

Rodolfo Paula Leite
Fonte: Biblioteca Digital da Unicamp Publicador: Biblioteca Digital da Unicamp
Tipo: Dissertação de Mestrado Formato: application/pdf
Publicado em 26/06/2015 PT
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36.22%
Neste trabalho, apresentamos um estudo a respeito do modelo de Uhlenbeck-Ford como um sistema de referencia para calculos de energia livre de sistemas na fase fluida, utilizando metodos de simulacao molecular. Este sistema artificial, que e caracterizado por um potencial puramente repulsivo e que diverge rapidamente, foi originalmente proposto como um modelo para o estudo teorico de gases imperfeitos. Este modelo foi motivado pelo fato de que todas as integrais de muitos corpos, envolvidas no calculo dos coeficientes viriais, podem ser facilmente calculadas analiticamente. Entretanto apenas oito coeficientes eram conhecidos. Dois novos coeficientes (..10 e ..11) foram determinados para o modelo neste trabalho, alem de uma expressao essencialmente exata para a equacao de estado e energia livre de Helmholtz em funcao de um parametro adimensional. Este nos permitira reunir todas as informacoes a respeito da energia livre do sistema em uma unica expressao, independentemente da escolha de parametros do potencial. Por fim, exploraremos a aplicabilidade deste modelo como um sistema de referencia para calculos de energia livre de sistemas na fase fluida, usando tecnicas de simulacao molecular a partir de processos fora de equilibrio. Nossos resultados para o fluido de Lennard-Jones e para o silicio liquido...

Semiempirical and ab initio calculations versus dynamic NMR on conformational analysis of cyclohexyl-N,N-dimethylcarbamate

Basso,Ernani A.; Oliveira,Paulo R.; Caetano,Josiane; Schuquel,Ivânia T. A.
Fonte: Sociedade Brasileira de Química Publicador: Sociedade Brasileira de Química
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/04/2001 EN
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Axial-equatorial conformational proportions for cyclohexyl-N,N-dimethyl carbamate have been measured, for the first time, by the Eliel method, ¹H and 13C dynamic nuclear magnetic resonance (DNMR). The results were compared against those determined by theoretical calculations. By the Eliel method at least five experimentally independent measureables were used in CCl4, CDCl3 and CD3CN. The ¹H and 13C low temperature experiments were performed in CF2Br2/CD2Cl2 . Semiempirical methods MNDO, AM1 and PM3 and ab initio molecular orbital calculations at the HF/STO-3G and HF/6-31G(d,p) levels have been performed on the axial and equatorial conformers populations. All applied methods correctly predict the equatorial conformer preference over the axial one. The resulting equatorial preferences determined by NMR data and theoretical calculations are in good agreement.

Ab Initio correlated all electron Dirac-Fock calculations for eka-francium fluoride (E119F)

Miranda,Patrícia S.; Mendes,Anna Paula S.; Gomes,Jose S.; Alves,Claudio N.; Souza,Aguinaldo R. de; Sambrano,Julio R.; Gargano,Ricardo; Macedo,Luiz Guilherme M. de
Fonte: Sociedade Brasileira de Química Publicador: Sociedade Brasileira de Química
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/06/2012 EN
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Results obtained with correlated 4-component Dirac-Fock calculations for element E119 (eka-francium) fluoride with stable and accurate basis set (prolapse-free) are reported in this work. At CCSD(T) level, the equilibrium distance Re, harmonic frequency ωe and dissociation energy De are 2.432 Å, 354.97 cm-1 and 116.92 kcal mol-1, respectively. A 4-component prolapse free basis set for E119, an accurate analytical potential energy curve and vibrational spectra from CCSD(T) data are also reported. Our results suggest that E119F should be less ionic than lighter alkaline fluoride homologues, in contrast to the common chemical belief based on periodic trends - it would be expected in this molecule the most ionic bond possible. We also found that the charge model correction to neglect SS integrals leads to negligible errors and speed up calculations close to three times at CCSD(T) level and close to 4 times at DFT/B3LYP level.

Tautomerism in quinoxalines derived from the 1,4-naphthoquinone nucleus: acid mediated synthesis, X-ray molecular structure of 5-chlorobenzo[f]quinoxalin-6-ol and density functional theory calculations

Gomez,Javier A. G.; Lage,Mateus R.; Carneiro,José Walkimar de M.; Resende,Jackson A. L. C.; Vargas,Maria D.
Fonte: Sociedade Brasileira de Química Publicador: Sociedade Brasileira de Química
Tipo: Artigo de Revista Científica Formato: text/html
Publicado em 01/02/2013 EN
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The reaction of tert-butyl 2-(3-chloro-1,4-dioxo-1,4-dihydronaphthalen-2-ylamino) ethylcarbamate with CF3COOH/CH2Cl2 yields 5-chloro-3,4-dihydrobenzo[f]quinoxalin6(2H)-one which undergoes acid-promoted dehydrogenation in the presence of water to give novel 5-chlorobenzo[f]quinoxalin-6-ol. The molecular structure of 5-chlorobenzo[f]quinoxalin6-ol in the solid state, determined by an X-ray diffraction (XRD) study, and the solution data confirm that it exists as the enol-imine tautomer, both in the solid state and in solution, differently from 5-chloro-3,4-dihydrobenzo[f]quinoxalin-6(2H)-one, which exhibits the keto-amine arrangement. Density functional theory (DFT) calculations confirmed the preference of 5-chlorobenzo[f]quinoxalin-6-ol and of the derivatives containing H and CH3 groups in place of the Cl atom for the enol-imine tautomer. It is suggested that the enol-imine structure is preferred for 5-chlorobenzo[f]quinoxalin-6-ol as a consequence of the higher aromatic character of this structure in comparison with the keto-amine form. DFT calculations carried out on the two tautomers of the benzo[a]phenazin-5(7H)-ones analogous to the benzo[f]quinoxalin-6(4H)-ones showed that the relative stabilities are dominated by solvation effects in the first case and the degree of aromaticity...

Accelerating Resolution-of-the-Identity Second Order Møller-Plesset Quantum Chemistry Calculations with Graphical Processing Units

Vogt, Leslie Ann; Olivares-Amaya, Roberto; Kermes, Sean; Shao, Yihan; Amador-Bedolla, Carlos; Aspuru-Guzik, Alan
Fonte: American Chemical Society Publicador: American Chemical Society
Tipo: Artigo de Revista Científica
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The modification of a general purpose code for quantum mechanical calculations of molecular properties (Q-Chem) to use a graphical processing unit (GPU) is reported. A 4.3x speedup of the resolution-of-the-identity second-order Møller−Plesset perturbation theory (RI-MP2) execution time is observed in single point energy calculations of linear alkanes. The code modification is accomplished using the compute unified basic linear algebra subprograms (CUBLAS) library for an NVIDIA Quadro FX 5600 graphics card. Furthermore, speedups of other matrix algebra based electronic structure calculations are anticipated as a result of using a similar approach.; Chemistry and Chemical Biology

Estudo da estrutura cristalina do fármaco lamivudina e seus derivados através de RMN no estado sólido e cálculos teóricos; Study of the crystalline structure of the drug lamivudine and its derivates by solid-state NMR and theoretical calculations

Ferreira, Vinicius Sousa
Fonte: Universidade Federal de Goiás; Brasil; UFG; Programa de Pós-graduação em Química (IQ); Instituto de Química - IQ (RG) Publicador: Universidade Federal de Goiás; Brasil; UFG; Programa de Pós-graduação em Química (IQ); Instituto de Química - IQ (RG)
Tipo: Dissertação Formato: application/pdf
POR
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36.31%
Solid dosage forms are the most widespread among pharmacists, due to its ease of handling and high adherence by patients, leading the growth of structural studies of drugs in this state. The technique of solid state NMR has gained increasingly space in analysis of drugs combined with other techniques, such as X- ray diffraction and infrared spectroscopy, besides having different types of computations as tools to aid structural characterization. The objective of this work is the characterization of the structure of the drug Lamivudine in its different forms via technique of nuclear magnetic resonance in the solid state with the aid of computer calculations as a confirmatory tool. The drug lamivudine, salicylate and biphthalate lamivudine salts prepared from lamivudine form II were characterized by X-ray diffraction (XRD) spectroscopy, mid-infrared (FITR), nuclear magnetic resonance solution (1H NMR and 13C {1 H}) and solid (CPMAS 13C NMR e15N), and the use of theoretical calculations of GIAO type by computer program GAUSSIAN and GIPAW by CASTEP program, for a relevant structure unambiguous assignment of NMR signals and confirmation of information of crystalline structure. The data obtained from experimental analysis were consistent with the structure of lamivudine and the results of theoretical calculations. The results were arranged in tables...

Exact, Born–Oppenheimer, and quantum-chemistry-like calculations in helium clusters doped with light molecules: The He2N2(X) system

Roncero, Octavio; Lara Castells, M. Pilar de; Delgado Barrio, Gerardo; Villarreal, Pablo; Stoecklin, T.; Voronin, A.; Rayez, J. C.
Fonte: American Institute of Physics Publicador: American Institute of Physics
Tipo: Artículo Formato: 418732 bytes; application/pdf
ENG
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36.22%
9 pages, 2 figures, 4 tables.-- PACS nrs.: 34.20.-b; 31.50.-x; 31.15.A-; 33.15.Mt; 33.20.Vq; 36.40.-c.; Helium clusters doped with diatomic molecules, He(N)–BC, have been recently studied by means of a quantum-chemistry-like approach. The model treats He atoms as “electrons” and dopants as “nuclei” in standard electronic structure calculations. Due to the large mass difference between He atoms and electrons, and to the replacement of Coulomb interactions by intermolecular potentials, it is worth assessing up to what extent are the approximations involved in this model, i.e., decoupling of the BC rotation from the He-atom orbital angular momenta and Born–Oppenheimer separation of the BC stretch versus the He motions, accurate enough. These issues have been previously tackled elsewhere for the 4He2–Br2(X) system, which contains a heavy dopant [Roncero et al., Int. J. Quantum Chem. 107, 2756 (2007)]. Here, we consider a similar cluster but with a much lighter dopant such as N2(X). Although the model does not provide the correct energy levels for the cluster, positions and intensities of the main detectable lines of the vibrotational Raman spectrum at low temperature are accurately reproduced.; This work has been partially supported by the DGICYT Spanish Grant Nos. FIS2007-62006 and CTQ2004-02415/BQU. M.P.de L.-C. acknowledges the support of a MEC-CSIC Spanish Grant No. 2007501004. The calculations presented here were performed at Centro de Cálculo of IMAFF (CSIC).; Peer reviewed